RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 FAM69CQ0P6D2 419 aa34.88■■■■□ 3.17
HOXD12-201ENST00000404162 ABCC10Q5T3U5 1492 aa34.84■■■■□ 3.17
HOXD12-201ENST00000404162 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP34.79■■■■□ 3.16
HOXD12-201ENST00000404162 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa34.76■■■■□ 3.16
HOXD12-201ENST00000404162 MAPKBP1O60336 1514 aa34.74■■■■□ 3.15
HOXD12-201ENST00000404162 DIP2BQ9P265 1576 aa34.74■■■■□ 3.15
HOXD12-201ENST00000404162 ADCY10Q96PN6 1610 aa34.7■■■■□ 3.14
HOXD12-201ENST00000404162 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa34.66■■■■□ 3.14
HOXD12-201ENST00000404162 KDM6BO15054 1643 aa34.62■■■■□ 3.13
HOXD12-201ENST00000404162 TSPOAP1O95153 1857 aa34.56■■■■□ 3.12
HOXD12-201ENST00000404162 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa34.52■■■■□ 3.12
HOXD12-201ENST00000404162 IGF1RP08069 1367 aa34.43■■■■□ 3.1
HOXD12-201ENST00000404162 PTPRGP23470 1445 aa34.36■■■■□ 3.09
HOXD12-201ENST00000404162 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP34.35■■■■□ 3.09
HOXD12-201ENST00000404162 CUL7Q14999 1698 aa34.33■■■■□ 3.09
HOXD12-201ENST00000404162 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP34.32■■■■□ 3.08
HOXD12-201ENST00000404162 KIF27Q86VH2 1401 aa34.3■■■■□ 3.08
HOXD12-201ENST00000404162 ABCC2Q92887 1545 aa34.25■■■■□ 3.07
HOXD12-201ENST00000404162 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP34.24■■■■□ 3.07
HOXD12-201ENST00000404162 ASXL2Q76L83 1435 aa34.22■■■■□ 3.07
HOXD12-201ENST00000404162 TNIKQ9UKE5 1360 aa34.22■■■■□ 3.07
HOXD12-201ENST00000404162 GLI2P10070 1586 aa34.19■■■■□ 3.06
HOXD12-201ENST00000404162 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa34.18■■■■□ 3.06
HOXD12-201ENST00000404162 PLB1Q6P1J6 1458 aa34.18■■■■□ 3.06
HOXD12-201ENST00000404162 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa34.17■■■■□ 3.06
HOXD12-201ENST00000404162 ADGRL1O94910 1474 aa34.15■■■■□ 3.06
HOXD12-201ENST00000404162 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa34.1■■■■□ 3.05
HOXD12-201ENST00000404162 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP34.1■■■■□ 3.05
HOXD12-201ENST00000404162 IQGAP2Q13576 1575 aa34.07■■■■□ 3.05
HOXD12-201ENST00000404162 UACAQ9BZF9 1416 aa34.06■■■■□ 3.04
HOXD12-201ENST00000404162 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP34.01■■■■□ 3.04
HOXD12-201ENST00000404162 DISP1Q96F81 1524 aa34.01■■■■□ 3.04
HOXD12-201ENST00000404162 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa33.99■■■■□ 3.03
HOXD12-201ENST00000404162 KDM5BQ9UGL1 1544 aa33.97■■■■□ 3.03
HOXD12-201ENST00000404162 HECW2Q9P2P5 1572 aa33.92■■■■□ 3.02
HOXD12-201ENST00000404162 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP33.9■■■■□ 3.02
HOXD12-201ENST00000404162 TEX14Q8IWB6 1497 aa33.9■■■■□ 3.02
HOXD12-201ENST00000404162 UGGT2Q9NYU1 1516 aa33.84■■■■□ 3.01
HOXD12-201ENST00000404162 KIAA0556O60303 1618 aa33.79■■■■□ 3
HOXD12-201ENST00000404162 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa33.76■■■□□ 2.99
HOXD12-201ENST00000404162 WDR7Q9Y4E6 1490 aa33.75■■■□□ 2.99
HOXD12-201ENST00000404162 CD109Q6YHK3 1445 aa33.65■■■□□ 2.98
HOXD12-201ENST00000404162 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa33.63■■■□□ 2.97
HOXD12-201ENST00000404162 KCNH8Q96L42 1107 aa33.63■■■□□ 2.97
HOXD12-201ENST00000404162 CFAP43Q8NDM7 1665 aa33.61■■■□□ 2.97
HOXD12-201ENST00000404162 ABCA8O94911 1581 aa33.54■■■□□ 2.96
HOXD12-201ENST00000404162 KIF21BO75037 1637 aa33.53■■■□□ 2.96
HOXD12-201ENST00000404162 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa33.52■■■□□ 2.96
HOXD12-201ENST00000404162 GOLGA3Q08378 1498 aa33.47■■■□□ 2.95
HOXD12-201ENST00000404162 ARAP3Q8WWN8 1544 aa33.39■■■□□ 2.94
HOXD12-201ENST00000404162 FBXO41Q8TF61 875 aa33.39■■■□□ 2.94
HOXD12-201ENST00000404162 ARID3CA6NKF2 412 aa33.35■■■□□ 2.93
HOXD12-201ENST00000404162 ATP10BO94823 1461 aa33.29■■■□□ 2.92
HOXD12-201ENST00000404162 PTPRMP28827 1452 aa33.29■■■□□ 2.92
HOXD12-201ENST00000404162 ADAMTSL3P82987 1691 aa33.29■■■□□ 2.92
HOXD12-201ENST00000404162 P3H3Q8IVL6 736 aa33.25■■■□□ 2.91
HOXD12-201ENST00000404162 PRXQ9BXM0 1461 aa33.24■■■□□ 2.91
HOXD12-201ENST00000404162 RAPGEF3O95398 923 aa33.23■■■□□ 2.91
HOXD12-201ENST00000404162 ABCA9Q8IUA7 1624 aa33.22■■■□□ 2.91
HOXD12-201ENST00000404162 PHLDB1Q86UU1 1377 aa33.21■■■□□ 2.91
HOXD12-201ENST00000404162 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP33.16■■■□□ 2.9
HOXD12-201ENST00000404162 BCORL1Q5H9F3 1711 aa33.14■■■□□ 2.89
HOXD12-201ENST00000404162 NEO1Q92859 1461 aa33.12■■■□□ 2.89
HOXD12-201ENST00000404162 MADDQ8WXG6 1647 aa33.1■■■□□ 2.89
HOXD12-201ENST00000404162 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa33.09■■■□□ 2.89
HOXD12-201ENST00000404162 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP33.09■■■□□ 2.89
HOXD12-201ENST00000404162 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP33.08■■■□□ 2.89
HOXD12-201ENST00000404162 LMTK3Q96Q04 1460 aa33.05■■■□□ 2.88
HOXD12-201ENST00000404162 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP33.04■■■□□ 2.88
HOXD12-201ENST00000404162 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP33.04■■■□□ 2.88
HOXD12-201ENST00000404162 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa33.03■■■□□ 2.88
HOXD12-201ENST00000404162 SAMD9Q5K651 1589 aa33■■■□□ 2.87
HOXD12-201ENST00000404162 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP32.97■■■□□ 2.87
HOXD12-201ENST00000404162 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP32.92■■■□□ 2.86
HOXD12-201ENST00000404162 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa32.92■■■□□ 2.86
HOXD12-201ENST00000404162 HSPA2P54652 639 aa32.91■■■□□ 2.86
HOXD12-201ENST00000404162 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP32.9■■■□□ 2.86
HOXD12-201ENST00000404162 RICTORQ6R327 1708 aa32.9■■■□□ 2.86
HOXD12-201ENST00000404162 PLPPR3Q6T4P5 718 aa32.88■■■□□ 2.85
HOXD12-201ENST00000404162 AKNAQ7Z591 1439 aa32.86■■■□□ 2.85
HOXD12-201ENST00000404162 FHOD3Q2V2M9 1422 aa32.84■■■□□ 2.85
HOXD12-201ENST00000404162 CSRNP3Q8WYN3 585 aa32.83■■■□□ 2.85
HOXD12-201ENST00000404162 PLEKHD1A6NEE1 506 aa32.82■■■□□ 2.84
HOXD12-201ENST00000404162 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP32.82■■■□□ 2.84
HOXD12-201ENST00000404162 FANCAO15360 1455 aa32.8■■■□□ 2.84
HOXD12-201ENST00000404162 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa32.8■■■□□ 2.84
HOXD12-201ENST00000404162 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP32.77■■■□□ 2.84
HOXD12-201ENST00000404162 YEATS2Q9ULM3 1422 aa32.77■■■□□ 2.84
HOXD12-201ENST00000404162 POGZQ7Z3K3 1410 aa32.76■■■□□ 2.83
HOXD12-201ENST00000404162 CERKQ8TCT0 537 aa32.75■■■□□ 2.83
HOXD12-201ENST00000404162 CFAP74Q9C0B2 1584 aa32.75■■■□□ 2.83
HOXD12-201ENST00000404162 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa32.74■■■□□ 2.83
HOXD12-201ENST00000404162 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa32.72■■■□□ 2.83
HOXD12-201ENST00000404162 MLECQ14165 292 aa32.72■■■□□ 2.83
HOXD12-201ENST00000404162 TTC37Q6PGP7 1564 aa32.7■■■□□ 2.83
HOXD12-201ENST00000404162 EFCAB5A4FU69 1503 aa32.7■■■□□ 2.83
HOXD12-201ENST00000404162 HECW1Q76N89 1606 aa32.66■■■□□ 2.82
HOXD12-201ENST00000404162 MAGI2Q86UL8 1455 aa32.65■■■□□ 2.82
HOXD12-201ENST00000404162 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa32.65■■■□□ 2.82
HOXD12-201ENST00000404162 SCAPERQ9BY12 1400 aa32.6■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11 ms