RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403848.2

RPL5P20-201, Transcript of ribosomal protein L5 pseudogene 20, humanhuman

BASIC

Gene RPL5P20, Length 896 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL5P20-201ENST00000403848 STAG3Q9UJ98 1225 aa12.19□□□□□ -0.46
RPL5P20-201ENST00000403848 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP12.15□□□□□ -0.46
RPL5P20-201ENST00000403848 CECR2Q9BXF3 1484 aa12.14□□□□□ -0.47
RPL5P20-201ENST00000403848 SMARCA4P51532 1647 aa12.1□□□□□ -0.47
RPL5P20-201ENST00000403848 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
RPL5P20-201ENST00000403848 PHF12Q96QT6 1004 aa12.09□□□□□ -0.47
RPL5P20-201ENST00000403848 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
RPL5P20-201ENST00000403848 MROH2BQ7Z745 1585 aa12.05□□□□□ -0.48
RPL5P20-201ENST00000403848 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP12.04□□□□□ -0.48
RPL5P20-201ENST00000403848 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP12.02□□□□□ -0.49
RPL5P20-201ENST00000403848 POTEB2H3BUK9 544 aa12□□□□□ -0.49
RPL5P20-201ENST00000403848 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
RPL5P20-201ENST00000403848 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP11.98□□□□□ -0.49
RPL5P20-201ENST00000403848 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa11.97□□□□□ -0.49
RPL5P20-201ENST00000403848 PEG3Q9GZU2 1588 aa11.97□□□□□ -0.49
RPL5P20-201ENST00000403848 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
RPL5P20-201ENST00000403848 OTUD5Q96G74 571 aa11.97□□□□□ -0.49
RPL5P20-201ENST00000403848 PROM2Q8N271 834 aa11.96□□□□□ -0.49
RPL5P20-201ENST00000403848 WIZO95785 1651 aa11.95□□□□□ -0.5
RPL5P20-201ENST00000403848 SMARCA2P51531 1590 aa11.92□□□□□ -0.5
RPL5P20-201ENST00000403848 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa11.92□□□□□ -0.5
RPL5P20-201ENST00000403848 MS4A3Q96HJ5 214 aa11.89□□□□□ -0.51
RPL5P20-201ENST00000403848 PLSCR2Q9NRY7 297 aa11.88□□□□□ -0.51
RPL5P20-201ENST00000403848 HMGXB3Q12766 1538 aa11.87□□□□□ -0.51
RPL5P20-201ENST00000403848 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
RPL5P20-201ENST00000403848 NCAPD3P42695 1498 aa11.85□□□□□ -0.51
RPL5P20-201ENST00000403848 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
RPL5P20-201ENST00000403848 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
RPL5P20-201ENST00000403848 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
RPL5P20-201ENST00000403848 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
RPL5P20-201ENST00000403848 MIER1Q8N108 512 aa11.82□□□□□ -0.52
RPL5P20-201ENST00000403848 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
RPL5P20-201ENST00000403848 POTEJP0CG39 1038 aa11.8□□□□□ -0.52
RPL5P20-201ENST00000403848 TRIM41Q8WV44 630 aa11.8□□□□□ -0.52
RPL5P20-201ENST00000403848 METRNQ9UJH8 293 aa11.8□□□□□ -0.52
RPL5P20-201ENST00000403848 FKBP8Q14318 412 aa11.79□□□□□ -0.52
RPL5P20-201ENST00000403848 CCDC61Q9Y6R9 512 aa11.77□□□□□ -0.53
RPL5P20-201ENST00000403848 C7P10643 843 aa11.75□□□□□ -0.53
RPL5P20-201ENST00000403848 SLC39A7Q92504 469 aa11.74□□□□□ -0.53
RPL5P20-201ENST00000403848 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
RPL5P20-201ENST00000403848 KIF12Q96FN5 646 aa11.73□□□□□ -0.53
RPL5P20-201ENST00000403848 POTEMA6NI47 508 aa11.72□□□□□ -0.53
RPL5P20-201ENST00000403848 TRPC6Q9Y210 931 aa11.71□□□□□ -0.53
RPL5P20-201ENST00000403848 PLCD3Q8N3E9 789 aa11.7□□□□□ -0.54
RPL5P20-201ENST00000403848 POTEGQ6S5H5 508 aa11.69□□□□□ -0.54
RPL5P20-201ENST00000403848 RASEFQ8IZ41 740 aa11.69□□□□□ -0.54
RPL5P20-201ENST00000403848 MAP3K13O43283 966 aa11.67□□□□□ -0.54
RPL5P20-201ENST00000403848 PLEKHG5O94827 1062 aa11.67□□□□□ -0.54
RPL5P20-201ENST00000403848 CCDC88BA6NC98 1476 aa11.66□□□□□ -0.54
RPL5P20-201ENST00000403848 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
RPL5P20-201ENST00000403848 POTEFA5A3E0 1075 aa11.64□□□□□ -0.55
RPL5P20-201ENST00000403848 MAMSTRQ6ZN01 415 aa11.6□□□□□ -0.55
RPL5P20-201ENST00000403848 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP11.57□□□□□ -0.56
RPL5P20-201ENST00000403848 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP11.57□□□□□ -0.56
RPL5P20-201ENST00000403848 PRDM2Q13029 1718 aa11.56□□□□□ -0.56
RPL5P20-201ENST00000403848 TIE1P35590 1138 aa11.55□□□□□ -0.56
RPL5P20-201ENST00000403848 NUBP1P53384 320 aa11.55□□□□□ -0.56
RPL5P20-201ENST00000403848 SCUBE2Q9NQ36 999 aa11.55□□□□□ -0.56
RPL5P20-201ENST00000403848 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
RPL5P20-201ENST00000403848 TTLL13PA6NNM8 815 aa11.54□□□□□ -0.56
RPL5P20-201ENST00000403848 CFTRP13569 1480 aa11.52□□□□□ -0.56
RPL5P20-201ENST00000403848 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa11.52□□□□□ -0.57
RPL5P20-201ENST00000403848 NESP48681 1621 aa11.52□□□□□ -0.57
RPL5P20-201ENST00000403848 CADPSQ9ULU8 1353 aa11.5□□□□□ -0.57
RPL5P20-201ENST00000403848 SEC24BO95487 1268 aa11.48□□□□□ -0.57
RPL5P20-201ENST00000403848 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa11.48□□□□□ -0.57
RPL5P20-201ENST00000403848 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
RPL5P20-201ENST00000403848 TRIM35Q9UPQ4 493 aa11.47□□□□□ -0.57
RPL5P20-201ENST00000403848 CUX2O14529 1486 aa11.45□□□□□ -0.58
RPL5P20-201ENST00000403848 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa11.44□□□□□ -0.58
RPL5P20-201ENST00000403848 IFNL1Q8IU54 200 aa11.44□□□□□ -0.58
RPL5P20-201ENST00000403848 PCDH10Q9P2E7 1040 aa11.44□□□□□ -0.58
RPL5P20-201ENST00000403848 DCAF8Q5TAQ9 597 aa11.42□□□□□ -0.58
RPL5P20-201ENST00000403848 SGIP1Q9BQI5 828 aa11.42□□□□□ -0.58
RPL5P20-201ENST00000403848 FAM212AQ96EL1 285 aa11.41□□□□□ -0.58
RPL5P20-201ENST00000403848 FANCD2Q9BXW9 1451 aa11.4□□□□□ -0.58
RPL5P20-201ENST00000403848 FBXO3Q9UK99 471 aa11.4□□□□□ -0.58
RPL5P20-201ENST00000403848 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
RPL5P20-201ENST00000403848 PDS5BQ9NTI5 1447 aa11.38□□□□□ -0.59
RPL5P20-201ENST00000403848 PYGBP11216 843 aa11.38□□□□□ -0.59
RPL5P20-201ENST00000403848 IER5LQ5T953 404 aa11.38□□□□□ -0.59
RPL5P20-201ENST00000403848 TMEM106CQ9BVX2 250 aa11.38□□□□□ -0.59
RPL5P20-201ENST00000403848 CEP164Q9UPV0 1460 aa11.37□□□□□ -0.59
RPL5P20-201ENST00000403848 KLHL34Q8N239 644 aa11.36□□□□□ -0.59
RPL5P20-201ENST00000403848 ABCC8Q09428 1581 aa11.36□□□□□ -0.59
RPL5P20-201ENST00000403848 VASPP50552 380 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
RPL5P20-201ENST00000403848 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
RPL5P20-201ENST00000403848 ERCC6Q03468 1493 aa11.33□□□□□ -0.6
RPL5P20-201ENST00000403848 SLAIN1Q8ND83 568 aa11.32□□□□□ -0.6
RPL5P20-201ENST00000403848 PCDHB8Q9UN66 801 aa11.31□□□□□ -0.6
RPL5P20-201ENST00000403848 SYNJ1O43426 1573 aa11.31□□□□□ -0.6
RPL5P20-201ENST00000403848 CUX1P39880 1505 aa11.3□□□□□ -0.6
RPL5P20-201ENST00000403848 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
RPL5P20-201ENST00000403848 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa11.3□□□□□ -0.6
RPL5P20-201ENST00000403848 MRC2Q9UBG0 1479 aa11.3□□□□□ -0.6
RPL5P20-201ENST00000403848 DNMBPQ6XZF7 1577 aa11.29□□□□□ -0.6
RPL5P20-201ENST00000403848 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP11.28□□□□□ -0.6
RPL5P20-201ENST00000403848 PLCG2P16885 1265 aa11.28□□□□□ -0.6
RPL5P20-201ENST00000403848 WDR62O43379 1518 aa11.28□□□□□ -0.6
RPL5P20-201ENST00000403848 TOP2BQ02880 1626 aa11.27□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.1 ms