RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398123.6

ADD1-204, Transcript of adducin 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ADD1, Length 2,361 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ADD1-204ENST00000398123 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
ADD1-204ENST00000398123 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
ADD1-204ENST00000398123 PCGF6Q9BYE7 350 aa23.34■■□□□ 1.33
ADD1-204ENST00000398123 EFCAB5A4FU69 1503 aa23.33■■□□□ 1.33
ADD1-204ENST00000398123 APLP2Q06481 763 aa23.32■■□□□ 1.32
ADD1-204ENST00000398123 SYNJ2O15056 1496 aa23.3■■□□□ 1.32
ADD1-204ENST00000398123 GRIN2AQ12879 1464 aa23.29■■□□□ 1.32
ADD1-204ENST00000398123 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
ADD1-204ENST00000398123 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
ADD1-204ENST00000398123 IQGAP2Q13576 1575 aa23.23■■□□□ 1.31
ADD1-204ENST00000398123 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa23.21■■□□□ 1.31
ADD1-204ENST00000398123 P3H3Q8IVL6 736 aa23.2■■□□□ 1.3
ADD1-204ENST00000398123 FBLN2P98095 1184 aa23.2■■□□□ 1.3
ADD1-204ENST00000398123 SAMD9Q5K651 1589 aa23.19■■□□□ 1.3
ADD1-204ENST00000398123 FHOD3Q2V2M9 1422 aa23.18■■□□□ 1.3
ADD1-204ENST00000398123 FMN1Q68DA7 1419 aa23.15■■□□□ 1.3
ADD1-204ENST00000398123 UGGT2Q9NYU1 1516 aa23.13■■□□□ 1.29
ADD1-204ENST00000398123 NUP160Q12769 1436 aa23.12■■□□□ 1.29
ADD1-204ENST00000398123 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
ADD1-204ENST00000398123 CEP170Q5SW79 1584 aa23.1■■□□□ 1.29
ADD1-204ENST00000398123 MAP3K1Q13233 1512 aa23.07■■□□□ 1.28
ADD1-204ENST00000398123 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa23.07■■□□□ 1.28
ADD1-204ENST00000398123 FYCO1Q9BQS8 1478 aa23.07■■□□□ 1.28
ADD1-204ENST00000398123 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
ADD1-204ENST00000398123 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
ADD1-204ENST00000398123 TIAM1Q13009 1591 aa23■■□□□ 1.27
ADD1-204ENST00000398123 DISP1Q96F81 1524 aa22.98■■□□□ 1.27
ADD1-204ENST00000398123 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
ADD1-204ENST00000398123 KIAA0556O60303 1618 aa22.98■■□□□ 1.27
ADD1-204ENST00000398123 JPH4Q96JJ6 628 aa22.98■■□□□ 1.27
ADD1-204ENST00000398123 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.96■■□□□ 1.27
ADD1-204ENST00000398123 CHD1O14646 1710 aa22.96■■□□□ 1.27
ADD1-204ENST00000398123 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.92■■□□□ 1.26
ADD1-204ENST00000398123 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.91■■□□□ 1.26
ADD1-204ENST00000398123 HECW1Q76N89 1606 aa22.86■■□□□ 1.25
ADD1-204ENST00000398123 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.85■■□□□ 1.25
ADD1-204ENST00000398123 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
ADD1-204ENST00000398123 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.78■■□□□ 1.24
ADD1-204ENST00000398123 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
ADD1-204ENST00000398123 SHROOM2Q13796 1616 aa22.77■■□□□ 1.24
ADD1-204ENST00000398123 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.76■■□□□ 1.23
ADD1-204ENST00000398123 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
ADD1-204ENST00000398123 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.75■■□□□ 1.23
ADD1-204ENST00000398123 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.74■■□□□ 1.23
ADD1-204ENST00000398123 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.72■■□□□ 1.23
ADD1-204ENST00000398123 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
ADD1-204ENST00000398123 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.7■■□□□ 1.23
ADD1-204ENST00000398123 PTPRGP23470 1445 aa22.7■■□□□ 1.22
ADD1-204ENST00000398123 PLB1Q6P1J6 1458 aa22.69■■□□□ 1.22
ADD1-204ENST00000398123 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.68■■□□□ 1.22
ADD1-204ENST00000398123 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
ADD1-204ENST00000398123 HRCP23327 699 aa22.67■■□□□ 1.22
ADD1-204ENST00000398123 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
ADD1-204ENST00000398123 ABCA8O94911 1581 aa22.65■■□□□ 1.22
ADD1-204ENST00000398123 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.22
ADD1-204ENST00000398123 ARID3CA6NKF2 412 aa22.63■■□□□ 1.21
ADD1-204ENST00000398123 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
ADD1-204ENST00000398123 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
ADD1-204ENST00000398123 NCOA2Q15596 1464 aa22.62■■□□□ 1.21
ADD1-204ENST00000398123 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.62■■□□□ 1.21
ADD1-204ENST00000398123 OSCARQ8IYS5 282 aa22.6■■□□□ 1.21
ADD1-204ENST00000398123 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.56■■□□□ 1.2
ADD1-204ENST00000398123 ARHGEF11O15085 1522 aa22.56■■□□□ 1.2
ADD1-204ENST00000398123 UACAQ9BZF9 1416 aa22.56■■□□□ 1.2
ADD1-204ENST00000398123 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.56■■□□□ 1.2
ADD1-204ENST00000398123 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.55■■□□□ 1.2
ADD1-204ENST00000398123 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.55■■□□□ 1.2
ADD1-204ENST00000398123 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
ADD1-204ENST00000398123 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
ADD1-204ENST00000398123 ATP10BO94823 1461 aa22.52■■□□□ 1.19
ADD1-204ENST00000398123 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
ADD1-204ENST00000398123 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.5■■□□□ 1.19
ADD1-204ENST00000398123 ABCC2Q92887 1545 aa22.47■■□□□ 1.19
ADD1-204ENST00000398123 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
ADD1-204ENST00000398123 ITGAEP38570 1179 aa22.46■■□□□ 1.19
ADD1-204ENST00000398123 MIA2Q96PC5 1412 aa22.46■■□□□ 1.19
ADD1-204ENST00000398123 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa22.43■■□□□ 1.18
ADD1-204ENST00000398123 ADCY10Q96PN6 1610 aa22.41■■□□□ 1.18
ADD1-204ENST00000398123 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.4■■□□□ 1.18
ADD1-204ENST00000398123 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
ADD1-204ENST00000398123 KIF14Q15058 1648 aa22.37■■□□□ 1.17
ADD1-204ENST00000398123 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.33■■□□□ 1.17
ADD1-204ENST00000398123 ITSN2Q9NZM3 1697 aa22.32■■□□□ 1.16
ADD1-204ENST00000398123 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
ADD1-204ENST00000398123 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.3■■□□□ 1.16
ADD1-204ENST00000398123 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
ADD1-204ENST00000398123 ABCC10Q5T3U5 1492 aa22.29■■□□□ 1.16
ADD1-204ENST00000398123 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
ADD1-204ENST00000398123 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.25■■□□□ 1.15
ADD1-204ENST00000398123 PTPRKQ15262 1439 aa22.23■■□□□ 1.15
ADD1-204ENST00000398123 HFM1A2PYH4 1435 aa22.21■■□□□ 1.15
ADD1-204ENST00000398123 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa22.2■■□□□ 1.15
ADD1-204ENST00000398123 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
ADD1-204ENST00000398123 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.19■■□□□ 1.14
ADD1-204ENST00000398123 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa22.18■■□□□ 1.14
ADD1-204ENST00000398123 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
ADD1-204ENST00000398123 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
ADD1-204ENST00000398123 DAPK1P53355 1430 aa22.18■■□□□ 1.14
ADD1-204ENST00000398123 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
ADD1-204ENST00000398123 AKNAQ7Z591 1439 aa22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.6 ms