RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395891.6

HECW1-201, Transcript of HECT, C2 and WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene HECW1, Length 9,501 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1-201ENST00000395891 CASC1Q6TDU7 716 aa15.31■□□□□ 0.04
HECW1-201ENST00000395891 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
HECW1-201ENST00000395891 RSPH6AQ9H0K4 717 aa15.26■□□□□ 0.03
HECW1-201ENST00000395891 CSRNP3Q8WYN3 585 aa15.26■□□□□ 0.03
HECW1-201ENST00000395891 DEKP35659 375 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
HECW1-201ENST00000395891 MRS2Q9HD23 443 aa15.24■□□□□ 0.03
HECW1-201ENST00000395891 MSNP26038 577 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
HECW1-201ENST00000395891 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa15.23■□□□□ 0.03
HECW1-201ENST00000395891 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
HECW1-201ENST00000395891 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP15.21■□□□□ 0.03
HECW1-201ENST00000395891 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.02
HECW1-201ENST00000395891 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.02
HECW1-201ENST00000395891 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa15.21■□□□□ 0.02
HECW1-201ENST00000395891 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
HECW1-201ENST00000395891 MTUS2Q5JR59 1369 aa15.19■□□□□ 0.02
HECW1-201ENST00000395891 NRDCO43847 1150 aa15.18■□□□□ 0.02
HECW1-201ENST00000395891 P3H3Q8IVL6 736 aa15.18■□□□□ 0.02
HECW1-201ENST00000395891 ARID3CA6NKF2 412 aa15.17■□□□□ 0.02
HECW1-201ENST00000395891 PODXL2Q9NZ53 605 aa15.16■□□□□ 0.02
HECW1-201ENST00000395891 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
HECW1-201ENST00000395891 CLIP1P30622 1438 aa15.16■□□□□ 0.02
HECW1-201ENST00000395891 EEA1Q15075 1411 aa15.13■□□□□ 0.01
HECW1-201ENST00000395891 CHGAP10645 457 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
HECW1-201ENST00000395891 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
HECW1-201ENST00000395891 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
HECW1-201ENST00000395891 SETQ01105 290 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
HECW1-201ENST00000395891 APPP05067 770 aa15.12■□□□□ 0.01
HECW1-201ENST00000395891 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
HECW1-201ENST00000395891 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP15.11■□□□□ 0.01
HECW1-201ENST00000395891 GOLGA3Q08378 1498 aa15.11■□□□□ 0.01
HECW1-201ENST00000395891 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP15.1■□□□□ 0.01
HECW1-201ENST00000395891 CDCA8Q53HL2 280 aa15.1■□□□□ 0.01
HECW1-201ENST00000395891 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP15.09■□□□□ 0.01
HECW1-201ENST00000395891 PLPPR3Q6T4P5 718 aa15.09■□□□□ 0.01
HECW1-201ENST00000395891 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP15.09■□□□□ 0.01
HECW1-201ENST00000395891 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP15.09■□□□□ 0.01
HECW1-201ENST00000395891 PKNOX2Q96KN3 472 aa15.09■□□□□ 0.01
HECW1-201ENST00000395891 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
HECW1-201ENST00000395891 CFAP53Q96M91 514 aa15.07■□□□□ 0
HECW1-201ENST00000395891 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
HECW1-201ENST00000395891 VSIG10Q8N0Z9 540 aa15.05■□□□□ 0
HECW1-201ENST00000395891 USP35Q9P2H5 1018 aa15.05■□□□□ 0
HECW1-201ENST00000395891 TSPY4P0CV99 314 aa15.05■□□□□ -0
HECW1-201ENST00000395891 TSPY10P0CW01 314 aa15.05■□□□□ -0
HECW1-201ENST00000395891 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP15.02■□□□□ -0
HECW1-201ENST00000395891 KNSTRNQ9Y448 316 aa15.01□□□□□ -0.01
HECW1-201ENST00000395891 MS4A1P11836 297 aa14.99□□□□□ -0.01
HECW1-201ENST00000395891 NACADO15069 1562 aa14.99□□□□□ -0.01
HECW1-201ENST00000395891 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
HECW1-201ENST00000395891 A0A0G2JS52 829 aa14.97□□□□□ -0.01
HECW1-201ENST00000395891 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa14.97□□□□□ -0.01
HECW1-201ENST00000395891 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa14.96□□□□□ -0.01
HECW1-201ENST00000395891 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa14.96□□□□□ -0.01
HECW1-201ENST00000395891 CEP162Q5TB80 1403 aa14.96□□□□□ -0.01
HECW1-201ENST00000395891 CFAP44Q96MT7 982 aa14.96□□□□□ -0.02
HECW1-201ENST00000395891 CEP164Q9UPV0 1460 aa14.95□□□□□ -0.02
HECW1-201ENST00000395891 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
HECW1-201ENST00000395891 KIAA2012Q0VF49 1180 aa14.95□□□□□ -0.02
HECW1-201ENST00000395891 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
HECW1-201ENST00000395891 MIER1Q8N108 512 aa14.94□□□□□ -0.02
HECW1-201ENST00000395891 CHIC2Q9UKJ5 165 aa14.93□□□□□ -0.02
HECW1-201ENST00000395891 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
HECW1-201ENST00000395891 FGD1P98174 961 aa14.91□□□□□ -0.02
HECW1-201ENST00000395891 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa14.91□□□□□ -0.02
HECW1-201ENST00000395891 HSCBQ8IWL3 235 aa14.9□□□□□ -0.02
HECW1-201ENST00000395891 C14orf37Q86TY3 774 aa14.89□□□□□ -0.03
HECW1-201ENST00000395891 FHAD1B1AJZ9 1412 aa14.88□□□□□ -0.03
HECW1-201ENST00000395891 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa14.88□□□□□ -0.03
HECW1-201ENST00000395891 MCCP23508 829 aa14.88□□□□□ -0.03
HECW1-201ENST00000395891 PPP4R2Q9NY27 417 aa14.87□□□□□ -0.03
HECW1-201ENST00000395891 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
HECW1-201ENST00000395891 KCNJ4P48050 445 aa14.85□□□□□ -0.03
HECW1-201ENST00000395891 KIF27Q86VH2 1401 aa14.85□□□□□ -0.03
HECW1-201ENST00000395891 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
HECW1-201ENST00000395891 NUDCQ9Y266 331 aa14.84□□□□□ -0.03
HECW1-201ENST00000395891 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
HECW1-201ENST00000395891 GOLGA2Q08379 1002 aa14.82□□□□□ -0.04
HECW1-201ENST00000395891 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
HECW1-201ENST00000395891 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
HECW1-201ENST00000395891 DRC7Q8IY82 874 aa14.81□□□□□ -0.04
HECW1-201ENST00000395891 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
HECW1-201ENST00000395891 PLCB2Q00722 1185 aa14.8□□□□□ -0.04
HECW1-201ENST00000395891 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
HECW1-201ENST00000395891 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
HECW1-201ENST00000395891 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
HECW1-201ENST00000395891 KANK1Q14678 1352 aa14.79□□□□□ -0.04
HECW1-201ENST00000395891 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
HECW1-201ENST00000395891 NPHP1O15259 732 aa14.78□□□□□ -0.04
HECW1-201ENST00000395891 RGS3P49796 1198 aa14.77□□□□□ -0.04
HECW1-201ENST00000395891 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa14.77□□□□□ -0.05
HECW1-201ENST00000395891 MAP7D2Q96T17 732 aa14.77□□□□□ -0.05
HECW1-201ENST00000395891 GBP4Q96PP9 640 aa14.76□□□□□ -0.05
HECW1-201ENST00000395891 ARID3AQ99856 593 aa14.76□□□□□ -0.05
HECW1-201ENST00000395891 TPRNQ4KMQ1 711 aa14.76□□□□□ -0.05
HECW1-201ENST00000395891 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa14.76□□□□□ -0.05
HECW1-201ENST00000395891 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
HECW1-201ENST00000395891 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
HECW1-201ENST00000395891 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
HECW1-201ENST00000395891 ZBTB7CA1YPR0 619 aa14.76□□□□□ -0.05
HECW1-201ENST00000395891 CARD11Q9BXL7 1154 aa14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 93.3 ms