RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380750.7

SERF1B-201, Transcript of small EDRK-rich factor 1B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SERF1B, Length 1,889 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERF1B-201ENST00000380750 ADAMTS12P58397 1594 aa37.69■■■■□ 3.62
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SERF1B-201ENST00000380750 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP37.59■■■■□ 3.61
SERF1B-201ENST00000380750 EFCAB5A4FU69 1503 aa37.59■■■■□ 3.61
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SERF1B-201ENST00000380750 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.43■■■■□ 3.58
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SERF1B-201ENST00000380750 P3H3Q8IVL6 736 aa37.41■■■■□ 3.58
SERF1B-201ENST00000380750 FHOD3Q2V2M9 1422 aa37.41■■■■□ 3.58
SERF1B-201ENST00000380750 SAMD9Q5K651 1589 aa37.39■■■■□ 3.58
SERF1B-201ENST00000380750 GRIN2AQ12879 1464 aa37.34■■■■□ 3.57
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SERF1B-201ENST00000380750 MAP3K1Q13233 1512 aa37.31■■■■□ 3.56
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SERF1B-201ENST00000380750 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP37.28■■■■□ 3.56
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SERF1B-201ENST00000380750 FMN1Q68DA7 1419 aa37.27■■■■□ 3.56
SERF1B-201ENST00000380750 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa37.23■■■■□ 3.55
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SERF1B-201ENST00000380750 TIAM1Q13009 1591 aa37.22■■■■□ 3.55
SERF1B-201ENST00000380750 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa37.22■■■■□ 3.55
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SERF1B-201ENST00000380750 UGGT2Q9NYU1 1516 aa37.17■■■■□ 3.54
SERF1B-201ENST00000380750 CFAP43Q8NDM7 1665 aa37.11■■■■□ 3.53
SERF1B-201ENST00000380750 CEP170Q5SW79 1584 aa37.08■■■■□ 3.53
SERF1B-201ENST00000380750 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa37.07■■■■□ 3.52
SERF1B-201ENST00000380750 FBLN2P98095 1184 aa37.06■■■■□ 3.52
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SERF1B-201ENST00000380750 KIAA0556O60303 1618 aa36.95■■■■□ 3.51
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SERF1B-201ENST00000380750 CCNB3Q8WWL7 1395 aa36.8■■■■□ 3.48
SERF1B-201ENST00000380750 JPH4Q96JJ6 628 aa36.79■■■■□ 3.48
SERF1B-201ENST00000380750 CCDC18Q5T9S5 1454 aa36.79■■■■□ 3.48
SERF1B-201ENST00000380750 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP36.76■■■■□ 3.48
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SERF1B-201ENST00000380750 CHD1O14646 1710 aa36.75■■■■□ 3.47
SERF1B-201ENST00000380750 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa36.74■■■■□ 3.47
SERF1B-201ENST00000380750 MTUS2Q5JR59 1369 aa36.72■■■■□ 3.47
SERF1B-201ENST00000380750 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP36.69■■■■□ 3.46
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SERF1B-201ENST00000380750 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa36.65■■■■□ 3.46
SERF1B-201ENST00000380750 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa36.62■■■■□ 3.45
SERF1B-201ENST00000380750 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP36.58■■■■□ 3.45
SERF1B-201ENST00000380750 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa36.58■■■■□ 3.45
SERF1B-201ENST00000380750 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP36.57■■■■□ 3.44
SERF1B-201ENST00000380750 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP36.54■■■■□ 3.44
SERF1B-201ENST00000380750 NCOA2Q15596 1464 aa36.54■■■■□ 3.44
SERF1B-201ENST00000380750 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP36.52■■■■□ 3.44
SERF1B-201ENST00000380750 PLB1Q6P1J6 1458 aa36.49■■■■□ 3.43
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SERF1B-201ENST00000380750 FGD6Q6ZV73 1430 aa36.47■■■■□ 3.43
SERF1B-201ENST00000380750 ARID3CA6NKF2 412 aa36.44■■■■□ 3.42
SERF1B-201ENST00000380750 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP36.43■■■■□ 3.42
SERF1B-201ENST00000380750 MYOM3Q5VTT5 1437 aa36.43■■■■□ 3.42
SERF1B-201ENST00000380750 ABCA8O94911 1581 aa36.4■■■■□ 3.42
SERF1B-201ENST00000380750 ITGAEP38570 1179 aa36.39■■■■□ 3.42
SERF1B-201ENST00000380750 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.37■■■■□ 3.41
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SERF1B-201ENST00000380750 PTPRGP23470 1445 aa36.34■■■■□ 3.41
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SERF1B-201ENST00000380750 MIA2Q96PC5 1412 aa36.21■■■■□ 3.39
SERF1B-201ENST00000380750 ERCC6L2Q5T890 1561 aa36.2■■■■□ 3.39
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SERF1B-201ENST00000380750 SETD5Q9C0A6 1442 aa36.17■■■■□ 3.38
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SERF1B-201ENST00000380750 ADCY10Q96PN6 1610 aa36.12■■■■□ 3.37
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SERF1B-201ENST00000380750 ITSN2Q9NZM3 1697 aa35.95■■■■□ 3.35
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SERF1B-201ENST00000380750 AKNAQ7Z591 1439 aa35.84■■■■□ 3.33
SERF1B-201ENST00000380750 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP35.84■■■■□ 3.33
SERF1B-201ENST00000380750 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP35.82■■■■□ 3.33
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SERF1B-201ENST00000380750 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa35.79■■■■□ 3.32
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SERF1B-201ENST00000380750 KDM5BQ9UGL1 1544 aa35.78■■■■□ 3.32
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