RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373159.1

TRAPPC3-201, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 590 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-201ENST00000373159 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC3-201ENST00000373159 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.01■■□□□ 1.27
TRAPPC3-201ENST00000373159 KIF27Q86VH2 1401 aa23■■□□□ 1.27
TRAPPC3-201ENST00000373159 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa23■■□□□ 1.27
TRAPPC3-201ENST00000373159 FAM69CQ0P6D2 419 aa22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC3-201ENST00000373159 ABCC10Q5T3U5 1492 aa22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC3-201ENST00000373159 KIF13AQ9H1H9 1805 aa22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC3-201ENST00000373159 MAPKBP1O60336 1514 aa22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC3-201ENST00000373159 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.89■■□□□ 1.25
TRAPPC3-201ENST00000373159 CUL7Q14999 1698 aa22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC3-201ENST00000373159 ADCY10Q96PN6 1610 aa22.86■■□□□ 1.25
TRAPPC3-201ENST00000373159 PTPRGP23470 1445 aa22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC3-201ENST00000373159 DIP2BQ9P265 1576 aa22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC3-201ENST00000373159 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.78■■□□□ 1.24
TRAPPC3-201ENST00000373159 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.77■■□□□ 1.24
TRAPPC3-201ENST00000373159 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC3-201ENST00000373159 ABCC2Q92887 1545 aa22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC3-201ENST00000373159 IQGAP2Q13576 1575 aa22.67■■□□□ 1.22
TRAPPC3-201ENST00000373159 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC3-201ENST00000373159 PLB1Q6P1J6 1458 aa22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC3-201ENST00000373159 KDM6BO15054 1643 aa22.64■■□□□ 1.22
TRAPPC3-201ENST00000373159 ASXL2Q76L83 1435 aa22.64■■□□□ 1.21
TRAPPC3-201ENST00000373159 UACAQ9BZF9 1416 aa22.64■■□□□ 1.21
TRAPPC3-201ENST00000373159 DISP1Q96F81 1524 aa22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC3-201ENST00000373159 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC3-201ENST00000373159 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.62■■□□□ 1.21
TRAPPC3-201ENST00000373159 TSPOAP1O95153 1857 aa22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC3-201ENST00000373159 GLI2P10070 1586 aa22.58■■□□□ 1.2
TRAPPC3-201ENST00000373159 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC3-201ENST00000373159 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.54■■□□□ 1.2
TRAPPC3-201ENST00000373159 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
TRAPPC3-201ENST00000373159 KIAA0556O60303 1618 aa22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC3-201ENST00000373159 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC3-201ENST00000373159 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
TRAPPC3-201ENST00000373159 TEX14Q8IWB6 1497 aa22.41■■□□□ 1.18
TRAPPC3-201ENST00000373159 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.18
TRAPPC3-201ENST00000373159 GOLGA3Q08378 1498 aa22.39■■□□□ 1.17
TRAPPC3-201ENST00000373159 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa22.39■■□□□ 1.17
TRAPPC3-201ENST00000373159 WDR7Q9Y4E6 1490 aa22.37■■□□□ 1.17
TRAPPC3-201ENST00000373159 PRXQ9BXM0 1461 aa22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC3-201ENST00000373159 KCNH8Q96L42 1107 aa22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC3-201ENST00000373159 ADGRL1O94910 1474 aa22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC3-201ENST00000373159 CD109Q6YHK3 1445 aa22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC3-201ENST00000373159 ABCA8O94911 1581 aa22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC3-201ENST00000373159 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC3-201ENST00000373159 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC3-201ENST00000373159 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC3-201ENST00000373159 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC3-201ENST00000373159 P3H3Q8IVL6 736 aa22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC3-201ENST00000373159 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC3-201ENST00000373159 ATP10BO94823 1461 aa22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC3-201ENST00000373159 ARID3CA6NKF2 412 aa22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC3-201ENST00000373159 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC3-201ENST00000373159 ARAP3Q8WWN8 1544 aa22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC3-201ENST00000373159 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC3-201ENST00000373159 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC3-201ENST00000373159 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC3-201ENST00000373159 SAMD9Q5K651 1589 aa22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC3-201ENST00000373159 HECW2Q9P2P5 1572 aa22.03■■□□□ 1.12
TRAPPC3-201ENST00000373159 EEA1Q15075 1411 aa22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC3-201ENST00000373159 ABCA9Q8IUA7 1624 aa22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC3-201ENST00000373159 RAPGEF3O95398 923 aa22■■□□□ 1.11
TRAPPC3-201ENST00000373159 NEO1Q92859 1461 aa21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC3-201ENST00000373159 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC3-201ENST00000373159 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
TRAPPC3-201ENST00000373159 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
TRAPPC3-201ENST00000373159 PLEKHD1A6NEE1 506 aa21.96■■□□□ 1.11
TRAPPC3-201ENST00000373159 KIF21BO75037 1637 aa21.94■■□□□ 1.1
TRAPPC3-201ENST00000373159 FHOD3Q2V2M9 1422 aa21.93■■□□□ 1.1
TRAPPC3-201ENST00000373159 PTPRMP28827 1452 aa21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC3-201ENST00000373159 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
TRAPPC3-201ENST00000373159 ADAMTSL3P82987 1691 aa21.84■■□□□ 1.09
TRAPPC3-201ENST00000373159 AKNAQ7Z591 1439 aa21.83■■□□□ 1.09
TRAPPC3-201ENST00000373159 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.08
TRAPPC3-201ENST00000373159 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC3-201ENST00000373159 EFCAB5A4FU69 1503 aa21.81■■□□□ 1.08
TRAPPC3-201ENST00000373159 FANCAO15360 1455 aa21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC3-201ENST00000373159 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC3-201ENST00000373159 BCORL1Q5H9F3 1711 aa21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC3-201ENST00000373159 UBTFP17480 764 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC3-201ENST00000373159 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC3-201ENST00000373159 PLCH2O75038 1416 aa21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC3-201ENST00000373159 CFAP74Q9C0B2 1584 aa21.7■■□□□ 1.06
TRAPPC3-201ENST00000373159 RICTORQ6R327 1708 aa21.7■■□□□ 1.06
TRAPPC3-201ENST00000373159 FBXO41Q8TF61 875 aa21.7■■□□□ 1.06
TRAPPC3-201ENST00000373159 POGZQ7Z3K3 1410 aa21.7■■□□□ 1.06
TRAPPC3-201ENST00000373159 MAGI2Q86UL8 1455 aa21.7■■□□□ 1.06
TRAPPC3-201ENST00000373159 MADDQ8WXG6 1647 aa21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC3-201ENST00000373159 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC3-201ENST00000373159 TTC37Q6PGP7 1564 aa21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC3-201ENST00000373159 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
TRAPPC3-201ENST00000373159 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
TRAPPC3-201ENST00000373159 FMN1Q68DA7 1419 aa21.68■■□□□ 1.06
TRAPPC3-201ENST00000373159 SCAPERQ9BY12 1400 aa21.68■■□□□ 1.06
TRAPPC3-201ENST00000373159 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC3-201ENST00000373159 YEATS2Q9ULM3 1422 aa21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC3-201ENST00000373159 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC3-201ENST00000373159 EHMT2Q96KQ7 1210 aa21.66■■□□□ 1.06
TRAPPC3-201ENST00000373159 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC3-201ENST00000373159 LMTK3Q96Q04 1460 aa21.65■■□□□ 1.06
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