RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372435.8

PRPS1-204, Transcript of phosphoribosyl pyrophosphate synthetase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRPS1, Length 2,073 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPS1-204ENST00000372435 NUP160Q12769 1436 aa23.55■■□□□ 1.36
PRPS1-204ENST00000372435 SHROOM2Q13796 1616 aa23.53■■□□□ 1.36
PRPS1-204ENST00000372435 ADAMTS12P58397 1594 aa23.51■■□□□ 1.35
PRPS1-204ENST00000372435 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
PRPS1-204ENST00000372435 NEUROD1Q13562 356 aa23.48■■□□□ 1.35
PRPS1-204ENST00000372435 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.39■■□□□ 1.33
PRPS1-204ENST00000372435 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa23.37■■□□□ 1.33
PRPS1-204ENST00000372435 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa23.37■■□□□ 1.33
PRPS1-204ENST00000372435 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.35■■□□□ 1.33
PRPS1-204ENST00000372435 ABCC10Q5T3U5 1492 aa23.35■■□□□ 1.33
PRPS1-204ENST00000372435 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
PRPS1-204ENST00000372435 FAM69CQ0P6D2 419 aa23.32■■□□□ 1.32
PRPS1-204ENST00000372435 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
PRPS1-204ENST00000372435 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa23.31■■□□□ 1.32
PRPS1-204ENST00000372435 MAPKBP1O60336 1514 aa23.29■■□□□ 1.32
PRPS1-204ENST00000372435 DIP2BQ9P265 1576 aa23.29■■□□□ 1.32
PRPS1-204ENST00000372435 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.29■■□□□ 1.32
PRPS1-204ENST00000372435 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
PRPS1-204ENST00000372435 JPH4Q96JJ6 628 aa23.26■■□□□ 1.31
PRPS1-204ENST00000372435 KDM6BO15054 1643 aa23.24■■□□□ 1.31
PRPS1-204ENST00000372435 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.24■■□□□ 1.31
PRPS1-204ENST00000372435 TOP2BQ02880 1626 aa23.23■■□□□ 1.31
PRPS1-204ENST00000372435 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP23.2■■□□□ 1.3
PRPS1-204ENST00000372435 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.2■■□□□ 1.3
PRPS1-204ENST00000372435 ADCY10Q96PN6 1610 aa23.2■■□□□ 1.3
PRPS1-204ENST00000372435 TSPOAP1O95153 1857 aa23.11■■□□□ 1.29
PRPS1-204ENST00000372435 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.98■■□□□ 1.27
PRPS1-204ENST00000372435 ADGRL1O94910 1474 aa22.97■■□□□ 1.27
PRPS1-204ENST00000372435 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
PRPS1-204ENST00000372435 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
PRPS1-204ENST00000372435 GLI2P10070 1586 aa22.89■■□□□ 1.25
PRPS1-204ENST00000372435 PTPRGP23470 1445 aa22.88■■□□□ 1.25
PRPS1-204ENST00000372435 HECW2Q9P2P5 1572 aa22.88■■□□□ 1.25
PRPS1-204ENST00000372435 ABCC2Q92887 1545 aa22.88■■□□□ 1.25
PRPS1-204ENST00000372435 ASXL2Q76L83 1435 aa22.85■■□□□ 1.25
PRPS1-204ENST00000372435 PLB1Q6P1J6 1458 aa22.84■■□□□ 1.25
PRPS1-204ENST00000372435 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
PRPS1-204ENST00000372435 IGF1RP08069 1367 aa22.83■■□□□ 1.24
PRPS1-204ENST00000372435 CUL7Q14999 1698 aa22.82■■□□□ 1.24
PRPS1-204ENST00000372435 BCL11AQ9H165 835 aa22.8■■□□□ 1.24
PRPS1-204ENST00000372435 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.79■■□□□ 1.24
PRPS1-204ENST00000372435 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa22.76■■□□□ 1.23
PRPS1-204ENST00000372435 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa22.75■■□□□ 1.23
PRPS1-204ENST00000372435 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.74■■□□□ 1.23
PRPS1-204ENST00000372435 KIF27Q86VH2 1401 aa22.73■■□□□ 1.23
PRPS1-204ENST00000372435 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
PRPS1-204ENST00000372435 TEX14Q8IWB6 1497 aa22.7■■□□□ 1.22
PRPS1-204ENST00000372435 UACAQ9BZF9 1416 aa22.69■■□□□ 1.22
PRPS1-204ENST00000372435 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.67■■□□□ 1.22
PRPS1-204ENST00000372435 IQGAP2Q13576 1575 aa22.67■■□□□ 1.22
PRPS1-204ENST00000372435 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.64■■□□□ 1.22
PRPS1-204ENST00000372435 DISP1Q96F81 1524 aa22.63■■□□□ 1.21
PRPS1-204ENST00000372435 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
PRPS1-204ENST00000372435 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
PRPS1-204ENST00000372435 ANP32EQ9BTT0 268 aa22.6■■□□□ 1.21
PRPS1-204ENST00000372435 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
PRPS1-204ENST00000372435 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.2
PRPS1-204ENST00000372435 FBXO41Q8TF61 875 aa22.56■■□□□ 1.2
PRPS1-204ENST00000372435 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.54■■□□□ 1.2
PRPS1-204ENST00000372435 WDR7Q9Y4E6 1490 aa22.53■■□□□ 1.2
PRPS1-204ENST00000372435 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.51■■□□□ 1.19
PRPS1-204ENST00000372435 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.49■■□□□ 1.19
PRPS1-204ENST00000372435 KIAA0556O60303 1618 aa22.49■■□□□ 1.19
PRPS1-204ENST00000372435 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
PRPS1-204ENST00000372435 KIF21BO75037 1637 aa22.46■■□□□ 1.19
PRPS1-204ENST00000372435 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.45■■□□□ 1.18
PRPS1-204ENST00000372435 CD109Q6YHK3 1445 aa22.45■■□□□ 1.18
PRPS1-204ENST00000372435 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.37■■□□□ 1.17
PRPS1-204ENST00000372435 KCNH8Q96L42 1107 aa22.35■■□□□ 1.17
PRPS1-204ENST00000372435 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
PRPS1-204ENST00000372435 PTPRMP28827 1452 aa22.34■■□□□ 1.17
PRPS1-204ENST00000372435 ABCA8O94911 1581 aa22.33■■□□□ 1.17
PRPS1-204ENST00000372435 ARAP3Q8WWN8 1544 aa22.33■■□□□ 1.16
PRPS1-204ENST00000372435 ADAMTSL3P82987 1691 aa22.32■■□□□ 1.16
PRPS1-204ENST00000372435 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa22.27■■□□□ 1.16
PRPS1-204ENST00000372435 MIER1Q8N108 512 aa22.26■■□□□ 1.15
PRPS1-204ENST00000372435 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
PRPS1-204ENST00000372435 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.24■■□□□ 1.15
PRPS1-204ENST00000372435 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
PRPS1-204ENST00000372435 GOLGA3Q08378 1498 aa22.24■■□□□ 1.15
PRPS1-204ENST00000372435 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.24■■□□□ 1.15
PRPS1-204ENST00000372435 LMTK3Q96Q04 1460 aa22.22■■□□□ 1.15
PRPS1-204ENST00000372435 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
PRPS1-204ENST00000372435 BCORL1Q5H9F3 1711 aa22.2■■□□□ 1.14
PRPS1-204ENST00000372435 MADDQ8WXG6 1647 aa22.19■■□□□ 1.14
PRPS1-204ENST00000372435 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.18■■□□□ 1.14
PRPS1-204ENST00000372435 ABCA9Q8IUA7 1624 aa22.16■■□□□ 1.14
PRPS1-204ENST00000372435 RAPGEF3O95398 923 aa22.15■■□□□ 1.14
PRPS1-204ENST00000372435 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa22.13■■□□□ 1.13
PRPS1-204ENST00000372435 ATP10BO94823 1461 aa22.12■■□□□ 1.13
PRPS1-204ENST00000372435 NEO1Q92859 1461 aa22.11■■□□□ 1.13
PRPS1-204ENST00000372435 ARID3CA6NKF2 412 aa22.1■■□□□ 1.13
PRPS1-204ENST00000372435 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
PRPS1-204ENST00000372435 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
PRPS1-204ENST00000372435 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa22.04■■□□□ 1.12
PRPS1-204ENST00000372435 HSPA2P54652 639 aa22.04■■□□□ 1.12
PRPS1-204ENST00000372435 CERKQ8TCT0 537 aa22.02■■□□□ 1.11
PRPS1-204ENST00000372435 PRXQ9BXM0 1461 aa21.99■■□□□ 1.11
PRPS1-204ENST00000372435 RICTORQ6R327 1708 aa21.96■■□□□ 1.11
PRPS1-204ENST00000372435 P3H3Q8IVL6 736 aa21.96■■□□□ 1.11
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