RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369838.5

SH3BGRL2-201, Transcript of SH3 domain binding glutamate rich protein like 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BGRL2, Length 4,653 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRL2-201ENST00000369838 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
SH3BGRL2-201ENST00000369838 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
SH3BGRL2-201ENST00000369838 C14orf37Q86TY3 774 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BGRL2-201ENST00000369838 CANXP27824 592 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
SH3BGRL2-201ENST00000369838 CLIP1P30622 1438 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BGRL2-201ENST00000369838 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
SH3BGRL2-201ENST00000369838 CEP164Q9UPV0 1460 aa16.62■□□□□ 0.25
SH3BGRL2-201ENST00000369838 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
SH3BGRL2-201ENST00000369838 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa16.61■□□□□ 0.25
SH3BGRL2-201ENST00000369838 TONSLQ96HA7 1378 aa16.6■□□□□ 0.25
SH3BGRL2-201ENST00000369838 ZBTB7CA1YPR0 619 aa16.57■□□□□ 0.24
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SH3BGRL2-201ENST00000369838 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
SH3BGRL2-201ENST00000369838 MLECQ14165 292 aa16.52■□□□□ 0.24
SH3BGRL2-201ENST00000369838 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
SH3BGRL2-201ENST00000369838 MIER1Q8N108 512 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BGRL2-201ENST00000369838 VPS8Q8N3P4 1428 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BGRL2-201ENST00000369838 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
SH3BGRL2-201ENST00000369838 UNC13AQ9UPW8 1703 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BGRL2-201ENST00000369838 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
SH3BGRL2-201ENST00000369838 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BGRL2-201ENST00000369838 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
SH3BGRL2-201ENST00000369838 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BGRL2-201ENST00000369838 LMOD2Q6P5Q4 547 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BGRL2-201ENST00000369838 SYNJ1O43426 1573 aa16.42■□□□□ 0.22
SH3BGRL2-201ENST00000369838 TMC1Q8TDI8 760 aa16.41■□□□□ 0.22
SH3BGRL2-201ENST00000369838 FAM9BQ8IZU0 186 aa16.4■□□□□ 0.22
SH3BGRL2-201ENST00000369838 KIF27Q86VH2 1401 aa16.4■□□□□ 0.22
SH3BGRL2-201ENST00000369838 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
SH3BGRL2-201ENST00000369838 BICRAQ9NZM4 1560 aa16.38■□□□□ 0.21
SH3BGRL2-201ENST00000369838 KIF21BO75037 1637 aa16.35■□□□□ 0.21
SH3BGRL2-201ENST00000369838 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP16.31■□□□□ 0.2
SH3BGRL2-201ENST00000369838 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
SH3BGRL2-201ENST00000369838 MYT1Q01538 1121 aa16.31■□□□□ 0.2
SH3BGRL2-201ENST00000369838 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP16.3■□□□□ 0.2
SH3BGRL2-201ENST00000369838 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP16.3■□□□□ 0.2
SH3BGRL2-201ENST00000369838 GGT6Q6P531 493 aa16.29■□□□□ 0.2
SH3BGRL2-201ENST00000369838 PEG3Q9GZU2 1588 aa16.28■□□□□ 0.2
SH3BGRL2-201ENST00000369838 ARXQ96QS3 562 aa16.27■□□□□ 0.2
SH3BGRL2-201ENST00000369838 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP16.26■□□□□ 0.19
SH3BGRL2-201ENST00000369838 CUX2O14529 1486 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BGRL2-201ENST00000369838 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
SH3BGRL2-201ENST00000369838 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa16.24■□□□□ 0.19
SH3BGRL2-201ENST00000369838 POGKQ9P215 609 aa16.24■□□□□ 0.19
SH3BGRL2-201ENST00000369838 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa16.24■□□□□ 0.19
SH3BGRL2-201ENST00000369838 CYB5RLQ6IPT4 315 aa16.21■□□□□ 0.19
SH3BGRL2-201ENST00000369838 MRS2Q9HD23 443 aa16.21■□□□□ 0.19
SH3BGRL2-201ENST00000369838 PDS5BQ9NTI5 1447 aa16.21■□□□□ 0.18
SH3BGRL2-201ENST00000369838 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP16.2■□□□□ 0.18
SH3BGRL2-201ENST00000369838 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
SH3BGRL2-201ENST00000369838 TOP2BQ02880 1626 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BGRL2-201ENST00000369838 SOX12O15370 315 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BGRL2-201ENST00000369838 CCNB3Q8WWL7 1395 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BGRL2-201ENST00000369838 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP16.16■□□□□ 0.18
SH3BGRL2-201ENST00000369838 CARD11Q9BXL7 1154 aa16.13■□□□□ 0.17
SH3BGRL2-201ENST00000369838 PRXQ9BXM0 1461 aa16.13■□□□□ 0.17
SH3BGRL2-201ENST00000369838 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
SH3BGRL2-201ENST00000369838 ARAP1Q96P48 1450 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BGRL2-201ENST00000369838 ERICH3Q5RHP9 1530 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BGRL2-201ENST00000369838 NEUROD2Q15784 382 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BGRL2-201ENST00000369838 SIN3AQ96ST3 1273 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BGRL2-201ENST00000369838 KNSTRNQ9Y448 316 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BGRL2-201ENST00000369838 STK26Q9P289 416 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BGRL2-201ENST00000369838 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa16.06■□□□□ 0.16
SH3BGRL2-201ENST00000369838 NCAPD3P42695 1498 aa16.05■□□□□ 0.16
SH3BGRL2-201ENST00000369838 DCAF11Q8TEB1 546 aa16.05■□□□□ 0.16
SH3BGRL2-201ENST00000369838 CUX1P39880 1505 aa16.05■□□□□ 0.16
SH3BGRL2-201ENST00000369838 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa16.05■□□□□ 0.16
SH3BGRL2-201ENST00000369838 JPH4Q96JJ6 628 aa16.05■□□□□ 0.16
SH3BGRL2-201ENST00000369838 HDGFP51858 240 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
SH3BGRL2-201ENST00000369838 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
SH3BGRL2-201ENST00000369838 FKBP8Q14318 412 aa16.04■□□□□ 0.16
SH3BGRL2-201ENST00000369838 CDCA8Q53HL2 280 aa16.03■□□□□ 0.16
SH3BGRL2-201ENST00000369838 CFAP53Q96M91 514 aa16.03■□□□□ 0.16
SH3BGRL2-201ENST00000369838 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
SH3BGRL2-201ENST00000369838 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa16.02■□□□□ 0.16
SH3BGRL2-201ENST00000369838 CADPSQ9ULU8 1353 aa16.02■□□□□ 0.15
SH3BGRL2-201ENST00000369838 NPHP1O15259 732 aa16.01■□□□□ 0.15
SH3BGRL2-201ENST00000369838 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
SH3BGRL2-201ENST00000369838 OSCARQ8IYS5 282 aa16.01■□□□□ 0.15
SH3BGRL2-201ENST00000369838 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
SH3BGRL2-201ENST00000369838 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa16■□□□□ 0.15
SH3BGRL2-201ENST00000369838 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa16■□□□□ 0.15
SH3BGRL2-201ENST00000369838 KIF3BO15066 747 aa16■□□□□ 0.15
SH3BGRL2-201ENST00000369838 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
SH3BGRL2-201ENST00000369838 KANK1Q14678 1352 aa16■□□□□ 0.15
SH3BGRL2-201ENST00000369838 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
SH3BGRL2-201ENST00000369838 CFTRP13569 1480 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BGRL2-201ENST00000369838 IGF1RP08069 1367 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BGRL2-201ENST00000369838 FOXD1Q16676 465 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BGRL2-201ENST00000369838 FHAD1B1AJZ9 1412 aa15.96■□□□□ 0.15
SH3BGRL2-201ENST00000369838 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
SH3BGRL2-201ENST00000369838 HMGXB3Q12766 1538 aa15.96■□□□□ 0.15
SH3BGRL2-201ENST00000369838 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
SH3BGRL2-201ENST00000369838 SETD5Q9C0A6 1442 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BGRL2-201ENST00000369838 CCDC136Q96JN2 1154 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BGRL2-201ENST00000369838 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
SH3BGRL2-201ENST00000369838 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP15.94■□□□□ 0.142e-7■■■□□ 16
SH3BGRL2-201ENST00000369838 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
SH3BGRL2-201ENST00000369838 PKD2Q13563 968 aa15.94■□□□□ 0.14
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