RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367995.3

ADAMTS4-201, Transcript of ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ADAMTS4, Length 1,961 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ADAMTS4-201ENST00000367995 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.69■■□□□ 1.7
ADAMTS4-201ENST00000367995 MAP3K1Q13233 1512 aa25.66■■□□□ 1.7
ADAMTS4-201ENST00000367995 GRIN2BQ13224 1484 aa25.63■■□□□ 1.69
ADAMTS4-201ENST00000367995 ADAMTS12P58397 1594 aa25.62■■□□□ 1.69
ADAMTS4-201ENST00000367995 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
ADAMTS4-201ENST00000367995 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.62■■□□□ 1.69
ADAMTS4-201ENST00000367995 TIAM1Q13009 1591 aa25.6■■□□□ 1.69
ADAMTS4-201ENST00000367995 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
ADAMTS4-201ENST00000367995 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
ADAMTS4-201ENST00000367995 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.69
ADAMTS4-201ENST00000367995 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.57■■□□□ 1.68
ADAMTS4-201ENST00000367995 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
ADAMTS4-201ENST00000367995 SAMD9Q5K651 1589 aa25.56■■□□□ 1.68
ADAMTS4-201ENST00000367995 CFAP43Q8NDM7 1665 aa25.54■■□□□ 1.68
ADAMTS4-201ENST00000367995 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.54■■□□□ 1.68
ADAMTS4-201ENST00000367995 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
ADAMTS4-201ENST00000367995 P3H3Q8IVL6 736 aa25.53■■□□□ 1.68
ADAMTS4-201ENST00000367995 FMN1Q68DA7 1419 aa25.52■■□□□ 1.68
ADAMTS4-201ENST00000367995 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.5■■□□□ 1.67
ADAMTS4-201ENST00000367995 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
ADAMTS4-201ENST00000367995 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
ADAMTS4-201ENST00000367995 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
ADAMTS4-201ENST00000367995 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.46■■□□□ 1.67
ADAMTS4-201ENST00000367995 IQGAP2Q13576 1575 aa25.44■■□□□ 1.66
ADAMTS4-201ENST00000367995 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.41■■□□□ 1.66
ADAMTS4-201ENST00000367995 CCNB3Q8WWL7 1395 aa25.38■■□□□ 1.65
ADAMTS4-201ENST00000367995 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
ADAMTS4-201ENST00000367995 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
ADAMTS4-201ENST00000367995 GRIN2AQ12879 1464 aa25.33■■□□□ 1.65
ADAMTS4-201ENST00000367995 UGGT2Q9NYU1 1516 aa25.31■■□□□ 1.64
ADAMTS4-201ENST00000367995 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa25.3■■□□□ 1.64
ADAMTS4-201ENST00000367995 SYNJ2O15056 1496 aa25.26■■□□□ 1.63
ADAMTS4-201ENST00000367995 PHLDB1Q86UU1 1377 aa25.24■■□□□ 1.63
ADAMTS4-201ENST00000367995 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.23■■□□□ 1.63
ADAMTS4-201ENST00000367995 HECW1Q76N89 1606 aa25.21■■□□□ 1.63
ADAMTS4-201ENST00000367995 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.21■■□□□ 1.63
ADAMTS4-201ENST00000367995 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.18■■□□□ 1.62
ADAMTS4-201ENST00000367995 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
ADAMTS4-201ENST00000367995 KIAA0556O60303 1618 aa25.17■■□□□ 1.62
ADAMTS4-201ENST00000367995 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.16■■□□□ 1.62
ADAMTS4-201ENST00000367995 CEP170Q5SW79 1584 aa25.14■■□□□ 1.62
ADAMTS4-201ENST00000367995 DISP1Q96F81 1524 aa25.13■■□□□ 1.61
ADAMTS4-201ENST00000367995 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.12■■□□□ 1.61
ADAMTS4-201ENST00000367995 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
ADAMTS4-201ENST00000367995 NUP160Q12769 1436 aa25.1■■□□□ 1.61
ADAMTS4-201ENST00000367995 CLSPNQ9HAW4 1339 aa25.08■■□□□ 1.61
ADAMTS4-201ENST00000367995 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
ADAMTS4-201ENST00000367995 ITGAEP38570 1179 aa25.07■■□□□ 1.6
ADAMTS4-201ENST00000367995 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
ADAMTS4-201ENST00000367995 NCOA2Q15596 1464 aa25.06■■□□□ 1.6
ADAMTS4-201ENST00000367995 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.05■■□□□ 1.6
ADAMTS4-201ENST00000367995 FBLN2P98095 1184 aa25.05■■□□□ 1.6
ADAMTS4-201ENST00000367995 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
ADAMTS4-201ENST00000367995 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa25.01■■□□□ 1.59
ADAMTS4-201ENST00000367995 ARHGEF11O15085 1522 aa25■■□□□ 1.59
ADAMTS4-201ENST00000367995 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25■■□□□ 1.59
ADAMTS4-201ENST00000367995 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa25■■□□□ 1.59
ADAMTS4-201ENST00000367995 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa24.99■■□□□ 1.59
ADAMTS4-201ENST00000367995 SETD5Q9C0A6 1442 aa24.98■■□□□ 1.59
ADAMTS4-201ENST00000367995 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
ADAMTS4-201ENST00000367995 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa24.96■■□□□ 1.59
ADAMTS4-201ENST00000367995 JPH4Q96JJ6 628 aa24.93■■□□□ 1.58
ADAMTS4-201ENST00000367995 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
ADAMTS4-201ENST00000367995 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24.89■■□□□ 1.58
ADAMTS4-201ENST00000367995 CHD1O14646 1710 aa24.86■■□□□ 1.57
ADAMTS4-201ENST00000367995 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
ADAMTS4-201ENST00000367995 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
ADAMTS4-201ENST00000367995 MIA2Q96PC5 1412 aa24.83■■□□□ 1.56
ADAMTS4-201ENST00000367995 PLB1Q6P1J6 1458 aa24.8■■□□□ 1.56
ADAMTS4-201ENST00000367995 ARID3CA6NKF2 412 aa24.8■■□□□ 1.56
ADAMTS4-201ENST00000367995 ABCA8O94911 1581 aa24.77■■□□□ 1.56
ADAMTS4-201ENST00000367995 HFM1A2PYH4 1435 aa24.76■■□□□ 1.55
ADAMTS4-201ENST00000367995 PTPRKQ15262 1439 aa24.75■■□□□ 1.55
ADAMTS4-201ENST00000367995 MAPKBP1O60336 1514 aa24.75■■□□□ 1.55
ADAMTS4-201ENST00000367995 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
ADAMTS4-201ENST00000367995 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
ADAMTS4-201ENST00000367995 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
ADAMTS4-201ENST00000367995 SHROOM2Q13796 1616 aa24.71■■□□□ 1.55
ADAMTS4-201ENST00000367995 ADCY10Q96PN6 1610 aa24.71■■□□□ 1.55
ADAMTS4-201ENST00000367995 NAIPQ13075 1403 aa24.67■■□□□ 1.54
ADAMTS4-201ENST00000367995 AKNAQ7Z591 1439 aa24.66■■□□□ 1.54
ADAMTS4-201ENST00000367995 ITSN2Q9NZM3 1697 aa24.66■■□□□ 1.54
ADAMTS4-201ENST00000367995 GCC2Q8IWJ2 1684 aa24.65■■□□□ 1.54
ADAMTS4-201ENST00000367995 PTPRGP23470 1445 aa24.65■■□□□ 1.54
ADAMTS4-201ENST00000367995 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
ADAMTS4-201ENST00000367995 UACAQ9BZF9 1416 aa24.61■■□□□ 1.53
ADAMTS4-201ENST00000367995 ATP10BO94823 1461 aa24.6■■□□□ 1.53
ADAMTS4-201ENST00000367995 KIF14Q15058 1648 aa24.6■■□□□ 1.53
ADAMTS4-201ENST00000367995 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
ADAMTS4-201ENST00000367995 PLEKHD1A6NEE1 506 aa24.56■■□□□ 1.52
ADAMTS4-201ENST00000367995 DAPK1P53355 1430 aa24.56■■□□□ 1.52
ADAMTS4-201ENST00000367995 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.55■■□□□ 1.52
ADAMTS4-201ENST00000367995 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
ADAMTS4-201ENST00000367995 ROCK1Q13464 1354 aa24.53■■□□□ 1.52
ADAMTS4-201ENST00000367995 CHIC2Q9UKJ5 165 aa24.52■■□□□ 1.52
ADAMTS4-201ENST00000367995 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa24.51■■□□□ 1.51
ADAMTS4-201ENST00000367995 ABCC5O15440 1437 aa24.51■■□□□ 1.51
ADAMTS4-201ENST00000367995 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa24.51■■□□□ 1.51
ADAMTS4-201ENST00000367995 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
ADAMTS4-201ENST00000367995 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.6 ms