RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366998.4

NEK2-201, Transcript of NIMA related kinase 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NEK2, Length 1,865 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK2-201ENST00000366998 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
NEK2-201ENST00000366998 ADAMTS12P58397 1594 aa23.27■■□□□ 1.32
NEK2-201ENST00000366998 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.25■■□□□ 1.31
NEK2-201ENST00000366998 APLP2Q06481 763 aa23.23■■□□□ 1.31
NEK2-201ENST00000366998 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.17■■□□□ 1.3
NEK2-201ENST00000366998 EFCAB5A4FU69 1503 aa23.16■■□□□ 1.3
NEK2-201ENST00000366998 P3H3Q8IVL6 736 aa23.11■■□□□ 1.29
NEK2-201ENST00000366998 FHOD3Q2V2M9 1422 aa23.08■■□□□ 1.29
NEK2-201ENST00000366998 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
NEK2-201ENST00000366998 IQGAP2Q13576 1575 aa23.05■■□□□ 1.28
NEK2-201ENST00000366998 SAMD9Q5K651 1589 aa23.05■■□□□ 1.28
NEK2-201ENST00000366998 GRIN2AQ12879 1464 aa23.04■■□□□ 1.28
NEK2-201ENST00000366998 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
NEK2-201ENST00000366998 SYNJ2O15056 1496 aa23■■□□□ 1.27
NEK2-201ENST00000366998 HRCP23327 699 aa22.97■■□□□ 1.27
NEK2-201ENST00000366998 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
NEK2-201ENST00000366998 TIAM1Q13009 1591 aa22.95■■□□□ 1.27
NEK2-201ENST00000366998 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
NEK2-201ENST00000366998 FMN1Q68DA7 1419 aa22.95■■□□□ 1.26
NEK2-201ENST00000366998 FBLN2P98095 1184 aa22.94■■□□□ 1.26
NEK2-201ENST00000366998 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.94■■□□□ 1.26
NEK2-201ENST00000366998 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.93■■□□□ 1.26
NEK2-201ENST00000366998 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
NEK2-201ENST00000366998 MAP3K1Q13233 1512 aa22.92■■□□□ 1.26
NEK2-201ENST00000366998 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.92■■□□□ 1.26
NEK2-201ENST00000366998 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.91■■□□□ 1.26
NEK2-201ENST00000366998 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.9■■□□□ 1.26
NEK2-201ENST00000366998 CEP170Q5SW79 1584 aa22.9■■□□□ 1.26
NEK2-201ENST00000366998 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.82■■□□□ 1.24
NEK2-201ENST00000366998 NUP160Q12769 1436 aa22.82■■□□□ 1.24
NEK2-201ENST00000366998 KIAA0556O60303 1618 aa22.81■■□□□ 1.24
NEK2-201ENST00000366998 CHD1O14646 1710 aa22.79■■□□□ 1.24
NEK2-201ENST00000366998 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.78■■□□□ 1.24
NEK2-201ENST00000366998 DISP1Q96F81 1524 aa22.78■■□□□ 1.24
NEK2-201ENST00000366998 HECW1Q76N89 1606 aa22.74■■□□□ 1.23
NEK2-201ENST00000366998 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
NEK2-201ENST00000366998 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
NEK2-201ENST00000366998 JPH4Q96JJ6 628 aa22.68■■□□□ 1.22
NEK2-201ENST00000366998 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.68■■□□□ 1.22
NEK2-201ENST00000366998 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.67■■□□□ 1.22
NEK2-201ENST00000366998 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.66■■□□□ 1.22
NEK2-201ENST00000366998 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
NEK2-201ENST00000366998 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.65■■□□□ 1.22
NEK2-201ENST00000366998 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.63■■□□□ 1.21
NEK2-201ENST00000366998 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.62■■□□□ 1.21
NEK2-201ENST00000366998 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
NEK2-201ENST00000366998 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
NEK2-201ENST00000366998 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.61■■□□□ 1.21
NEK2-201ENST00000366998 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
NEK2-201ENST00000366998 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
NEK2-201ENST00000366998 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
NEK2-201ENST00000366998 ARID3CA6NKF2 412 aa22.56■■□□□ 1.2
NEK2-201ENST00000366998 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.55■■□□□ 1.2
NEK2-201ENST00000366998 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
NEK2-201ENST00000366998 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
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NEK2-201ENST00000366998 PLB1Q6P1J6 1458 aa22.51■■□□□ 1.19
NEK2-201ENST00000366998 SHROOM2Q13796 1616 aa22.51■■□□□ 1.19
NEK2-201ENST00000366998 ITGAEP38570 1179 aa22.49■■□□□ 1.19
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NEK2-201ENST00000366998 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.46■■□□□ 1.19
NEK2-201ENST00000366998 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.45■■□□□ 1.18
NEK2-201ENST00000366998 ABCA8O94911 1581 aa22.44■■□□□ 1.18
NEK2-201ENST00000366998 ARHGEF11O15085 1522 aa22.44■■□□□ 1.18
NEK2-201ENST00000366998 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.44■■□□□ 1.18
NEK2-201ENST00000366998 PTPRGP23470 1445 aa22.41■■□□□ 1.18
NEK2-201ENST00000366998 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
NEK2-201ENST00000366998 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.39■■□□□ 1.17
NEK2-201ENST00000366998 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.38■■□□□ 1.17
NEK2-201ENST00000366998 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.36■■□□□ 1.17
NEK2-201ENST00000366998 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
NEK2-201ENST00000366998 ATP10BO94823 1461 aa22.3■■□□□ 1.16
NEK2-201ENST00000366998 ADCY10Q96PN6 1610 aa22.29■■□□□ 1.16
NEK2-201ENST00000366998 UACAQ9BZF9 1416 aa22.28■■□□□ 1.16
NEK2-201ENST00000366998 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
NEK2-201ENST00000366998 MIA2Q96PC5 1412 aa22.27■■□□□ 1.16
NEK2-201ENST00000366998 KIF14Q15058 1648 aa22.26■■□□□ 1.15
NEK2-201ENST00000366998 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.26■■□□□ 1.15
NEK2-201ENST00000366998 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.26■■□□□ 1.15
NEK2-201ENST00000366998 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.24■■□□□ 1.15
NEK2-201ENST00000366998 ITSN2Q9NZM3 1697 aa22.23■■□□□ 1.15
NEK2-201ENST00000366998 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
NEK2-201ENST00000366998 ABCC2Q92887 1545 aa22.22■■□□□ 1.15
NEK2-201ENST00000366998 PTPRKQ15262 1439 aa22.2■■□□□ 1.14
NEK2-201ENST00000366998 OSCARQ8IYS5 282 aa22.15■■□□□ 1.14
NEK2-201ENST00000366998 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
NEK2-201ENST00000366998 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa22.14■■□□□ 1.13
NEK2-201ENST00000366998 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.13■■□□□ 1.13
NEK2-201ENST00000366998 HFM1A2PYH4 1435 aa22.12■■□□□ 1.13
NEK2-201ENST00000366998 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
NEK2-201ENST00000366998 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa22.11■■□□□ 1.13
NEK2-201ENST00000366998 ABCC10Q5T3U5 1492 aa22.11■■□□□ 1.13
NEK2-201ENST00000366998 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
NEK2-201ENST00000366998 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa22.1■■□□□ 1.13
NEK2-201ENST00000366998 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
NEK2-201ENST00000366998 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
NEK2-201ENST00000366998 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.09■■□□□ 1.13
NEK2-201ENST00000366998 DAPK1P53355 1430 aa22.07■■□□□ 1.12
NEK2-201ENST00000366998 NAIPQ13075 1403 aa22.07■■□□□ 1.12
NEK2-201ENST00000366998 GCC2Q8IWJ2 1684 aa22.07■■□□□ 1.12
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