RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358572.9

TMA16-201, Transcript of translation machinery associated 16 homolog, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMA16, Length 1,978 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMA16-201ENST00000358572 PBRM1Q86U86 1689 aa23.95■■□□□ 1.42
TMA16-201ENST00000358572 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
TMA16-201ENST00000358572 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
TMA16-201ENST00000358572 GRIN2BQ13224 1484 aa23.93■■□□□ 1.42
TMA16-201ENST00000358572 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.92■■□□□ 1.42
TMA16-201ENST00000358572 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
TMA16-201ENST00000358572 MAP3K1Q13233 1512 aa23.91■■□□□ 1.42
TMA16-201ENST00000358572 ADAMTS12P58397 1594 aa23.88■■□□□ 1.41
TMA16-201ENST00000358572 FHOD3Q2V2M9 1422 aa23.85■■□□□ 1.41
TMA16-201ENST00000358572 P3H3Q8IVL6 736 aa23.85■■□□□ 1.41
TMA16-201ENST00000358572 TIAM1Q13009 1591 aa23.83■■□□□ 1.4
TMA16-201ENST00000358572 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
TMA16-201ENST00000358572 SAMD9Q5K651 1589 aa23.82■■□□□ 1.4
TMA16-201ENST00000358572 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
TMA16-201ENST00000358572 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa23.78■■□□□ 1.4
TMA16-201ENST00000358572 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.78■■□□□ 1.4
TMA16-201ENST00000358572 FYCO1Q9BQS8 1478 aa23.77■■□□□ 1.4
TMA16-201ENST00000358572 FMN1Q68DA7 1419 aa23.76■■□□□ 1.39
TMA16-201ENST00000358572 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
TMA16-201ENST00000358572 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
TMA16-201ENST00000358572 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa23.73■■□□□ 1.39
TMA16-201ENST00000358572 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
TMA16-201ENST00000358572 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.72■■□□□ 1.39
TMA16-201ENST00000358572 CFAP43Q8NDM7 1665 aa23.72■■□□□ 1.39
TMA16-201ENST00000358572 IQGAP2Q13576 1575 aa23.7■■□□□ 1.38
TMA16-201ENST00000358572 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
TMA16-201ENST00000358572 GRIN2AQ12879 1464 aa23.65■■□□□ 1.38
TMA16-201ENST00000358572 CCNB3Q8WWL7 1395 aa23.63■■□□□ 1.37
TMA16-201ENST00000358572 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa23.62■■□□□ 1.37
TMA16-201ENST00000358572 UGGT2Q9NYU1 1516 aa23.62■■□□□ 1.37
TMA16-201ENST00000358572 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
TMA16-201ENST00000358572 SYNJ2O15056 1496 aa23.59■■□□□ 1.37
TMA16-201ENST00000358572 PHLDB1Q86UU1 1377 aa23.56■■□□□ 1.36
TMA16-201ENST00000358572 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
TMA16-201ENST00000358572 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa23.51■■□□□ 1.35
TMA16-201ENST00000358572 DISP1Q96F81 1524 aa23.49■■□□□ 1.35
TMA16-201ENST00000358572 CEP170Q5SW79 1584 aa23.49■■□□□ 1.35
TMA16-201ENST00000358572 NUP160Q12769 1436 aa23.47■■□□□ 1.35
TMA16-201ENST00000358572 KIAA0556O60303 1618 aa23.46■■□□□ 1.35
TMA16-201ENST00000358572 CCDC18Q5T9S5 1454 aa23.45■■□□□ 1.34
TMA16-201ENST00000358572 MTUS2Q5JR59 1369 aa23.44■■□□□ 1.34
TMA16-201ENST00000358572 HECW1Q76N89 1606 aa23.43■■□□□ 1.34
TMA16-201ENST00000358572 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP23.41■■□□□ 1.34
TMA16-201ENST00000358572 FBLN2P98095 1184 aa23.4■■□□□ 1.34
TMA16-201ENST00000358572 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
TMA16-201ENST00000358572 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa23.39■■□□□ 1.33
TMA16-201ENST00000358572 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa23.37■■□□□ 1.33
TMA16-201ENST00000358572 NCOA2Q15596 1464 aa23.35■■□□□ 1.33
TMA16-201ENST00000358572 ITGAEP38570 1179 aa23.34■■□□□ 1.33
TMA16-201ENST00000358572 FGD6Q6ZV73 1430 aa23.34■■□□□ 1.33
TMA16-201ENST00000358572 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
TMA16-201ENST00000358572 ARHGEF11O15085 1522 aa23.33■■□□□ 1.33
TMA16-201ENST00000358572 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
TMA16-201ENST00000358572 JPH4Q96JJ6 628 aa23.32■■□□□ 1.32
TMA16-201ENST00000358572 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
TMA16-201ENST00000358572 CLSPNQ9HAW4 1339 aa23.31■■□□□ 1.32
TMA16-201ENST00000358572 MYOM3Q5VTT5 1437 aa23.3■■□□□ 1.32
TMA16-201ENST00000358572 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
TMA16-201ENST00000358572 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
TMA16-201ENST00000358572 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa23.28■■□□□ 1.32
TMA16-201ENST00000358572 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa23.27■■□□□ 1.32
TMA16-201ENST00000358572 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa23.25■■□□□ 1.31
TMA16-201ENST00000358572 SETD5Q9C0A6 1442 aa23.25■■□□□ 1.31
TMA16-201ENST00000358572 PLB1Q6P1J6 1458 aa23.19■■□□□ 1.3
TMA16-201ENST00000358572 ARID3CA6NKF2 412 aa23.18■■□□□ 1.3
TMA16-201ENST00000358572 CHD1O14646 1710 aa23.17■■□□□ 1.3
TMA16-201ENST00000358572 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
TMA16-201ENST00000358572 PTPN23Q9H3S7 1636 aa23.15■■□□□ 1.3
TMA16-201ENST00000358572 PTPRKQ15262 1439 aa23.15■■□□□ 1.3
TMA16-201ENST00000358572 MIA2Q96PC5 1412 aa23.13■■□□□ 1.29
TMA16-201ENST00000358572 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
TMA16-201ENST00000358572 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
TMA16-201ENST00000358572 ABCA8O94911 1581 aa23.11■■□□□ 1.29
TMA16-201ENST00000358572 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.28
TMA16-201ENST00000358572 SHROOM2Q13796 1616 aa23.07■■□□□ 1.28
TMA16-201ENST00000358572 HFM1A2PYH4 1435 aa23.07■■□□□ 1.28
TMA16-201ENST00000358572 MAPKBP1O60336 1514 aa23.06■■□□□ 1.28
TMA16-201ENST00000358572 PTPRGP23470 1445 aa23.03■■□□□ 1.28
TMA16-201ENST00000358572 NAIPQ13075 1403 aa23.01■■□□□ 1.27
TMA16-201ENST00000358572 ATP10BO94823 1461 aa23.01■■□□□ 1.27
TMA16-201ENST00000358572 ADCY10Q96PN6 1610 aa22.99■■□□□ 1.27
TMA16-201ENST00000358572 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
TMA16-201ENST00000358572 AKNAQ7Z591 1439 aa22.96■■□□□ 1.27
TMA16-201ENST00000358572 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.95■■□□□ 1.26
TMA16-201ENST00000358572 KIF14Q15058 1648 aa22.93■■□□□ 1.26
TMA16-201ENST00000358572 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
TMA16-201ENST00000358572 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.92■■□□□ 1.26
TMA16-201ENST00000358572 UACAQ9BZF9 1416 aa22.91■■□□□ 1.26
TMA16-201ENST00000358572 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.9■■□□□ 1.26
TMA16-201ENST00000358572 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.26
TMA16-201ENST00000358572 DAPK1P53355 1430 aa22.89■■□□□ 1.26
TMA16-201ENST00000358572 ITSN2Q9NZM3 1697 aa22.88■■□□□ 1.25
TMA16-201ENST00000358572 GCC2Q8IWJ2 1684 aa22.88■■□□□ 1.25
TMA16-201ENST00000358572 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
TMA16-201ENST00000358572 ABCC5O15440 1437 aa22.88■■□□□ 1.25
TMA16-201ENST00000358572 ABCC10Q5T3U5 1492 aa22.87■■□□□ 1.25
TMA16-201ENST00000358572 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.87■■□□□ 1.25
TMA16-201ENST00000358572 ROCK1Q13464 1354 aa22.86■■□□□ 1.25
TMA16-201ENST00000358572 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
TMA16-201ENST00000358572 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.3 ms