RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000354694.11

PES1-202, Transcript of pescadillo ribosomal biogenesis factor 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PES1, Length 2,295 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PES1-202ENST00000354694 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
PES1-202ENST00000354694 GRIN2BQ13224 1484 aa25.26■■□□□ 1.63
PES1-202ENST00000354694 ADAMTS12P58397 1594 aa25.24■■□□□ 1.63
PES1-202ENST00000354694 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.21■■□□□ 1.63
PES1-202ENST00000354694 APLP2Q06481 763 aa25.2■■□□□ 1.63
PES1-202ENST00000354694 P3H3Q8IVL6 736 aa25.17■■□□□ 1.62
PES1-202ENST00000354694 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.14■■□□□ 1.61
PES1-202ENST00000354694 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.11■■□□□ 1.61
PES1-202ENST00000354694 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.1■■□□□ 1.61
PES1-202ENST00000354694 SAMD9Q5K651 1589 aa25.04■■□□□ 1.6
PES1-202ENST00000354694 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
PES1-202ENST00000354694 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
PES1-202ENST00000354694 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
PES1-202ENST00000354694 IQGAP2Q13576 1575 aa25.02■■□□□ 1.6
PES1-202ENST00000354694 GRIN2AQ12879 1464 aa25■■□□□ 1.59
PES1-202ENST00000354694 TIAM1Q13009 1591 aa24.95■■□□□ 1.58
PES1-202ENST00000354694 SYNJ2O15056 1496 aa24.94■■□□□ 1.58
PES1-202ENST00000354694 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
PES1-202ENST00000354694 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
PES1-202ENST00000354694 FBLN2P98095 1184 aa24.92■■□□□ 1.58
PES1-202ENST00000354694 FMN1Q68DA7 1419 aa24.9■■□□□ 1.58
PES1-202ENST00000354694 FYCO1Q9BQS8 1478 aa24.9■■□□□ 1.58
PES1-202ENST00000354694 CFAP43Q8NDM7 1665 aa24.89■■□□□ 1.58
PES1-202ENST00000354694 MAP3K1Q13233 1512 aa24.89■■□□□ 1.58
PES1-202ENST00000354694 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa24.89■■□□□ 1.57
PES1-202ENST00000354694 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa24.88■■□□□ 1.57
PES1-202ENST00000354694 CEP170Q5SW79 1584 aa24.88■■□□□ 1.57
PES1-202ENST00000354694 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa24.85■■□□□ 1.57
PES1-202ENST00000354694 UGGT2Q9NYU1 1516 aa24.85■■□□□ 1.57
PES1-202ENST00000354694 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa24.82■■□□□ 1.56
PES1-202ENST00000354694 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
PES1-202ENST00000354694 DISP1Q96F81 1524 aa24.77■■□□□ 1.56
PES1-202ENST00000354694 NUP160Q12769 1436 aa24.77■■□□□ 1.56
PES1-202ENST00000354694 KIAA0556O60303 1618 aa24.76■■□□□ 1.55
PES1-202ENST00000354694 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
PES1-202ENST00000354694 CHD1O14646 1710 aa24.75■■□□□ 1.55
PES1-202ENST00000354694 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
PES1-202ENST00000354694 PHLDB1Q86UU1 1377 aa24.65■■□□□ 1.54
PES1-202ENST00000354694 HECW1Q76N89 1606 aa24.65■■□□□ 1.54
PES1-202ENST00000354694 JPH4Q96JJ6 628 aa24.65■■□□□ 1.54
PES1-202ENST00000354694 CCNB3Q8WWL7 1395 aa24.64■■□□□ 1.53
PES1-202ENST00000354694 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
PES1-202ENST00000354694 MTUS2Q5JR59 1369 aa24.61■■□□□ 1.53
PES1-202ENST00000354694 ARID3CA6NKF2 412 aa24.58■■□□□ 1.53
PES1-202ENST00000354694 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
PES1-202ENST00000354694 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
PES1-202ENST00000354694 CCDC18Q5T9S5 1454 aa24.58■■□□□ 1.53
PES1-202ENST00000354694 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.52
PES1-202ENST00000354694 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa24.57■■□□□ 1.52
PES1-202ENST00000354694 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa24.55■■□□□ 1.52
PES1-202ENST00000354694 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa24.55■■□□□ 1.52
PES1-202ENST00000354694 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.52■■□□□ 1.52
PES1-202ENST00000354694 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
PES1-202ENST00000354694 ITGAEP38570 1179 aa24.51■■□□□ 1.51
PES1-202ENST00000354694 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
PES1-202ENST00000354694 PLB1Q6P1J6 1458 aa24.49■■□□□ 1.51
PES1-202ENST00000354694 NCOA2Q15596 1464 aa24.48■■□□□ 1.51
PES1-202ENST00000354694 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
PES1-202ENST00000354694 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
PES1-202ENST00000354694 SHROOM2Q13796 1616 aa24.43■■□□□ 1.5
PES1-202ENST00000354694 FGD6Q6ZV73 1430 aa24.42■■□□□ 1.5
PES1-202ENST00000354694 ARHGEF11O15085 1522 aa24.4■■□□□ 1.5
PES1-202ENST00000354694 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.38■■□□□ 1.49
PES1-202ENST00000354694 ABCA8O94911 1581 aa24.37■■□□□ 1.49
PES1-202ENST00000354694 ERCC6L2Q5T890 1561 aa24.35■■□□□ 1.49
PES1-202ENST00000354694 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.34■■□□□ 1.49
PES1-202ENST00000354694 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP24.32■■□□□ 1.48
PES1-202ENST00000354694 PTPRGP23470 1445 aa24.32■■□□□ 1.48
PES1-202ENST00000354694 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24.3■■□□□ 1.48
PES1-202ENST00000354694 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
PES1-202ENST00000354694 ATP10BO94823 1461 aa24.24■■□□□ 1.47
PES1-202ENST00000354694 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
PES1-202ENST00000354694 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa24.24■■□□□ 1.47
PES1-202ENST00000354694 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
PES1-202ENST00000354694 KIF14Q15058 1648 aa24.22■■□□□ 1.47
PES1-202ENST00000354694 PTPRKQ15262 1439 aa24.21■■□□□ 1.47
PES1-202ENST00000354694 SETD5Q9C0A6 1442 aa24.21■■□□□ 1.47
PES1-202ENST00000354694 ADCY10Q96PN6 1610 aa24.19■■□□□ 1.46
PES1-202ENST00000354694 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
PES1-202ENST00000354694 UACAQ9BZF9 1416 aa24.17■■□□□ 1.46
PES1-202ENST00000354694 MIA2Q96PC5 1412 aa24.17■■□□□ 1.46
PES1-202ENST00000354694 PLEKHD1A6NEE1 506 aa24.14■■□□□ 1.45
PES1-202ENST00000354694 ITSN2Q9NZM3 1697 aa24.11■■□□□ 1.45
PES1-202ENST00000354694 ABCC2Q92887 1545 aa24.1■■□□□ 1.45
PES1-202ENST00000354694 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
PES1-202ENST00000354694 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa24.09■■□□□ 1.45
PES1-202ENST00000354694 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
PES1-202ENST00000354694 CHIC2Q9UKJ5 165 aa24.06■■□□□ 1.44
PES1-202ENST00000354694 HFM1A2PYH4 1435 aa24.05■■□□□ 1.44
PES1-202ENST00000354694 CLSPNQ9HAW4 1339 aa24.05■■□□□ 1.44
PES1-202ENST00000354694 ABCC10Q5T3U5 1492 aa24.03■■□□□ 1.44
PES1-202ENST00000354694 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
PES1-202ENST00000354694 NAIPQ13075 1403 aa24.03■■□□□ 1.44
PES1-202ENST00000354694 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
PES1-202ENST00000354694 OSCARQ8IYS5 282 aa24.01■■□□□ 1.43
PES1-202ENST00000354694 MAPKBP1O60336 1514 aa24■■□□□ 1.43
PES1-202ENST00000354694 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa24■■□□□ 1.43
PES1-202ENST00000354694 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa24■■□□□ 1.43
PES1-202ENST00000354694 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
PES1-202ENST00000354694 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 123.6 ms