RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000352068.5

SNX15-201, Transcript of sorting nexin 15, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SNX15, Length 771 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15-201ENST00000352068 HECW2Q9P2P5 1572 aa22.95■■□□□ 1.26
SNX15-201ENST00000352068 ADAMTS12P58397 1594 aa22.93■■□□□ 1.26
SNX15-201ENST00000352068 FBXO41Q8TF61 875 aa22.93■■□□□ 1.26
SNX15-201ENST00000352068 TSPOAP1O95153 1857 aa22.92■■□□□ 1.26
SNX15-201ENST00000352068 ADGRL1O94910 1474 aa22.92■■□□□ 1.26
SNX15-201ENST00000352068 JPH4Q96JJ6 628 aa22.89■■□□□ 1.25
SNX15-201ENST00000352068 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.88■■□□□ 1.25
SNX15-201ENST00000352068 ADCY10Q96PN6 1610 aa22.81■■□□□ 1.24
SNX15-201ENST00000352068 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.72■■□□□ 1.23
SNX15-201ENST00000352068 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.71■■□□□ 1.23
SNX15-201ENST00000352068 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.62■■□□□ 1.21
SNX15-201ENST00000352068 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
SNX15-201ENST00000352068 LMTK3Q96Q04 1460 aa22.6■■□□□ 1.21
SNX15-201ENST00000352068 GLI2P10070 1586 aa22.59■■□□□ 1.21
SNX15-201ENST00000352068 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
SNX15-201ENST00000352068 TOP2BQ02880 1626 aa22.55■■□□□ 1.2
SNX15-201ENST00000352068 PLB1Q6P1J6 1458 aa22.54■■□□□ 1.2
SNX15-201ENST00000352068 ASXL2Q76L83 1435 aa22.51■■□□□ 1.19
SNX15-201ENST00000352068 ABCC2Q92887 1545 aa22.48■■□□□ 1.19
SNX15-201ENST00000352068 PTPRGP23470 1445 aa22.48■■□□□ 1.19
SNX15-201ENST00000352068 TEX14Q8IWB6 1497 aa22.47■■□□□ 1.19
SNX15-201ENST00000352068 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.47■■□□□ 1.19
SNX15-201ENST00000352068 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.46■■□□□ 1.19
SNX15-201ENST00000352068 SOCS7O14512 581 aa22.45■■□□□ 1.18
SNX15-201ENST00000352068 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa22.4■■□□□ 1.18
SNX15-201ENST00000352068 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
SNX15-201ENST00000352068 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.35■■□□□ 1.17
SNX15-201ENST00000352068 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
SNX15-201ENST00000352068 CUL7Q14999 1698 aa22.34■■□□□ 1.17
SNX15-201ENST00000352068 ILDR2Q71H61 639 aa22.33■■□□□ 1.17
SNX15-201ENST00000352068 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa22.33■■□□□ 1.16
SNX15-201ENST00000352068 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.3■■□□□ 1.16
SNX15-201ENST00000352068 DISP3Q9P2K9 1392 aa22.26■■□□□ 1.15
SNX15-201ENST00000352068 UACAQ9BZF9 1416 aa22.26■■□□□ 1.15
SNX15-201ENST00000352068 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.23■■□□□ 1.15
SNX15-201ENST00000352068 PTPRMP28827 1452 aa22.21■■□□□ 1.15
SNX15-201ENST00000352068 KIF21BO75037 1637 aa22.2■■□□□ 1.14
SNX15-201ENST00000352068 IGF1RP08069 1367 aa22.17■■□□□ 1.14
SNX15-201ENST00000352068 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
SNX15-201ENST00000352068 CERKQ8TCT0 537 aa22.15■■□□□ 1.14
SNX15-201ENST00000352068 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.15■■□□□ 1.14
SNX15-201ENST00000352068 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
SNX15-201ENST00000352068 ADAMTSL3P82987 1691 aa22.13■■□□□ 1.13
SNX15-201ENST00000352068 CD109Q6YHK3 1445 aa22.12■■□□□ 1.13
SNX15-201ENST00000352068 WDR7Q9Y4E6 1490 aa22.11■■□□□ 1.13
SNX15-201ENST00000352068 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.07■■□□□ 1.12
SNX15-201ENST00000352068 IQGAP2Q13576 1575 aa22.05■■□□□ 1.12
SNX15-201ENST00000352068 DISP1Q96F81 1524 aa22.04■■□□□ 1.12
SNX15-201ENST00000352068 KIF27Q86VH2 1401 aa22.03■■□□□ 1.12
SNX15-201ENST00000352068 ARAP3Q8WWN8 1544 aa22.01■■□□□ 1.11
SNX15-201ENST00000352068 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.99■■□□□ 1.11
SNX15-201ENST00000352068 KCNH8Q96L42 1107 aa21.99■■□□□ 1.11
SNX15-201ENST00000352068 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa21.96■■□□□ 1.11
SNX15-201ENST00000352068 HSPA2P54652 639 aa21.96■■□□□ 1.11
SNX15-201ENST00000352068 BCORL1Q5H9F3 1711 aa21.96■■□□□ 1.11
SNX15-201ENST00000352068 MADDQ8WXG6 1647 aa21.95■■□□□ 1.1
SNX15-201ENST00000352068 PHLDB1Q86UU1 1377 aa21.91■■□□□ 1.1
SNX15-201ENST00000352068 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
SNX15-201ENST00000352068 UGGT2Q9NYU1 1516 aa21.89■■□□□ 1.09
SNX15-201ENST00000352068 KIAA0556O60303 1618 aa21.85■■□□□ 1.09
SNX15-201ENST00000352068 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
SNX15-201ENST00000352068 RAPGEF3O95398 923 aa21.83■■□□□ 1.09
SNX15-201ENST00000352068 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
SNX15-201ENST00000352068 DMRT2Q9Y5R5 561 aa21.75■■□□□ 1.07
SNX15-201ENST00000352068 ABCA8O94911 1581 aa21.74■■□□□ 1.07
SNX15-201ENST00000352068 PLPPR3Q6T4P5 718 aa21.74■■□□□ 1.07
SNX15-201ENST00000352068 NEO1Q92859 1461 aa21.73■■□□□ 1.07
SNX15-201ENST00000352068 POGZQ7Z3K3 1410 aa21.7■■□□□ 1.06
SNX15-201ENST00000352068 YEATS2Q9ULM3 1422 aa21.69■■□□□ 1.06
SNX15-201ENST00000352068 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa21.69■■□□□ 1.06
SNX15-201ENST00000352068 ABCA9Q8IUA7 1624 aa21.69■■□□□ 1.06
SNX15-201ENST00000352068 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa21.66■■□□□ 1.06
SNX15-201ENST00000352068 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa21.65■■□□□ 1.06
SNX15-201ENST00000352068 GOLGA3Q08378 1498 aa21.64■■□□□ 1.06
SNX15-201ENST00000352068 FANCAO15360 1455 aa21.63■■□□□ 1.05
SNX15-201ENST00000352068 STRCQ7RTU9 1775 aa21.6■■□□□ 1.05
SNX15-201ENST00000352068 AKNAQ7Z591 1439 aa21.58■■□□□ 1.05
SNX15-201ENST00000352068 PREX1Q8TCU6 1659 aa21.58■■□□□ 1.05
SNX15-201ENST00000352068 ATP10BO94823 1461 aa21.58■■□□□ 1.04
SNX15-201ENST00000352068 TTC37Q6PGP7 1564 aa21.57■■□□□ 1.04
SNX15-201ENST00000352068 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
SNX15-201ENST00000352068 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
SNX15-201ENST00000352068 IQSEC2Q5JU85 1478 aa21.56■■□□□ 1.04
SNX15-201ENST00000352068 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa21.55■■□□□ 1.04
SNX15-201ENST00000352068 ARID3CA6NKF2 412 aa21.54■■□□□ 1.04
SNX15-201ENST00000352068 RICTORQ6R327 1708 aa21.54■■□□□ 1.04
SNX15-201ENST00000352068 FHOD3Q2V2M9 1422 aa21.54■■□□□ 1.04
SNX15-201ENST00000352068 PTPRTO14522 1441 aa21.53■■□□□ 1.04
SNX15-201ENST00000352068 MLECQ14165 292 aa21.52■■□□□ 1.04
SNX15-201ENST00000352068 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa21.5■■□□□ 1.03
SNX15-201ENST00000352068 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
SNX15-201ENST00000352068 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa21.49■■□□□ 1.03
SNX15-201ENST00000352068 LTBP4Q8N2S1 1624 aa21.47■■□□□ 1.03
SNX15-201ENST00000352068 EFCAB5A4FU69 1503 aa21.47■■□□□ 1.03
SNX15-201ENST00000352068 MAGI2Q86UL8 1455 aa21.46■■□□□ 1.03
SNX15-201ENST00000352068 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa21.46■■□□□ 1.03
SNX15-201ENST00000352068 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa21.46■■□□□ 1.03
SNX15-201ENST00000352068 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa21.46■■□□□ 1.03
SNX15-201ENST00000352068 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
SNX15-201ENST00000352068 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa21.43■■□□□ 1.02
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