RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345957.8

SNX16-201, Transcript of sorting nexin 16, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SNX16, Length 1,853 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX16-201ENST00000345957 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.59■■□□□ 1.85
SNX16-201ENST00000345957 MAP3K1Q13233 1512 aa26.57■■□□□ 1.84
SNX16-201ENST00000345957 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
SNX16-201ENST00000345957 GRIN2BQ13224 1484 aa26.54■■□□□ 1.84
SNX16-201ENST00000345957 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.52■■□□□ 1.84
SNX16-201ENST00000345957 ADAMTS12P58397 1594 aa26.51■■□□□ 1.83
SNX16-201ENST00000345957 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
SNX16-201ENST00000345957 TIAM1Q13009 1591 aa26.47■■□□□ 1.83
SNX16-201ENST00000345957 FHOD3Q2V2M9 1422 aa26.45■■□□□ 1.83
SNX16-201ENST00000345957 SAMD9Q5K651 1589 aa26.44■■□□□ 1.82
SNX16-201ENST00000345957 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
SNX16-201ENST00000345957 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
SNX16-201ENST00000345957 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
SNX16-201ENST00000345957 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
SNX16-201ENST00000345957 FYCO1Q9BQS8 1478 aa26.43■■□□□ 1.82
SNX16-201ENST00000345957 FMN1Q68DA7 1419 aa26.41■■□□□ 1.82
SNX16-201ENST00000345957 P3H3Q8IVL6 736 aa26.4■■□□□ 1.82
SNX16-201ENST00000345957 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa26.39■■□□□ 1.82
SNX16-201ENST00000345957 CFAP43Q8NDM7 1665 aa26.39■■□□□ 1.81
SNX16-201ENST00000345957 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
SNX16-201ENST00000345957 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
SNX16-201ENST00000345957 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa26.35■■□□□ 1.81
SNX16-201ENST00000345957 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
SNX16-201ENST00000345957 IQGAP2Q13576 1575 aa26.32■■□□□ 1.8
SNX16-201ENST00000345957 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.3■■□□□ 1.8
SNX16-201ENST00000345957 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
SNX16-201ENST00000345957 CCNB3Q8WWL7 1395 aa26.25■■□□□ 1.79
SNX16-201ENST00000345957 GRIN2AQ12879 1464 aa26.22■■□□□ 1.79
SNX16-201ENST00000345957 UGGT2Q9NYU1 1516 aa26.21■■□□□ 1.79
SNX16-201ENST00000345957 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
SNX16-201ENST00000345957 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa26.2■■□□□ 1.78
SNX16-201ENST00000345957 SYNJ2O15056 1496 aa26.16■■□□□ 1.78
SNX16-201ENST00000345957 PHLDB1Q86UU1 1377 aa26.12■■□□□ 1.77
SNX16-201ENST00000345957 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.09■■□□□ 1.77
SNX16-201ENST00000345957 HECW1Q76N89 1606 aa26.07■■□□□ 1.76
SNX16-201ENST00000345957 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
SNX16-201ENST00000345957 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa26.06■■□□□ 1.76
SNX16-201ENST00000345957 MTUS2Q5JR59 1369 aa26.05■■□□□ 1.76
SNX16-201ENST00000345957 KIAA0556O60303 1618 aa26.04■■□□□ 1.76
SNX16-201ENST00000345957 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa26.02■■□□□ 1.76
SNX16-201ENST00000345957 DISP1Q96F81 1524 aa26.02■■□□□ 1.76
SNX16-201ENST00000345957 CEP170Q5SW79 1584 aa26.02■■□□□ 1.76
SNX16-201ENST00000345957 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP26.01■■□□□ 1.75
SNX16-201ENST00000345957 NUP160Q12769 1436 aa26■■□□□ 1.75
SNX16-201ENST00000345957 CLSPNQ9HAW4 1339 aa25.96■■□□□ 1.75
SNX16-201ENST00000345957 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
SNX16-201ENST00000345957 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
SNX16-201ENST00000345957 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.92■■□□□ 1.74
SNX16-201ENST00000345957 FBLN2P98095 1184 aa25.92■■□□□ 1.74
SNX16-201ENST00000345957 NCOA2Q15596 1464 aa25.92■■□□□ 1.74
SNX16-201ENST00000345957 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
SNX16-201ENST00000345957 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
SNX16-201ENST00000345957 ITGAEP38570 1179 aa25.9■■□□□ 1.74
SNX16-201ENST00000345957 ARHGEF11O15085 1522 aa25.88■■□□□ 1.73
SNX16-201ENST00000345957 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.87■■□□□ 1.73
SNX16-201ENST00000345957 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa25.87■■□□□ 1.73
SNX16-201ENST00000345957 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa25.87■■□□□ 1.73
SNX16-201ENST00000345957 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa25.85■■□□□ 1.73
SNX16-201ENST00000345957 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
SNX16-201ENST00000345957 SETD5Q9C0A6 1442 aa25.83■■□□□ 1.73
SNX16-201ENST00000345957 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa25.81■■□□□ 1.72
SNX16-201ENST00000345957 JPH4Q96JJ6 628 aa25.81■■□□□ 1.72
SNX16-201ENST00000345957 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
SNX16-201ENST00000345957 PTPN23Q9H3S7 1636 aa25.73■■□□□ 1.71
SNX16-201ENST00000345957 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
SNX16-201ENST00000345957 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
SNX16-201ENST00000345957 MIA2Q96PC5 1412 aa25.7■■□□□ 1.7
SNX16-201ENST00000345957 CHD1O14646 1710 aa25.69■■□□□ 1.7
SNX16-201ENST00000345957 PLB1Q6P1J6 1458 aa25.68■■□□□ 1.7
SNX16-201ENST00000345957 ARID3CA6NKF2 412 aa25.64■■□□□ 1.7
SNX16-201ENST00000345957 ABCA8O94911 1581 aa25.63■■□□□ 1.69
SNX16-201ENST00000345957 HFM1A2PYH4 1435 aa25.63■■□□□ 1.69
SNX16-201ENST00000345957 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
SNX16-201ENST00000345957 PTPRKQ15262 1439 aa25.61■■□□□ 1.69
SNX16-201ENST00000345957 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
SNX16-201ENST00000345957 MAPKBP1O60336 1514 aa25.58■■□□□ 1.69
SNX16-201ENST00000345957 SHROOM2Q13796 1616 aa25.57■■□□□ 1.68
SNX16-201ENST00000345957 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
SNX16-201ENST00000345957 ADCY10Q96PN6 1610 aa25.55■■□□□ 1.68
SNX16-201ENST00000345957 AKNAQ7Z591 1439 aa25.54■■□□□ 1.68
SNX16-201ENST00000345957 NAIPQ13075 1403 aa25.53■■□□□ 1.68
SNX16-201ENST00000345957 PTPRGP23470 1445 aa25.52■■□□□ 1.68
SNX16-201ENST00000345957 ITSN2Q9NZM3 1697 aa25.48■■□□□ 1.67
SNX16-201ENST00000345957 ATP10BO94823 1461 aa25.48■■□□□ 1.67
SNX16-201ENST00000345957 UACAQ9BZF9 1416 aa25.46■■□□□ 1.67
SNX16-201ENST00000345957 GCC2Q8IWJ2 1684 aa25.46■■□□□ 1.67
SNX16-201ENST00000345957 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
SNX16-201ENST00000345957 PLEKHD1A6NEE1 506 aa25.43■■□□□ 1.66
SNX16-201ENST00000345957 KIF14Q15058 1648 aa25.43■■□□□ 1.66
SNX16-201ENST00000345957 OSCARQ8IYS5 282 aa25.43■■□□□ 1.66
SNX16-201ENST00000345957 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.42■■□□□ 1.66
SNX16-201ENST00000345957 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
SNX16-201ENST00000345957 DAPK1P53355 1430 aa25.41■■□□□ 1.66
SNX16-201ENST00000345957 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
SNX16-201ENST00000345957 ROCK1Q13464 1354 aa25.4■■□□□ 1.66
SNX16-201ENST00000345957 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa25.37■■□□□ 1.65
SNX16-201ENST00000345957 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
SNX16-201ENST00000345957 ABCC5O15440 1437 aa25.37■■□□□ 1.65
SNX16-201ENST00000345957 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
SNX16-201ENST00000345957 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.3 ms