RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344548.7

CDC42-202, Transcript of cell division cycle 42, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CDC42, Length 2,256 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42-202ENST00000344548 P3H3Q8IVL6 736 aa21.15■□□□□ 0.98
CDC42-202ENST00000344548 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.13■□□□□ 0.97
CDC42-202ENST00000344548 ADAMTS12P58397 1594 aa21.13■□□□□ 0.97
CDC42-202ENST00000344548 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa21.12■□□□□ 0.97
CDC42-202ENST00000344548 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.09■□□□□ 0.97
CDC42-202ENST00000344548 FHOD3Q2V2M9 1422 aa21.05■□□□□ 0.96
CDC42-202ENST00000344548 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP21.03■□□□□ 0.96
CDC42-202ENST00000344548 APLP2Q06481 763 aa21.02■□□□□ 0.96
CDC42-202ENST00000344548 EFCAB5A4FU69 1503 aa20.96■□□□□ 0.95
CDC42-202ENST00000344548 GRIN2AQ12879 1464 aa20.96■□□□□ 0.95
CDC42-202ENST00000344548 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
CDC42-202ENST00000344548 SAMD9Q5K651 1589 aa20.94■□□□□ 0.94
CDC42-202ENST00000344548 HRCP23327 699 aa20.93■□□□□ 0.94
CDC42-202ENST00000344548 FBLN2P98095 1184 aa20.93■□□□□ 0.94
CDC42-202ENST00000344548 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
CDC42-202ENST00000344548 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
CDC42-202ENST00000344548 IQGAP2Q13576 1575 aa20.92■□□□□ 0.94
CDC42-202ENST00000344548 SYNJ2O15056 1496 aa20.91■□□□□ 0.94
CDC42-202ENST00000344548 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
CDC42-202ENST00000344548 CEP170Q5SW79 1584 aa20.86■□□□□ 0.93
CDC42-202ENST00000344548 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa20.86■□□□□ 0.93
CDC42-202ENST00000344548 TIAM1Q13009 1591 aa20.84■□□□□ 0.93
CDC42-202ENST00000344548 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa20.83■□□□□ 0.92
CDC42-202ENST00000344548 FMN1Q68DA7 1419 aa20.81■□□□□ 0.92
CDC42-202ENST00000344548 UGGT2Q9NYU1 1516 aa20.81■□□□□ 0.92
CDC42-202ENST00000344548 FYCO1Q9BQS8 1478 aa20.8■□□□□ 0.92
CDC42-202ENST00000344548 MAP3K1Q13233 1512 aa20.79■□□□□ 0.92
CDC42-202ENST00000344548 NUP160Q12769 1436 aa20.78■□□□□ 0.92
CDC42-202ENST00000344548 DISP1Q96F81 1524 aa20.78■□□□□ 0.92
CDC42-202ENST00000344548 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa20.77■□□□□ 0.92
CDC42-202ENST00000344548 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa20.76■□□□□ 0.91
CDC42-202ENST00000344548 CFAP43Q8NDM7 1665 aa20.75■□□□□ 0.91
CDC42-202ENST00000344548 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
CDC42-202ENST00000344548 KIAA0556O60303 1618 aa20.72■□□□□ 0.91
CDC42-202ENST00000344548 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
CDC42-202ENST00000344548 JPH4Q96JJ6 628 aa20.7■□□□□ 0.9
CDC42-202ENST00000344548 CHD1O14646 1710 aa20.68■□□□□ 0.9
CDC42-202ENST00000344548 PHLDB1Q86UU1 1377 aa20.67■□□□□ 0.9
CDC42-202ENST00000344548 ARID3CA6NKF2 412 aa20.66■□□□□ 0.9
CDC42-202ENST00000344548 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
CDC42-202ENST00000344548 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa20.61■□□□□ 0.89
CDC42-202ENST00000344548 CCNB3Q8WWL7 1395 aa20.6■□□□□ 0.89
CDC42-202ENST00000344548 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
CDC42-202ENST00000344548 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
CDC42-202ENST00000344548 MTUS2Q5JR59 1369 aa20.57■□□□□ 0.88
CDC42-202ENST00000344548 HECW1Q76N89 1606 aa20.57■□□□□ 0.88
CDC42-202ENST00000344548 PLB1Q6P1J6 1458 aa20.56■□□□□ 0.88
CDC42-202ENST00000344548 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
CDC42-202ENST00000344548 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
CDC42-202ENST00000344548 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa20.54■□□□□ 0.88
CDC42-202ENST00000344548 ITGAEP38570 1179 aa20.53■□□□□ 0.88
CDC42-202ENST00000344548 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
CDC42-202ENST00000344548 CCDC18Q5T9S5 1454 aa20.52■□□□□ 0.88
CDC42-202ENST00000344548 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa20.52■□□□□ 0.88
CDC42-202ENST00000344548 NCOA2Q15596 1464 aa20.49■□□□□ 0.87
CDC42-202ENST00000344548 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
CDC42-202ENST00000344548 ERCC6L2Q5T890 1561 aa20.48■□□□□ 0.87
CDC42-202ENST00000344548 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa20.47■□□□□ 0.87
CDC42-202ENST00000344548 SHROOM2Q13796 1616 aa20.45■□□□□ 0.86
CDC42-202ENST00000344548 ARHGEF11O15085 1522 aa20.43■□□□□ 0.86
CDC42-202ENST00000344548 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
CDC42-202ENST00000344548 FGD6Q6ZV73 1430 aa20.43■□□□□ 0.86
CDC42-202ENST00000344548 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
CDC42-202ENST00000344548 CLASP1Q7Z460 1538 aa20.42■□□□□ 0.86
CDC42-202ENST00000344548 ABCA8O94911 1581 aa20.41■□□□□ 0.86
CDC42-202ENST00000344548 PTPRGP23470 1445 aa20.4■□□□□ 0.86
CDC42-202ENST00000344548 MYOM3Q5VTT5 1437 aa20.39■□□□□ 0.86
CDC42-202ENST00000344548 ATP10BO94823 1461 aa20.35■□□□□ 0.85
CDC42-202ENST00000344548 PTPRKQ15262 1439 aa20.33■□□□□ 0.84
CDC42-202ENST00000344548 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP20.32■□□□□ 0.848e-13■■□□□ 13.2
CDC42-202ENST00000344548 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
CDC42-202ENST00000344548 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
CDC42-202ENST00000344548 PTPN23Q9H3S7 1636 aa20.29■□□□□ 0.84
CDC42-202ENST00000344548 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa20.28■□□□□ 0.84
CDC42-202ENST00000344548 KIF14Q15058 1648 aa20.28■□□□□ 0.84
CDC42-202ENST00000344548 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
CDC42-202ENST00000344548 UACAQ9BZF9 1416 aa20.27■□□□□ 0.84
CDC42-202ENST00000344548 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
CDC42-202ENST00000344548 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
CDC42-202ENST00000344548 SETD5Q9C0A6 1442 aa20.23■□□□□ 0.83
CDC42-202ENST00000344548 PLEKHD1A6NEE1 506 aa20.23■□□□□ 0.83
CDC42-202ENST00000344548 MIA2Q96PC5 1412 aa20.21■□□□□ 0.83
CDC42-202ENST00000344548 OSCARQ8IYS5 282 aa20.19■□□□□ 0.82
CDC42-202ENST00000344548 ADCY10Q96PN6 1610 aa20.19■□□□□ 0.82
CDC42-202ENST00000344548 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
CDC42-202ENST00000344548 CHIC2Q9UKJ5 165 aa20.18■□□□□ 0.82
CDC42-202ENST00000344548 ABCC2Q92887 1545 aa20.18■□□□□ 0.82
CDC42-202ENST00000344548 ABCC10Q5T3U5 1492 aa20.15■□□□□ 0.82
CDC42-202ENST00000344548 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
CDC42-202ENST00000344548 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa20.13■□□□□ 0.81
CDC42-202ENST00000344548 NAIPQ13075 1403 aa20.12■□□□□ 0.81
CDC42-202ENST00000344548 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
CDC42-202ENST00000344548 HFM1A2PYH4 1435 aa20.11■□□□□ 0.81
CDC42-202ENST00000344548 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa20.09■□□□□ 0.81
CDC42-202ENST00000344548 ABCC5O15440 1437 aa20.09■□□□□ 0.81
CDC42-202ENST00000344548 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa20.08■□□□□ 0.81
CDC42-202ENST00000344548 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa20.08■□□□□ 0.81
CDC42-202ENST00000344548 MAPKBP1O60336 1514 aa20.08■□□□□ 0.8
CDC42-202ENST00000344548 DAPK1P53355 1430 aa20.08■□□□□ 0.8
CDC42-202ENST00000344548 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.3 ms