RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000338546.9

HPS1-202, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HPS1, Length 1,580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-202ENST00000338546 ADAMTS12P58397 1594 aa25.15■■□□□ 1.62
HPS1-202ENST00000338546 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
HPS1-202ENST00000338546 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
HPS1-202ENST00000338546 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
HPS1-202ENST00000338546 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
HPS1-202ENST00000338546 MAP3K1Q13233 1512 aa25.02■■□□□ 1.6
HPS1-202ENST00000338546 HRCP23327 699 aa25.01■■□□□ 1.59
HPS1-202ENST00000338546 SAMD9Q5K651 1589 aa24.99■■□□□ 1.59
HPS1-202ENST00000338546 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.97■■□□□ 1.59
HPS1-202ENST00000338546 FMN1Q68DA7 1419 aa24.93■■□□□ 1.58
HPS1-202ENST00000338546 IQGAP2Q13576 1575 aa24.92■■□□□ 1.58
HPS1-202ENST00000338546 SYNJ2O15056 1496 aa24.9■■□□□ 1.58
HPS1-202ENST00000338546 GRIN2AQ12879 1464 aa24.9■■□□□ 1.58
HPS1-202ENST00000338546 FHOD3Q2V2M9 1422 aa24.89■■□□□ 1.58
HPS1-202ENST00000338546 FYCO1Q9BQS8 1478 aa24.89■■□□□ 1.58
HPS1-202ENST00000338546 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa24.89■■□□□ 1.57
HPS1-202ENST00000338546 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa24.88■■□□□ 1.57
HPS1-202ENST00000338546 TIAM1Q13009 1591 aa24.86■■□□□ 1.57
HPS1-202ENST00000338546 UGGT2Q9NYU1 1516 aa24.85■■□□□ 1.57
HPS1-202ENST00000338546 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
HPS1-202ENST00000338546 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
HPS1-202ENST00000338546 P3H3Q8IVL6 736 aa24.82■■□□□ 1.56
HPS1-202ENST00000338546 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
HPS1-202ENST00000338546 CFAP43Q8NDM7 1665 aa24.8■■□□□ 1.56
HPS1-202ENST00000338546 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
HPS1-202ENST00000338546 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
HPS1-202ENST00000338546 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa24.75■■□□□ 1.55
HPS1-202ENST00000338546 NUP160Q12769 1436 aa24.75■■□□□ 1.55
HPS1-202ENST00000338546 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
HPS1-202ENST00000338546 CEP170Q5SW79 1584 aa24.7■■□□□ 1.54
HPS1-202ENST00000338546 KIAA0556O60303 1618 aa24.66■■□□□ 1.54
HPS1-202ENST00000338546 DISP1Q96F81 1524 aa24.65■■□□□ 1.54
HPS1-202ENST00000338546 CCDC18Q5T9S5 1454 aa24.62■■□□□ 1.53
HPS1-202ENST00000338546 FBLN2P98095 1184 aa24.61■■□□□ 1.53
HPS1-202ENST00000338546 HECW1Q76N89 1606 aa24.61■■□□□ 1.53
HPS1-202ENST00000338546 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
HPS1-202ENST00000338546 CCNB3Q8WWL7 1395 aa24.58■■□□□ 1.53
HPS1-202ENST00000338546 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa24.57■■□□□ 1.52
HPS1-202ENST00000338546 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa24.54■■□□□ 1.52
HPS1-202ENST00000338546 JPH4Q96JJ6 628 aa24.54■■□□□ 1.52
HPS1-202ENST00000338546 MTUS2Q5JR59 1369 aa24.5■■□□□ 1.51
HPS1-202ENST00000338546 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.5■■□□□ 1.51
HPS1-202ENST00000338546 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
HPS1-202ENST00000338546 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
HPS1-202ENST00000338546 PHLDB1Q86UU1 1377 aa24.49■■□□□ 1.51
HPS1-202ENST00000338546 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP24.49■■□□□ 1.51
HPS1-202ENST00000338546 CHD1O14646 1710 aa24.48■■□□□ 1.51
HPS1-202ENST00000338546 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
HPS1-202ENST00000338546 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa24.45■■□□□ 1.5
HPS1-202ENST00000338546 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
HPS1-202ENST00000338546 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
HPS1-202ENST00000338546 ARHGEF11O15085 1522 aa24.39■■□□□ 1.5
HPS1-202ENST00000338546 NCOA2Q15596 1464 aa24.39■■□□□ 1.49
HPS1-202ENST00000338546 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
HPS1-202ENST00000338546 SHROOM2Q13796 1616 aa24.38■■□□□ 1.49
HPS1-202ENST00000338546 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa24.35■■□□□ 1.49
HPS1-202ENST00000338546 FGD6Q6ZV73 1430 aa24.34■■□□□ 1.49
HPS1-202ENST00000338546 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.34■■□□□ 1.49
HPS1-202ENST00000338546 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
HPS1-202ENST00000338546 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
HPS1-202ENST00000338546 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
HPS1-202ENST00000338546 ABCA8O94911 1581 aa24.31■■□□□ 1.48
HPS1-202ENST00000338546 PLB1Q6P1J6 1458 aa24.28■■□□□ 1.48
HPS1-202ENST00000338546 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.26■■□□□ 1.47
HPS1-202ENST00000338546 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
HPS1-202ENST00000338546 PTPRGP23470 1445 aa24.25■■□□□ 1.47
HPS1-202ENST00000338546 MIA2Q96PC5 1412 aa24.24■■□□□ 1.47
HPS1-202ENST00000338546 CLSPNQ9HAW4 1339 aa24.24■■□□□ 1.47
HPS1-202ENST00000338546 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
HPS1-202ENST00000338546 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
HPS1-202ENST00000338546 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24.19■■□□□ 1.46
HPS1-202ENST00000338546 SETD5Q9C0A6 1442 aa24.18■■□□□ 1.46
HPS1-202ENST00000338546 ADCY10Q96PN6 1610 aa24.17■■□□□ 1.46
HPS1-202ENST00000338546 ITGAEP38570 1179 aa24.16■■□□□ 1.46
HPS1-202ENST00000338546 ATP10BO94823 1461 aa24.14■■□□□ 1.46
HPS1-202ENST00000338546 UACAQ9BZF9 1416 aa24.13■■□□□ 1.45
HPS1-202ENST00000338546 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
HPS1-202ENST00000338546 ARID3CA6NKF2 412 aa24.12■■□□□ 1.45
HPS1-202ENST00000338546 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa24.1■■□□□ 1.45
HPS1-202ENST00000338546 PLEKHD1A6NEE1 506 aa24.09■■□□□ 1.45
HPS1-202ENST00000338546 ITSN2Q9NZM3 1697 aa24.06■■□□□ 1.44
HPS1-202ENST00000338546 ABCC2Q92887 1545 aa24.05■■□□□ 1.44
HPS1-202ENST00000338546 HFM1A2PYH4 1435 aa24.05■■□□□ 1.44
HPS1-202ENST00000338546 ERCC6L2Q5T890 1561 aa24.04■■□□□ 1.44
HPS1-202ENST00000338546 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa24.03■■□□□ 1.44
HPS1-202ENST00000338546 AKNAQ7Z591 1439 aa24.03■■□□□ 1.44
HPS1-202ENST00000338546 KIF14Q15058 1648 aa24.02■■□□□ 1.44
HPS1-202ENST00000338546 PTPRKQ15262 1439 aa24.02■■□□□ 1.44
HPS1-202ENST00000338546 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
HPS1-202ENST00000338546 ABCC10Q5T3U5 1492 aa23.97■■□□□ 1.43
HPS1-202ENST00000338546 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
HPS1-202ENST00000338546 NAIPQ13075 1403 aa23.94■■□□□ 1.42
HPS1-202ENST00000338546 OSCARQ8IYS5 282 aa23.94■■□□□ 1.42
HPS1-202ENST00000338546 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
HPS1-202ENST00000338546 ROCK1Q13464 1354 aa23.93■■□□□ 1.42
HPS1-202ENST00000338546 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
HPS1-202ENST00000338546 DAPK1P53355 1430 aa23.91■■□□□ 1.42
HPS1-202ENST00000338546 GCC2Q8IWJ2 1684 aa23.9■■□□□ 1.42
HPS1-202ENST00000338546 KDM5BQ9UGL1 1544 aa23.9■■□□□ 1.42
HPS1-202ENST00000338546 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa23.89■■□□□ 1.41
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