RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000323482.8

ACSS1-201, Transcript of acyl-CoA synthetase short chain family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACSS1, Length 3,680 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSS1-201ENST00000323482 CCDC136Q96JN2 1154 aa22.83■■□□□ 1.25
ACSS1-201ENST00000323482 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
ACSS1-201ENST00000323482 UNC13AQ9UPW8 1703 aa22.78■■□□□ 1.24
ACSS1-201ENST00000323482 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
ACSS1-201ENST00000323482 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
ACSS1-201ENST00000323482 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
ACSS1-201ENST00000323482 KIF21BO75037 1637 aa22.74■■□□□ 1.23
ACSS1-201ENST00000323482 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.73■■□□□ 1.23
ACSS1-201ENST00000323482 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
ACSS1-201ENST00000323482 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
ACSS1-201ENST00000323482 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
ACSS1-201ENST00000323482 BICRAQ9NZM4 1560 aa22.65■■□□□ 1.22
ACSS1-201ENST00000323482 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
ACSS1-201ENST00000323482 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
ACSS1-201ENST00000323482 ARID3CA6NKF2 412 aa22.58■■□□□ 1.2
ACSS1-201ENST00000323482 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.2
ACSS1-201ENST00000323482 ARAP1Q96P48 1450 aa22.56■■□□□ 1.2
ACSS1-201ENST00000323482 MRS2Q9HD23 443 aa22.55■■□□□ 1.2
ACSS1-201ENST00000323482 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.54■■□□□ 1.2
ACSS1-201ENST00000323482 TONSLQ96HA7 1378 aa22.54■■□□□ 1.2
ACSS1-201ENST00000323482 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
ACSS1-201ENST00000323482 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
ACSS1-201ENST00000323482 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
ACSS1-201ENST00000323482 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.5■■□□□ 1.19
ACSS1-201ENST00000323482 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.48■■□□□ 1.19
ACSS1-201ENST00000323482 KIF27Q86VH2 1401 aa22.47■■□□□ 1.19
ACSS1-201ENST00000323482 PPP4R2Q9NY27 417 aa22.44■■□□□ 1.18
ACSS1-201ENST00000323482 PRXQ9BXM0 1461 aa22.42■■□□□ 1.18
ACSS1-201ENST00000323482 IL27Q8NEV9 243 aa22.42■■□□□ 1.18
ACSS1-201ENST00000323482 ARXQ96QS3 562 aa22.39■■□□□ 1.18
ACSS1-201ENST00000323482 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.39■■□□□ 1.17
ACSS1-201ENST00000323482 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
ACSS1-201ENST00000323482 TOP2BQ02880 1626 aa22.39■■□□□ 1.17
ACSS1-201ENST00000323482 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
ACSS1-201ENST00000323482 CCDC184Q52MB2 194 aa22.34■■□□□ 1.17
ACSS1-201ENST00000323482 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.34■■□□□ 1.17
ACSS1-201ENST00000323482 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.16
ACSS1-201ENST00000323482 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.32■■□□□ 1.16
ACSS1-201ENST00000323482 CCER2I3L3R5 266 aa22.32■■□□□ 1.16
ACSS1-201ENST00000323482 NEFMP07197 916 aa22.32■■□□□ 1.16
ACSS1-201ENST00000323482 CUX2O14529 1486 aa22.32■■□□□ 1.16
ACSS1-201ENST00000323482 FANCIQ9NVI1 1328 aa22.31■■□□□ 1.16
ACSS1-201ENST00000323482 CUX1P39880 1505 aa22.31■■□□□ 1.16
ACSS1-201ENST00000323482 FOXD1Q16676 465 aa22.28■■□□□ 1.16
ACSS1-201ENST00000323482 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.25■■□□□ 1.15
ACSS1-201ENST00000323482 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.25■■□□□ 1.15
ACSS1-201ENST00000323482 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.24■■□□□ 1.15
ACSS1-201ENST00000323482 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.24■■□□□ 1.15
ACSS1-201ENST00000323482 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.22■■□□□ 1.15
ACSS1-201ENST00000323482 IGF1RP08069 1367 aa22.22■■□□□ 1.15
ACSS1-201ENST00000323482 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
ACSS1-201ENST00000323482 SLC4A3P48751 1232 aa22.16■■□□□ 1.14
ACSS1-201ENST00000323482 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP22.16■■□□□ 1.14
ACSS1-201ENST00000323482 WDR97A6NE52 1622 aa22.14■■□□□ 1.14
ACSS1-201ENST00000323482 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.12■■□□□ 1.13
ACSS1-201ENST00000323482 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.12■■□□□ 1.13
ACSS1-201ENST00000323482 MAPKBP1O60336 1514 aa22.11■■□□□ 1.13
ACSS1-201ENST00000323482 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
ACSS1-201ENST00000323482 TMC1Q8TDI8 760 aa22.1■■□□□ 1.13
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ACSS1-201ENST00000323482 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.06■■□□□ 1.12
ACSS1-201ENST00000323482 NCAPD3P42695 1498 aa22.05■■□□□ 1.12
ACSS1-201ENST00000323482 CFTRP13569 1480 aa22.05■■□□□ 1.12
ACSS1-201ENST00000323482 BRPF3Q9ULD4 1205 aa22.02■■□□□ 1.12
ACSS1-201ENST00000323482 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa22■■□□□ 1.11
ACSS1-201ENST00000323482 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22■■□□□ 1.11
ACSS1-201ENST00000323482 TIAM1Q13009 1591 aa22■■□□□ 1.11
ACSS1-201ENST00000323482 MTUS2Q5JR59 1369 aa21.99■■□□□ 1.11
ACSS1-201ENST00000323482 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa21.98■■□□□ 1.11
ACSS1-201ENST00000323482 WASHC2AQ641Q2 1341 aa21.97■■□□□ 1.11
ACSS1-201ENST00000323482 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.96■■□□□ 1.11
ACSS1-201ENST00000323482 CADPSQ9ULU8 1353 aa21.94■■□□□ 1.1
ACSS1-201ENST00000323482 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.94■■□□□ 1.1
ACSS1-201ENST00000323482 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
ACSS1-201ENST00000323482 AKNAQ7Z591 1439 aa21.93■■□□□ 1.1
ACSS1-201ENST00000323482 PLIN1O60240 522 aa21.92■■□□□ 1.1
ACSS1-201ENST00000323482 EXOC6Q8TAG9 804 aa21.9■■□□□ 1.1
ACSS1-201ENST00000323482 L3MBTL2Q969R5 705 aa21.9■■□□□ 1.1
ACSS1-201ENST00000323482 RGS3P49796 1198 aa21.89■■□□□ 1.09
ACSS1-201ENST00000323482 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
ACSS1-201ENST00000323482 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
ACSS1-201ENST00000323482 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
ACSS1-201ENST00000323482 HMGXB3Q12766 1538 aa21.86■■□□□ 1.09
ACSS1-201ENST00000323482 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
ACSS1-201ENST00000323482 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
ACSS1-201ENST00000323482 PDE4AP27815 886 aa21.81■■□□□ 1.08
ACSS1-201ENST00000323482 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
ACSS1-201ENST00000323482 CCDC18Q5T9S5 1454 aa21.8■■□□□ 1.08
ACSS1-201ENST00000323482 NUDCQ9Y266 331 aa21.79■■□□□ 1.08
ACSS1-201ENST00000323482 FGD6Q6ZV73 1430 aa21.78■■□□□ 1.08
ACSS1-201ENST00000323482 PTPRKQ15262 1439 aa21.77■■□□□ 1.08
ACSS1-201ENST00000323482 ZBED9Q6R2W3 1325 aa21.76■■□□□ 1.07
ACSS1-201ENST00000323482 ERICH6BQ5W0A0 696 aa21.76■■□□□ 1.07
ACSS1-201ENST00000323482 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.75■■□□□ 1.07
ACSS1-201ENST00000323482 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa21.75■■□□□ 1.07
ACSS1-201ENST00000323482 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
ACSS1-201ENST00000323482 NESP48681 1621 aa21.71■■□□□ 1.07
ACSS1-201ENST00000323482 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.69■■□□□ 1.06
ACSS1-201ENST00000323482 MAP3K1Q13233 1512 aa21.69■■□□□ 1.06
ACSS1-201ENST00000323482 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
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