RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299575.4

ATMIN-201, Transcript of ATM interactor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ATMIN, Length 4,884 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMIN-201ENST00000299575 MRS2Q9HD23 443 aa30.65■■■□□ 2.5
ATMIN-201ENST00000299575 STAG3Q9UJ98 1225 aa30.64■■■□□ 2.5
ATMIN-201ENST00000299575 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP30.6■■■□□ 2.49
ATMIN-201ENST00000299575 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP30.6■■■□□ 2.49
ATMIN-201ENST00000299575 SLC24A1O60721 1099 aa30.59■■■□□ 2.49
ATMIN-201ENST00000299575 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP30.57■■■□□ 2.48
ATMIN-201ENST00000299575 BCL11AQ9H165 835 aa30.56■■■□□ 2.48
ATMIN-201ENST00000299575 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa30.53■■■□□ 2.48
ATMIN-201ENST00000299575 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP30.53■■■□□ 2.48
ATMIN-201ENST00000299575 KCNH8Q96L42 1107 aa30.52■■■□□ 2.48
ATMIN-201ENST00000299575 CUX2O14529 1486 aa30.51■■■□□ 2.47
ATMIN-201ENST00000299575 ABCC8Q09428 1581 aa30.5■■■□□ 2.47
ATMIN-201ENST00000299575 FHAD1B1AJZ9 1412 aa30.46■■■□□ 2.47
ATMIN-201ENST00000299575 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP30.46■■■□□ 2.47
ATMIN-201ENST00000299575 CCNB3Q8WWL7 1395 aa30.46■■■□□ 2.47
ATMIN-201ENST00000299575 SIN3AQ96ST3 1273 aa30.41■■■□□ 2.46
ATMIN-201ENST00000299575 VPS8Q8N3P4 1428 aa30.4■■■□□ 2.46
ATMIN-201ENST00000299575 CCDC136Q96JN2 1154 aa30.4■■■□□ 2.46
ATMIN-201ENST00000299575 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP30.39■■■□□ 2.46
ATMIN-201ENST00000299575 SMARCA2P51531 1590 aa30.37■■■□□ 2.45
ATMIN-201ENST00000299575 RGL3Q3MIN7 710 aa30.35■■■□□ 2.45
ATMIN-201ENST00000299575 WIZO95785 1651 aa30.33■■■□□ 2.45
ATMIN-201ENST00000299575 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.29■■■□□ 2.44
ATMIN-201ENST00000299575 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP30.27■■■□□ 2.44
ATMIN-201ENST00000299575 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP30.27■■■□□ 2.44
ATMIN-201ENST00000299575 PLPPR3Q6T4P5 718 aa30.27■■■□□ 2.44
ATMIN-201ENST00000299575 ERCC6Q03468 1493 aa30.25■■■□□ 2.43
ATMIN-201ENST00000299575 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP30.23■■■□□ 2.43
ATMIN-201ENST00000299575 CARD11Q9BXL7 1154 aa30.18■■■□□ 2.42
ATMIN-201ENST00000299575 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30.15■■■□□ 2.42
ATMIN-201ENST00000299575 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa30.15■■■□□ 2.42
ATMIN-201ENST00000299575 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP30.12■■■□□ 2.41
ATMIN-201ENST00000299575 SETD5Q9C0A6 1442 aa30.09■■■□□ 2.41
ATMIN-201ENST00000299575 CDCA8Q53HL2 280 aa30.05■■■□□ 2.4
ATMIN-201ENST00000299575 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP30.04■■■□□ 2.4
ATMIN-201ENST00000299575 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa30.04■■■□□ 2.4
ATMIN-201ENST00000299575 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.02■■■□□ 2.4
ATMIN-201ENST00000299575 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP30.02■■■□□ 2.4
ATMIN-201ENST00000299575 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30■■■□□ 2.39
ATMIN-201ENST00000299575 KNSTRNQ9Y448 316 aa30■■■□□ 2.39
ATMIN-201ENST00000299575 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.98■■■□□ 2.39
ATMIN-201ENST00000299575 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP29.97■■■□□ 2.39
ATMIN-201ENST00000299575 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP29.97■■■□□ 2.39
ATMIN-201ENST00000299575 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa29.97■■■□□ 2.39
ATMIN-201ENST00000299575 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP29.95■■■□□ 2.39
ATMIN-201ENST00000299575 SMARCA4P51532 1647 aa29.95■■■□□ 2.38
ATMIN-201ENST00000299575 FMN1Q68DA7 1419 aa29.94■■■□□ 2.38
ATMIN-201ENST00000299575 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa29.9■■■□□ 2.38
ATMIN-201ENST00000299575 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa29.89■■■□□ 2.38
ATMIN-201ENST00000299575 DCAF11Q8TEB1 546 aa29.87■■■□□ 2.37
ATMIN-201ENST00000299575 CFAP53Q96M91 514 aa29.84■■■□□ 2.37
ATMIN-201ENST00000299575 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.82■■■□□ 2.36
ATMIN-201ENST00000299575 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa29.79■■■□□ 2.36
ATMIN-201ENST00000299575 NBR1Q14596 966 aa29.78■■■□□ 2.36
ATMIN-201ENST00000299575 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP29.77■■■□□ 2.36
ATMIN-201ENST00000299575 PKD2Q13563 968 aa29.77■■■□□ 2.36
ATMIN-201ENST00000299575 CCER2I3L3R5 266 aa29.76■■■□□ 2.35
ATMIN-201ENST00000299575 FOXD1Q16676 465 aa29.76■■■□□ 2.35
ATMIN-201ENST00000299575 FHOD3Q2V2M9 1422 aa29.75■■■□□ 2.35
ATMIN-201ENST00000299575 MPHOSPH9Q99550 1183 aa29.72■■■□□ 2.35
ATMIN-201ENST00000299575 TMF1P82094 1093 aa29.71■■■□□ 2.35
ATMIN-201ENST00000299575 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP29.7■■■□□ 2.35
ATMIN-201ENST00000299575 MYH16Q9H6N6 1097 aa29.7■■■□□ 2.34
ATMIN-201ENST00000299575 PPP4R2Q9NY27 417 aa29.69■■■□□ 2.34
ATMIN-201ENST00000299575 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP29.66■■■□□ 2.34
ATMIN-201ENST00000299575 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP29.66■■■□□ 2.34
ATMIN-201ENST00000299575 NEUROD2Q15784 382 aa29.65■■■□□ 2.34
ATMIN-201ENST00000299575 KANK1Q14678 1352 aa29.64■■■□□ 2.34
ATMIN-201ENST00000299575 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP29.64■■■□□ 2.34
ATMIN-201ENST00000299575 POGKQ9P215 609 aa29.63■■■□□ 2.33
ATMIN-201ENST00000299575 C14orf37Q86TY3 774 aa29.61■■■□□ 2.33
ATMIN-201ENST00000299575 NUP155O75694 1391 aa29.58■■■□□ 2.33
ATMIN-201ENST00000299575 NUDCQ9Y266 331 aa29.58■■■□□ 2.33
ATMIN-201ENST00000299575 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa29.57■■■□□ 2.32
ATMIN-201ENST00000299575 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP29.57■■■□□ 2.32
ATMIN-201ENST00000299575 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa29.54■■■□□ 2.32
ATMIN-201ENST00000299575 DDRGK1Q96HY6 314 aa29.53■■■□□ 2.32
ATMIN-201ENST00000299575 ZBTB7CA1YPR0 619 aa29.53■■■□□ 2.32
ATMIN-201ENST00000299575 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.53■■■□□ 2.32
ATMIN-201ENST00000299575 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa29.53■■■□□ 2.32
ATMIN-201ENST00000299575 PLEKHG5O94827 1062 aa29.52■■■□□ 2.32
ATMIN-201ENST00000299575 L3MBTL2Q969R5 705 aa29.5■■■□□ 2.31
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ATMIN-201ENST00000299575 BECN1Q14457 450 aa29.47■■■□□ 2.31
ATMIN-201ENST00000299575 GGT6Q6P531 493 aa29.46■■■□□ 2.31
ATMIN-201ENST00000299575 JPH4Q96JJ6 628 aa29.45■■■□□ 2.31
ATMIN-201ENST00000299575 CCDC18Q5T9S5 1454 aa29.45■■■□□ 2.31
ATMIN-201ENST00000299575 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP29.43■■■□□ 2.3
ATMIN-201ENST00000299575 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP29.42■■■□□ 2.3
ATMIN-201ENST00000299575 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP29.41■■■□□ 2.3
ATMIN-201ENST00000299575 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP29.4■■■□□ 2.3
ATMIN-201ENST00000299575 IGF1RP08069 1367 aa29.4■■■□□ 2.3
ATMIN-201ENST00000299575 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP29.39■■■□□ 2.3
ATMIN-201ENST00000299575 ARXQ96QS3 562 aa29.38■■■□□ 2.29
ATMIN-201ENST00000299575 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP29.38■■■□□ 2.29
ATMIN-201ENST00000299575 RSPH4AQ5TD94 716 aa29.37■■■□□ 2.29
ATMIN-201ENST00000299575 RGS3P49796 1198 aa29.36■■■□□ 2.29
ATMIN-201ENST00000299575 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP29.34■■■□□ 2.29
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