RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa35.06■■■■□ 3.2
VSTM4-201ENST00000298454 GRIN2BQ13224 1484 aa35.03■■■■□ 3.2
VSTM4-201ENST00000298454 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.99■■■■□ 3.19
VSTM4-201ENST00000298454 P3H3Q8IVL6 736 aa34.97■■■■□ 3.19
VSTM4-201ENST00000298454 ADAMTS12P58397 1594 aa34.96■■■■□ 3.19
VSTM4-201ENST00000298454 EFCAB5A4FU69 1503 aa34.91■■■■□ 3.18
VSTM4-201ENST00000298454 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP34.9■■■■□ 3.18
VSTM4-201ENST00000298454 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP34.9■■■■□ 3.18
VSTM4-201ENST00000298454 FHOD3Q2V2M9 1422 aa34.88■■■■□ 3.17
VSTM4-201ENST00000298454 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.81■■■■□ 3.16
VSTM4-201ENST00000298454 SAMD9Q5K651 1589 aa34.75■■■■□ 3.15
VSTM4-201ENST00000298454 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP34.75■■■■□ 3.15
VSTM4-201ENST00000298454 TIAM1Q13009 1591 aa34.7■■■■□ 3.15
VSTM4-201ENST00000298454 MAP3K1Q13233 1512 aa34.69■■■■□ 3.14
VSTM4-201ENST00000298454 IQGAP2Q13576 1575 aa34.67■■■■□ 3.14
VSTM4-201ENST00000298454 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP34.65■■■■□ 3.14
VSTM4-201ENST00000298454 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.65■■■■□ 3.14
VSTM4-201ENST00000298454 FMN1Q68DA7 1419 aa34.65■■■■□ 3.14
VSTM4-201ENST00000298454 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa34.64■■■■□ 3.14
VSTM4-201ENST00000298454 GRIN2AQ12879 1464 aa34.63■■■■□ 3.13
VSTM4-201ENST00000298454 FYCO1Q9BQS8 1478 aa34.63■■■■□ 3.13
VSTM4-201ENST00000298454 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP34.63■■■■□ 3.13
VSTM4-201ENST00000298454 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP34.59■■■■□ 3.13
VSTM4-201ENST00000298454 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP34.59■■■■□ 3.13
VSTM4-201ENST00000298454 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa34.56■■■■□ 3.12
VSTM4-201ENST00000298454 CFAP43Q8NDM7 1665 aa34.56■■■■□ 3.12
VSTM4-201ENST00000298454 SYNJ2O15056 1496 aa34.55■■■■□ 3.12
VSTM4-201ENST00000298454 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.55■■■■□ 3.12
VSTM4-201ENST00000298454 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa34.53■■■■□ 3.12
VSTM4-201ENST00000298454 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP34.49■■■■□ 3.11
VSTM4-201ENST00000298454 FBLN2P98095 1184 aa34.49■■■■□ 3.11
VSTM4-201ENST00000298454 UGGT2Q9NYU1 1516 aa34.48■■■■□ 3.11
VSTM4-201ENST00000298454 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP34.48■■■■□ 3.11
VSTM4-201ENST00000298454 CEP170Q5SW79 1584 aa34.42■■■■□ 3.1
VSTM4-201ENST00000298454 CCNB3Q8WWL7 1395 aa34.38■■■■□ 3.09
VSTM4-201ENST00000298454 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa34.36■■■■□ 3.09
VSTM4-201ENST00000298454 DISP1Q96F81 1524 aa34.35■■■■□ 3.09
VSTM4-201ENST00000298454 PHLDB1Q86UU1 1377 aa34.34■■■■□ 3.09
VSTM4-201ENST00000298454 NUP160Q12769 1436 aa34.33■■■■□ 3.09
VSTM4-201ENST00000298454 KIAA0556O60303 1618 aa34.32■■■■□ 3.08
VSTM4-201ENST00000298454 MTUS2Q5JR59 1369 aa34.23■■■■□ 3.07
VSTM4-201ENST00000298454 HECW1Q76N89 1606 aa34.22■■■■□ 3.07
VSTM4-201ENST00000298454 CCDC18Q5T9S5 1454 aa34.19■■■■□ 3.06
VSTM4-201ENST00000298454 JPH4Q96JJ6 628 aa34.18■■■■□ 3.06
VSTM4-201ENST00000298454 ITGAEP38570 1179 aa34.15■■■■□ 3.06
VSTM4-201ENST00000298454 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP34.15■■■■□ 3.06
VSTM4-201ENST00000298454 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa34.12■■■■□ 3.05
VSTM4-201ENST00000298454 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa34.1■■■■□ 3.05
VSTM4-201ENST00000298454 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP34.1■■■■□ 3.05
VSTM4-201ENST00000298454 ARID3CA6NKF2 412 aa34.09■■■■□ 3.05
VSTM4-201ENST00000298454 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP34.09■■■■□ 3.05
VSTM4-201ENST00000298454 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa34.07■■■■□ 3.04
VSTM4-201ENST00000298454 NCOA2Q15596 1464 aa34.06■■■■□ 3.04
VSTM4-201ENST00000298454 CHD1O14646 1710 aa34.06■■■■□ 3.04
VSTM4-201ENST00000298454 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa34.03■■■■□ 3.04
VSTM4-201ENST00000298454 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP34.03■■■■□ 3.04
VSTM4-201ENST00000298454 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP34.01■■■■□ 3.04
VSTM4-201ENST00000298454 FGD6Q6ZV73 1430 aa34■■■■□ 3.03
VSTM4-201ENST00000298454 PLB1Q6P1J6 1458 aa33.96■■■■□ 3.03
VSTM4-201ENST00000298454 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP33.95■■■■□ 3.03
VSTM4-201ENST00000298454 ARHGEF11O15085 1522 aa33.95■■■■□ 3.03
VSTM4-201ENST00000298454 MYOM3Q5VTT5 1437 aa33.94■■■■□ 3.02
VSTM4-201ENST00000298454 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP33.9■■■■□ 3.02
VSTM4-201ENST00000298454 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP33.86■■■■□ 3.01
VSTM4-201ENST00000298454 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa33.83■■■■□ 3.01
VSTM4-201ENST00000298454 SETD5Q9C0A6 1442 aa33.79■■■■□ 3
VSTM4-201ENST00000298454 ABCA8O94911 1581 aa33.78■■■■□ 3
VSTM4-201ENST00000298454 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP33.78■■■■□ 3
VSTM4-201ENST00000298454 SHROOM2Q13796 1616 aa33.76■■■■□ 3
VSTM4-201ENST00000298454 PTPN23Q9H3S7 1636 aa33.76■■■■□ 3
VSTM4-201ENST00000298454 PTPRGP23470 1445 aa33.74■■■□□ 2.99
VSTM4-201ENST00000298454 PTPRKQ15262 1439 aa33.71■■■□□ 2.99
VSTM4-201ENST00000298454 CLSPNQ9HAW4 1339 aa33.69■■■□□ 2.98
VSTM4-201ENST00000298454 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP33.69■■■□□ 2.98
VSTM4-201ENST00000298454 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP33.69■■■□□ 2.98
VSTM4-201ENST00000298454 MIA2Q96PC5 1412 aa33.67■■■□□ 2.98
VSTM4-201ENST00000298454 ERCC6L2Q5T890 1561 aa33.65■■■□□ 2.98
VSTM4-201ENST00000298454 ATP10BO94823 1461 aa33.64■■■□□ 2.98
VSTM4-201ENST00000298454 CLASP1Q7Z460 1538 aa33.64■■■□□ 2.98
VSTM4-201ENST00000298454 KIF14Q15058 1648 aa33.56■■■□□ 2.96
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VSTM4-201ENST00000298454 HFM1A2PYH4 1435 aa33.54■■■□□ 2.96
VSTM4-201ENST00000298454 ADCY10Q96PN6 1610 aa33.54■■■□□ 2.96
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VSTM4-201ENST00000298454 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP33.48■■■□□ 2.95
VSTM4-201ENST00000298454 CHIC2Q9UKJ5 165 aa33.47■■■□□ 2.95
VSTM4-201ENST00000298454 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP33.46■■■□□ 2.95
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VSTM4-201ENST00000298454 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa33.41■■■□□ 2.94
VSTM4-201ENST00000298454 ABCC2Q92887 1545 aa33.39■■■□□ 2.94
VSTM4-201ENST00000298454 DAPK1P53355 1430 aa33.38■■■□□ 2.93
VSTM4-201ENST00000298454 ABCC10Q5T3U5 1492 aa33.38■■■□□ 2.93
VSTM4-201ENST00000298454 ABCC5O15440 1437 aa33.36■■■□□ 2.93
VSTM4-201ENST00000298454 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa33.35■■■□□ 2.93
VSTM4-201ENST00000298454 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP33.35■■■□□ 2.93
VSTM4-201ENST00000298454 AKNAQ7Z591 1439 aa33.34■■■□□ 2.93
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP33.33■■■□□ 2.93
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