RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000286428.5

VBP1-201, Transcript of VHL binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VBP1, Length 1,686 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1-201ENST00000286428 EFCAB5A4FU69 1503 aa29.12■■■□□ 2.25
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VBP1-201ENST00000286428 ADAMTS12P58397 1594 aa29.03■■■□□ 2.24
VBP1-201ENST00000286428 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP28.98■■■□□ 2.23
VBP1-201ENST00000286428 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
VBP1-201ENST00000286428 MAP3K1Q13233 1512 aa28.95■■■□□ 2.22
VBP1-201ENST00000286428 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
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VBP1-201ENST00000286428 CCDC18Q5T9S5 1454 aa28.54■■■□□ 2.16
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VBP1-201ENST00000286428 ROCK1Q13464 1354 aa27.73■■■□□ 2.03
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VBP1-201ENST00000286428 ABCC10Q5T3U5 1492 aa27.71■■■□□ 2.03
VBP1-201ENST00000286428 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP27.68■■■□□ 2.02
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VBP1-201ENST00000286428 CHIC2Q9UKJ5 165 aa27.65■■■□□ 2.02
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