RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273261.7

LRIG1-201, Transcript of leucine rich repeats and immunoglobulin like domains 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRIG1, Length 5,273 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1-201ENST00000273261 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP27.37■■□□□ 1.97
LRIG1-201ENST00000273261 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.33■■□□□ 1.97
LRIG1-201ENST00000273261 BCL11AQ9H165 835 aa27.32■■□□□ 1.96
LRIG1-201ENST00000273261 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
LRIG1-201ENST00000273261 MIER1Q8N108 512 aa27.29■■□□□ 1.96
LRIG1-201ENST00000273261 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP27.28■■□□□ 1.96
LRIG1-201ENST00000273261 KCNH8Q96L42 1107 aa27.25■■□□□ 1.95
LRIG1-201ENST00000273261 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP27.25■■□□□ 1.95
LRIG1-201ENST00000273261 CCDC136Q96JN2 1154 aa27.23■■□□□ 1.95
LRIG1-201ENST00000273261 SMARCA2P51531 1590 aa27.22■■□□□ 1.95
LRIG1-201ENST00000273261 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa27.22■■□□□ 1.95
LRIG1-201ENST00000273261 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.22■■□□□ 1.95
LRIG1-201ENST00000273261 ERCC6Q03468 1493 aa27.21■■□□□ 1.95
LRIG1-201ENST00000273261 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP27.21■■□□□ 1.95
LRIG1-201ENST00000273261 CUX2O14529 1486 aa27.2■■□□□ 1.94
LRIG1-201ENST00000273261 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.17■■□□□ 1.94
LRIG1-201ENST00000273261 CDCA8Q53HL2 280 aa27.16■■□□□ 1.94
LRIG1-201ENST00000273261 SOGA1O94964 1423 aa27.15■■□□□ 1.94
LRIG1-201ENST00000273261 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.94
LRIG1-201ENST00000273261 CCNB3Q8WWL7 1395 aa27.14■■□□□ 1.94
LRIG1-201ENST00000273261 PLPPR3Q6T4P5 718 aa27.11■■□□□ 1.93
LRIG1-201ENST00000273261 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
LRIG1-201ENST00000273261 VPS8Q8N3P4 1428 aa27.06■■□□□ 1.92
LRIG1-201ENST00000273261 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa27.04■■□□□ 1.92
LRIG1-201ENST00000273261 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP27.03■■□□□ 1.92
LRIG1-201ENST00000273261 RGL3Q3MIN7 710 aa27.03■■□□□ 1.92
LRIG1-201ENST00000273261 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
LRIG1-201ENST00000273261 CARD11Q9BXL7 1154 aa27.01■■□□□ 1.91
LRIG1-201ENST00000273261 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
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LRIG1-201ENST00000273261 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
LRIG1-201ENST00000273261 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.96■■□□□ 1.91
LRIG1-201ENST00000273261 CFAP53Q96M91 514 aa26.96■■□□□ 1.91
LRIG1-201ENST00000273261 KNSTRNQ9Y448 316 aa26.95■■□□□ 1.9
LRIG1-201ENST00000273261 ABCC8Q09428 1581 aa26.94■■□□□ 1.9
LRIG1-201ENST00000273261 MYH16Q9H6N6 1097 aa26.91■■□□□ 1.9
LRIG1-201ENST00000273261 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa26.9■■□□□ 1.9
LRIG1-201ENST00000273261 SIN3AQ96ST3 1273 aa26.89■■□□□ 1.9
LRIG1-201ENST00000273261 SETD5Q9C0A6 1442 aa26.86■■□□□ 1.89
LRIG1-201ENST00000273261 FMN1Q68DA7 1419 aa26.84■■□□□ 1.89
LRIG1-201ENST00000273261 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa26.82■■□□□ 1.88
LRIG1-201ENST00000273261 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
LRIG1-201ENST00000273261 WIZO95785 1651 aa26.8■■□□□ 1.88
LRIG1-201ENST00000273261 KANK1Q14678 1352 aa26.79■■□□□ 1.88
LRIG1-201ENST00000273261 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
LRIG1-201ENST00000273261 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
LRIG1-201ENST00000273261 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.72■■□□□ 1.87
LRIG1-201ENST00000273261 DDRGK1Q96HY6 314 aa26.7■■□□□ 1.86
LRIG1-201ENST00000273261 NUDCQ9Y266 331 aa26.7■■□□□ 1.86
LRIG1-201ENST00000273261 TMF1P82094 1093 aa26.68■■□□□ 1.86
LRIG1-201ENST00000273261 C14orf37Q86TY3 774 aa26.67■■□□□ 1.86
LRIG1-201ENST00000273261 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
LRIG1-201ENST00000273261 POGKQ9P215 609 aa26.66■■□□□ 1.86
LRIG1-201ENST00000273261 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26.66■■□□□ 1.86
LRIG1-201ENST00000273261 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.65■■□□□ 1.86
LRIG1-201ENST00000273261 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
LRIG1-201ENST00000273261 DCAF11Q8TEB1 546 aa26.65■■□□□ 1.86
LRIG1-201ENST00000273261 BECN1Q14457 450 aa26.64■■□□□ 1.86
LRIG1-201ENST00000273261 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa26.64■■□□□ 1.85
LRIG1-201ENST00000273261 SMARCA4P51532 1647 aa26.63■■□□□ 1.85
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LRIG1-201ENST00000273261 CCER2I3L3R5 266 aa26.62■■□□□ 1.85
LRIG1-201ENST00000273261 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
LRIG1-201ENST00000273261 PPP4R2Q9NY27 417 aa26.57■■□□□ 1.84
LRIG1-201ENST00000273261 ZBTB7CA1YPR0 619 aa26.57■■□□□ 1.84
LRIG1-201ENST00000273261 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
LRIG1-201ENST00000273261 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa26.55■■□□□ 1.84
LRIG1-201ENST00000273261 HDGFP51858 240 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
LRIG1-201ENST00000273261 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
LRIG1-201ENST00000273261 NBR1Q14596 966 aa26.54■■□□□ 1.84
LRIG1-201ENST00000273261 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa26.54■■□□□ 1.84
LRIG1-201ENST00000273261 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
LRIG1-201ENST00000273261 PKD2Q13563 968 aa26.54■■□□□ 1.84
LRIG1-201ENST00000273261 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
LRIG1-201ENST00000273261 MS4A1P11836 297 aa26.52■■□□□ 1.84
LRIG1-201ENST00000273261 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa26.5■■□□□ 1.83
LRIG1-201ENST00000273261 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
LRIG1-201ENST00000273261 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
LRIG1-201ENST00000273261 ANP32EQ9BTT0 268 aa26.48■■□□□ 1.83
LRIG1-201ENST00000273261 MPHOSPH9Q99550 1183 aa26.46■■□□□ 1.83
LRIG1-201ENST00000273261 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa26.46■■□□□ 1.83
LRIG1-201ENST00000273261 NEUROD2Q15784 382 aa26.45■■□□□ 1.82
LRIG1-201ENST00000273261 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.44■■□□□ 1.82
LRIG1-201ENST00000273261 RSPH4AQ5TD94 716 aa26.44■■□□□ 1.82
LRIG1-201ENST00000273261 CASC1Q6TDU7 716 aa26.43■■□□□ 1.82
LRIG1-201ENST00000273261 FHOD3Q2V2M9 1422 aa26.42■■□□□ 1.82
LRIG1-201ENST00000273261 NUP155O75694 1391 aa26.42■■□□□ 1.82
LRIG1-201ENST00000273261 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
LRIG1-201ENST00000273261 GOLGA6L22H0YM25 854 aa26.39■■□□□ 1.82
LRIG1-201ENST00000273261 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
LRIG1-201ENST00000273261 A0A0G2JS52 829 aa26.37■■□□□ 1.81
LRIG1-201ENST00000273261 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa26.36■■□□□ 1.81
LRIG1-201ENST00000273261 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
LRIG1-201ENST00000273261 PLEKHG5O94827 1062 aa26.36■■□□□ 1.81
LRIG1-201ENST00000273261 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
LRIG1-201ENST00000273261 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
LRIG1-201ENST00000273261 NCLP19338 710 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
LRIG1-201ENST00000273261 MORC1Q86VD1 984 aa26.34■■□□□ 1.81
LRIG1-201ENST00000273261 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.33■■□□□ 1.81
LRIG1-201ENST00000273261 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
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