RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264719.5

EFR3B-201, Transcript of EFR3 homolog B, humanhuman

TSL 5

Gene EFR3B, Length 1,980 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFR3B-201ENST00000264719 PCGF6Q9BYE7 350 aa25.16■■□□□ 1.62
EFR3B-201ENST00000264719 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa25.15■■□□□ 1.62
EFR3B-201ENST00000264719 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
EFR3B-201ENST00000264719 P3H3Q8IVL6 736 aa25.11■■□□□ 1.61
EFR3B-201ENST00000264719 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
EFR3B-201ENST00000264719 GRIN2AQ12879 1464 aa25.06■■□□□ 1.6
EFR3B-201ENST00000264719 FBLN2P98095 1184 aa25.06■■□□□ 1.6
EFR3B-201ENST00000264719 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
EFR3B-201ENST00000264719 SYNJ2O15056 1496 aa25.04■■□□□ 1.6
EFR3B-201ENST00000264719 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
EFR3B-201ENST00000264719 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.02■■□□□ 1.6
EFR3B-201ENST00000264719 EFCAB5A4FU69 1503 aa24.97■■□□□ 1.59
EFR3B-201ENST00000264719 IQGAP2Q13576 1575 aa24.96■■□□□ 1.59
EFR3B-201ENST00000264719 CEP170Q5SW79 1584 aa24.93■■□□□ 1.58
EFR3B-201ENST00000264719 SAMD9Q5K651 1589 aa24.93■■□□□ 1.58
EFR3B-201ENST00000264719 APLP2Q06481 763 aa24.91■■□□□ 1.58
EFR3B-201ENST00000264719 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa24.91■■□□□ 1.58
EFR3B-201ENST00000264719 NUP160Q12769 1436 aa24.86■■□□□ 1.57
EFR3B-201ENST00000264719 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
EFR3B-201ENST00000264719 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
EFR3B-201ENST00000264719 UGGT2Q9NYU1 1516 aa24.83■■□□□ 1.57
EFR3B-201ENST00000264719 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
EFR3B-201ENST00000264719 FMN1Q68DA7 1419 aa24.79■■□□□ 1.56
EFR3B-201ENST00000264719 DISP1Q96F81 1524 aa24.78■■□□□ 1.56
EFR3B-201ENST00000264719 CHD1O14646 1710 aa24.78■■□□□ 1.56
EFR3B-201ENST00000264719 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa24.75■■□□□ 1.55
EFR3B-201ENST00000264719 FYCO1Q9BQS8 1478 aa24.73■■□□□ 1.55
EFR3B-201ENST00000264719 JPH4Q96JJ6 628 aa24.73■■□□□ 1.55
EFR3B-201ENST00000264719 KIAA0556O60303 1618 aa24.72■■□□□ 1.55
EFR3B-201ENST00000264719 TIAM1Q13009 1591 aa24.71■■□□□ 1.55
EFR3B-201ENST00000264719 MAP3K1Q13233 1512 aa24.65■■□□□ 1.54
EFR3B-201ENST00000264719 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa24.62■■□□□ 1.53
EFR3B-201ENST00000264719 CFAP43Q8NDM7 1665 aa24.62■■□□□ 1.53
EFR3B-201ENST00000264719 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa24.6■■□□□ 1.53
EFR3B-201ENST00000264719 ARID3CA6NKF2 412 aa24.58■■□□□ 1.53
EFR3B-201ENST00000264719 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa24.58■■□□□ 1.53
EFR3B-201ENST00000264719 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
EFR3B-201ENST00000264719 HECW1Q76N89 1606 aa24.52■■□□□ 1.52
EFR3B-201ENST00000264719 PLB1Q6P1J6 1458 aa24.51■■□□□ 1.51
EFR3B-201ENST00000264719 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
EFR3B-201ENST00000264719 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
EFR3B-201ENST00000264719 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.49■■□□□ 1.51
EFR3B-201ENST00000264719 SHROOM2Q13796 1616 aa24.49■■□□□ 1.51
EFR3B-201ENST00000264719 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
EFR3B-201ENST00000264719 PHLDB1Q86UU1 1377 aa24.47■■□□□ 1.51
EFR3B-201ENST00000264719 ERCC6L2Q5T890 1561 aa24.47■■□□□ 1.51
EFR3B-201ENST00000264719 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa24.47■■□□□ 1.51
EFR3B-201ENST00000264719 MTUS2Q5JR59 1369 aa24.46■■□□□ 1.51
EFR3B-201ENST00000264719 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa24.46■■□□□ 1.51
EFR3B-201ENST00000264719 CCDC18Q5T9S5 1454 aa24.45■■□□□ 1.51
EFR3B-201ENST00000264719 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
EFR3B-201ENST00000264719 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
EFR3B-201ENST00000264719 PTPRGP23470 1445 aa24.39■■□□□ 1.5
EFR3B-201ENST00000264719 CCNB3Q8WWL7 1395 aa24.38■■□□□ 1.49
EFR3B-201ENST00000264719 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
EFR3B-201ENST00000264719 ABCA8O94911 1581 aa24.36■■□□□ 1.49
EFR3B-201ENST00000264719 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.36■■□□□ 1.49
EFR3B-201ENST00000264719 NCOA2Q15596 1464 aa24.33■■□□□ 1.49
EFR3B-201ENST00000264719 HRCP23327 699 aa24.33■■□□□ 1.48
EFR3B-201ENST00000264719 OSCARQ8IYS5 282 aa24.29■■□□□ 1.48
EFR3B-201ENST00000264719 ITGAEP38570 1179 aa24.28■■□□□ 1.48
EFR3B-201ENST00000264719 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
EFR3B-201ENST00000264719 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
EFR3B-201ENST00000264719 ATP10BO94823 1461 aa24.25■■□□□ 1.47
EFR3B-201ENST00000264719 ARHGEF11O15085 1522 aa24.25■■□□□ 1.47
EFR3B-201ENST00000264719 UACAQ9BZF9 1416 aa24.24■■□□□ 1.47
EFR3B-201ENST00000264719 FGD6Q6ZV73 1430 aa24.23■■□□□ 1.47
EFR3B-201ENST00000264719 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.21■■□□□ 1.47
EFR3B-201ENST00000264719 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
EFR3B-201ENST00000264719 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
EFR3B-201ENST00000264719 ABCC2Q92887 1545 aa24.15■■□□□ 1.46
EFR3B-201ENST00000264719 KIF14Q15058 1648 aa24.13■■□□□ 1.45
EFR3B-201ENST00000264719 PLEKHD1A6NEE1 506 aa24.12■■□□□ 1.45
EFR3B-201ENST00000264719 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
EFR3B-201ENST00000264719 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP24.08■■□□□ 1.45
EFR3B-201ENST00000264719 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24.08■■□□□ 1.44
EFR3B-201ENST00000264719 ADCY10Q96PN6 1610 aa24.04■■□□□ 1.44
EFR3B-201ENST00000264719 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa24.04■■□□□ 1.44
EFR3B-201ENST00000264719 PTPRKQ15262 1439 aa24.03■■□□□ 1.44
EFR3B-201ENST00000264719 MIA2Q96PC5 1412 aa24.02■■□□□ 1.44
EFR3B-201ENST00000264719 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
EFR3B-201ENST00000264719 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
EFR3B-201ENST00000264719 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
EFR3B-201ENST00000264719 KDM5BQ9UGL1 1544 aa24■■□□□ 1.43
EFR3B-201ENST00000264719 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
EFR3B-201ENST00000264719 ABCC10Q5T3U5 1492 aa23.99■■□□□ 1.43
EFR3B-201ENST00000264719 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
EFR3B-201ENST00000264719 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa23.94■■□□□ 1.42
EFR3B-201ENST00000264719 KCNH8Q96L42 1107 aa23.93■■□□□ 1.42
EFR3B-201ENST00000264719 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
EFR3B-201ENST00000264719 SETD5Q9C0A6 1442 aa23.92■■□□□ 1.42
EFR3B-201ENST00000264719 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
EFR3B-201ENST00000264719 CHIC2Q9UKJ5 165 aa23.91■■□□□ 1.42
EFR3B-201ENST00000264719 ITSN2Q9NZM3 1697 aa23.9■■□□□ 1.42
EFR3B-201ENST00000264719 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa23.9■■□□□ 1.42
EFR3B-201ENST00000264719 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa23.89■■□□□ 1.41
EFR3B-201ENST00000264719 TTC37Q6PGP7 1564 aa23.88■■□□□ 1.41
EFR3B-201ENST00000264719 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP23.87■■□□□ 1.41
EFR3B-201ENST00000264719 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
EFR3B-201ENST00000264719 DAPK1P53355 1430 aa23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34 ms