RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262288.7

SCPEP1-201, Transcript of serine carboxypeptidase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SCPEP1, Length 1,942 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCPEP1-201ENST00000262288 P3H3Q8IVL6 736 aa24.51■■□□□ 1.51
SCPEP1-201ENST00000262288 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
SCPEP1-201ENST00000262288 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
SCPEP1-201ENST00000262288 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
SCPEP1-201ENST00000262288 GRIN2BQ13224 1484 aa24.44■■□□□ 1.5
SCPEP1-201ENST00000262288 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.42■■□□□ 1.5
SCPEP1-201ENST00000262288 FHOD3Q2V2M9 1422 aa24.4■■□□□ 1.5
SCPEP1-201ENST00000262288 ADAMTS12P58397 1594 aa24.39■■□□□ 1.5
SCPEP1-201ENST00000262288 EFCAB5A4FU69 1503 aa24.38■■□□□ 1.49
SCPEP1-201ENST00000262288 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
SCPEP1-201ENST00000262288 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
SCPEP1-201ENST00000262288 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
SCPEP1-201ENST00000262288 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
SCPEP1-201ENST00000262288 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
SCPEP1-201ENST00000262288 MAP3K1Q13233 1512 aa24.29■■□□□ 1.48
SCPEP1-201ENST00000262288 TIAM1Q13009 1591 aa24.29■■□□□ 1.48
SCPEP1-201ENST00000262288 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.29■■□□□ 1.48
SCPEP1-201ENST00000262288 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
SCPEP1-201ENST00000262288 SAMD9Q5K651 1589 aa24.28■■□□□ 1.48
SCPEP1-201ENST00000262288 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa24.22■■□□□ 1.47
SCPEP1-201ENST00000262288 FMN1Q68DA7 1419 aa24.2■■□□□ 1.46
SCPEP1-201ENST00000262288 FYCO1Q9BQS8 1478 aa24.2■■□□□ 1.46
SCPEP1-201ENST00000262288 IQGAP2Q13576 1575 aa24.2■■□□□ 1.46
SCPEP1-201ENST00000262288 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa24.19■■□□□ 1.46
SCPEP1-201ENST00000262288 CFAP43Q8NDM7 1665 aa24.18■■□□□ 1.46
SCPEP1-201ENST00000262288 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
SCPEP1-201ENST00000262288 GRIN2AQ12879 1464 aa24.16■■□□□ 1.46
SCPEP1-201ENST00000262288 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.46
SCPEP1-201ENST00000262288 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
SCPEP1-201ENST00000262288 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa24.09■■□□□ 1.45
SCPEP1-201ENST00000262288 SYNJ2O15056 1496 aa24.09■■□□□ 1.45
SCPEP1-201ENST00000262288 FBLN2P98095 1184 aa24.08■■□□□ 1.45
SCPEP1-201ENST00000262288 CCNB3Q8WWL7 1395 aa24.08■■□□□ 1.44
SCPEP1-201ENST00000262288 UGGT2Q9NYU1 1516 aa24.07■■□□□ 1.44
SCPEP1-201ENST00000262288 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa24.06■■□□□ 1.44
SCPEP1-201ENST00000262288 PHLDB1Q86UU1 1377 aa24.05■■□□□ 1.44
SCPEP1-201ENST00000262288 CEP170Q5SW79 1584 aa24.03■■□□□ 1.44
SCPEP1-201ENST00000262288 DISP1Q96F81 1524 aa23.99■■□□□ 1.43
SCPEP1-201ENST00000262288 ITGAEP38570 1179 aa23.97■■□□□ 1.43
SCPEP1-201ENST00000262288 KIAA0556O60303 1618 aa23.96■■□□□ 1.43
SCPEP1-201ENST00000262288 MTUS2Q5JR59 1369 aa23.94■■□□□ 1.42
SCPEP1-201ENST00000262288 NUP160Q12769 1436 aa23.94■■□□□ 1.42
SCPEP1-201ENST00000262288 HECW1Q76N89 1606 aa23.91■■□□□ 1.42
SCPEP1-201ENST00000262288 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
SCPEP1-201ENST00000262288 CCDC18Q5T9S5 1454 aa23.88■■□□□ 1.41
SCPEP1-201ENST00000262288 ARID3CA6NKF2 412 aa23.87■■□□□ 1.41
SCPEP1-201ENST00000262288 JPH4Q96JJ6 628 aa23.87■■□□□ 1.41
SCPEP1-201ENST00000262288 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa23.87■■□□□ 1.41
SCPEP1-201ENST00000262288 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
SCPEP1-201ENST00000262288 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
SCPEP1-201ENST00000262288 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa23.83■■□□□ 1.41
SCPEP1-201ENST00000262288 NCOA2Q15596 1464 aa23.83■■□□□ 1.41
SCPEP1-201ENST00000262288 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP23.8■■□□□ 1.4
SCPEP1-201ENST00000262288 FGD6Q6ZV73 1430 aa23.79■■□□□ 1.4
SCPEP1-201ENST00000262288 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP23.78■■□□□ 1.4
SCPEP1-201ENST00000262288 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa23.78■■□□□ 1.4
SCPEP1-201ENST00000262288 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa23.78■■□□□ 1.4
SCPEP1-201ENST00000262288 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
SCPEP1-201ENST00000262288 CHD1O14646 1710 aa23.77■■□□□ 1.4
SCPEP1-201ENST00000262288 CLSPNQ9HAW4 1339 aa23.77■■□□□ 1.4
SCPEP1-201ENST00000262288 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
SCPEP1-201ENST00000262288 MYOM3Q5VTT5 1437 aa23.74■■□□□ 1.39
SCPEP1-201ENST00000262288 ARHGEF11O15085 1522 aa23.74■■□□□ 1.39
SCPEP1-201ENST00000262288 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa23.72■■□□□ 1.39
SCPEP1-201ENST00000262288 PLB1Q6P1J6 1458 aa23.71■■□□□ 1.39
SCPEP1-201ENST00000262288 SETD5Q9C0A6 1442 aa23.7■■□□□ 1.38
SCPEP1-201ENST00000262288 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
SCPEP1-201ENST00000262288 PTPN23Q9H3S7 1636 aa23.64■■□□□ 1.37
SCPEP1-201ENST00000262288 PTPRKQ15262 1439 aa23.62■■□□□ 1.37
SCPEP1-201ENST00000262288 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
SCPEP1-201ENST00000262288 ABCA8O94911 1581 aa23.59■■□□□ 1.37
SCPEP1-201ENST00000262288 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
SCPEP1-201ENST00000262288 PTPRGP23470 1445 aa23.55■■□□□ 1.36
SCPEP1-201ENST00000262288 SHROOM2Q13796 1616 aa23.55■■□□□ 1.36
SCPEP1-201ENST00000262288 MIA2Q96PC5 1412 aa23.54■■□□□ 1.36
SCPEP1-201ENST00000262288 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
SCPEP1-201ENST00000262288 ATP10BO94823 1461 aa23.5■■□□□ 1.35
SCPEP1-201ENST00000262288 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
SCPEP1-201ENST00000262288 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.48■■□□□ 1.35
SCPEP1-201ENST00000262288 MAPKBP1O60336 1514 aa23.48■■□□□ 1.35
SCPEP1-201ENST00000262288 HFM1A2PYH4 1435 aa23.47■■□□□ 1.35
SCPEP1-201ENST00000262288 CHIC2Q9UKJ5 165 aa23.47■■□□□ 1.35
SCPEP1-201ENST00000262288 KIF14Q15058 1648 aa23.46■■□□□ 1.35
SCPEP1-201ENST00000262288 PLEKHD1A6NEE1 506 aa23.45■■□□□ 1.35
SCPEP1-201ENST00000262288 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.45■■□□□ 1.34
SCPEP1-201ENST00000262288 NAIPQ13075 1403 aa23.44■■□□□ 1.34
SCPEP1-201ENST00000262288 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
SCPEP1-201ENST00000262288 ADCY10Q96PN6 1610 aa23.44■■□□□ 1.34
SCPEP1-201ENST00000262288 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa23.43■■□□□ 1.34
SCPEP1-201ENST00000262288 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
SCPEP1-201ENST00000262288 UACAQ9BZF9 1416 aa23.4■■□□□ 1.34
SCPEP1-201ENST00000262288 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
SCPEP1-201ENST00000262288 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
SCPEP1-201ENST00000262288 DAPK1P53355 1430 aa23.36■■□□□ 1.33
SCPEP1-201ENST00000262288 ITSN2Q9NZM3 1697 aa23.35■■□□□ 1.33
SCPEP1-201ENST00000262288 SIN3AQ96ST3 1273 aa23.35■■□□□ 1.33
SCPEP1-201ENST00000262288 ABCC5O15440 1437 aa23.34■■□□□ 1.33
SCPEP1-201ENST00000262288 AKNAQ7Z591 1439 aa23.34■■□□□ 1.33
SCPEP1-201ENST00000262288 GCC2Q8IWJ2 1684 aa23.34■■□□□ 1.33
SCPEP1-201ENST00000262288 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.4 ms