RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261169.10

LMO3-201, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 3,810 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-201ENST00000261169 PLEKHG5O94827 1062 aa7.51□□□□□ -1.21
LMO3-201ENST00000261169 STAG3Q9UJ98 1225 aa7.5□□□□□ -1.21
LMO3-201ENST00000261169 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
LMO3-201ENST00000261169 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
LMO3-201ENST00000261169 CCDC136Q96JN2 1154 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-201ENST00000261169 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP7.49□□□□□ -1.21
LMO3-201ENST00000261169 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
LMO3-201ENST00000261169 GOLGA3Q08378 1498 aa7.48□□□□□ -1.21
LMO3-201ENST00000261169 NBR1Q14596 966 aa7.48□□□□□ -1.21
LMO3-201ENST00000261169 TNIKQ9UKE5 1360 aa7.47□□□□□ -1.21
LMO3-201ENST00000261169 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP7.47□□□□□ -1.21
LMO3-201ENST00000261169 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
LMO3-201ENST00000261169 NEFMP07197 916 aa7.47□□□□□ -1.21
LMO3-201ENST00000261169 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.21
LMO3-201ENST00000261169 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
LMO3-201ENST00000261169 FOXD1Q16676 465 aa7.45□□□□□ -1.22
LMO3-201ENST00000261169 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
LMO3-201ENST00000261169 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
LMO3-201ENST00000261169 PLEKHD1A6NEE1 506 aa7.44□□□□□ -1.22
LMO3-201ENST00000261169 ARXQ96QS3 562 aa7.44□□□□□ -1.22
LMO3-201ENST00000261169 MROH2BQ7Z745 1585 aa7.43□□□□□ -1.22
LMO3-201ENST00000261169 ABCC8Q09428 1581 aa7.43□□□□□ -1.22
LMO3-201ENST00000261169 CCDC88BA6NC98 1476 aa7.43□□□□□ -1.22
LMO3-201ENST00000261169 KIF27Q86VH2 1401 aa7.42□□□□□ -1.22
LMO3-201ENST00000261169 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP7.42□□□□□ -1.22
LMO3-201ENST00000261169 EEA1Q15075 1411 aa7.41□□□□□ -1.22
LMO3-201ENST00000261169 NEUROD2Q15784 382 aa7.41□□□□□ -1.22
LMO3-201ENST00000261169 CEP164Q9UPV0 1460 aa7.4□□□□□ -1.22
LMO3-201ENST00000261169 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.23
LMO3-201ENST00000261169 CARD11Q9BXL7 1154 aa7.4□□□□□ -1.23
LMO3-201ENST00000261169 BICRAQ9NZM4 1560 aa7.39□□□□□ -1.23
LMO3-201ENST00000261169 SMARCA2P51531 1590 aa7.39□□□□□ -1.23
LMO3-201ENST00000261169 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa7.38□□□□□ -1.23
LMO3-201ENST00000261169 CCNB3Q8WWL7 1395 aa7.38□□□□□ -1.23
LMO3-201ENST00000261169 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
LMO3-201ENST00000261169 UNC13AQ9UPW8 1703 aa7.37□□□□□ -1.23
LMO3-201ENST00000261169 CUX2O14529 1486 aa7.37□□□□□ -1.23
LMO3-201ENST00000261169 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa7.37□□□□□ -1.23
LMO3-201ENST00000261169 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
LMO3-201ENST00000261169 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
LMO3-201ENST00000261169 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
LMO3-201ENST00000261169 SMARCA4P51532 1647 aa7.36□□□□□ -1.23
LMO3-201ENST00000261169 ZBTB7CA1YPR0 619 aa7.36□□□□□ -1.23
LMO3-201ENST00000261169 DCAF11Q8TEB1 546 aa7.36□□□□□ -1.23
LMO3-201ENST00000261169 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
LMO3-201ENST00000261169 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa7.34□□□□□ -1.23
LMO3-201ENST00000261169 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
LMO3-201ENST00000261169 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP7.33□□□□□ -1.24
LMO3-201ENST00000261169 C14orf37Q86TY3 774 aa7.33□□□□□ -1.24
LMO3-201ENST00000261169 KNSTRNQ9Y448 316 aa7.32□□□□□ -1.24
LMO3-201ENST00000261169 A0A0G2JS52 829 aa7.32□□□□□ -1.24
LMO3-201ENST00000261169 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
LMO3-201ENST00000261169 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
LMO3-201ENST00000261169 RGS3P49796 1198 aa7.31□□□□□ -1.24
LMO3-201ENST00000261169 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
LMO3-201ENST00000261169 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa7.31□□□□□ -1.24
LMO3-201ENST00000261169 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
LMO3-201ENST00000261169 VPS8Q8N3P4 1428 aa7.31□□□□□ -1.24
LMO3-201ENST00000261169 PKD2Q13563 968 aa7.31□□□□□ -1.24
LMO3-201ENST00000261169 MLECQ14165 292 aa7.3□□□□□ -1.24
LMO3-201ENST00000261169 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa7.3□□□□□ -1.24
LMO3-201ENST00000261169 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
LMO3-201ENST00000261169 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
LMO3-201ENST00000261169 SOX12O15370 315 aa7.3□□□□□ -1.24
LMO3-201ENST00000261169 WIZO95785 1651 aa7.29□□□□□ -1.24
LMO3-201ENST00000261169 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
LMO3-201ENST00000261169 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
LMO3-201ENST00000261169 NCAPD3P42695 1498 aa7.28□□□□□ -1.24
LMO3-201ENST00000261169 GGT6Q6P531 493 aa7.28□□□□□ -1.24
LMO3-201ENST00000261169 L3MBTL2Q969R5 705 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-201ENST00000261169 SETD5Q9C0A6 1442 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-201ENST00000261169 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-201ENST00000261169 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
LMO3-201ENST00000261169 MPHOSPH9Q99550 1183 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-201ENST00000261169 ERCC6Q03468 1493 aa7.26□□□□□ -1.25
LMO3-201ENST00000261169 TPRNQ4KMQ1 711 aa7.26□□□□□ -1.25
LMO3-201ENST00000261169 LMOD2Q6P5Q4 547 aa7.26□□□□□ -1.25
LMO3-201ENST00000261169 FHAD1B1AJZ9 1412 aa7.25□□□□□ -1.25
LMO3-201ENST00000261169 FHOD3Q2V2M9 1422 aa7.25□□□□□ -1.25
LMO3-201ENST00000261169 STK26Q9P289 416 aa7.25□□□□□ -1.25
LMO3-201ENST00000261169 POGKQ9P215 609 aa7.25□□□□□ -1.25
LMO3-201ENST00000261169 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP7.25□□□□□ -1.25
LMO3-201ENST00000261169 PPP4R2Q9NY27 417 aa7.25□□□□□ -1.25
LMO3-201ENST00000261169 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
LMO3-201ENST00000261169 HMGXB3Q12766 1538 aa7.23□□□□□ -1.25
LMO3-201ENST00000261169 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
LMO3-201ENST00000261169 PEG3Q9GZU2 1588 aa7.22□□□□□ -1.25
LMO3-201ENST00000261169 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
LMO3-201ENST00000261169 NUP155O75694 1391 aa7.22□□□□□ -1.25
LMO3-201ENST00000261169 CFAP53Q96M91 514 aa7.22□□□□□ -1.25
LMO3-201ENST00000261169 ANP32EQ9BTT0 268 aa7.22□□□□□ -1.25
LMO3-201ENST00000261169 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
LMO3-201ENST00000261169 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
LMO3-201ENST00000261169 TMF1P82094 1093 aa7.21□□□□□ -1.26
LMO3-201ENST00000261169 CDCA8Q53HL2 280 aa7.21□□□□□ -1.26
LMO3-201ENST00000261169 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa7.2□□□□□ -1.26
LMO3-201ENST00000261169 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa7.2□□□□□ -1.26
LMO3-201ENST00000261169 MYH16Q9H6N6 1097 aa7.2□□□□□ -1.26
LMO3-201ENST00000261169 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa7.19□□□□□ -1.26
LMO3-201ENST00000261169 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa7.19□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.7 ms