RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259351.9

RALGPS1-201, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RALGPS1, Length 6,336 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-201ENST00000259351 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP17.25■□□□□ 0.35
RALGPS1-201ENST00000259351 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP17.22■□□□□ 0.35
RALGPS1-201ENST00000259351 RGL3Q3MIN7 710 aa17.16■□□□□ 0.34
RALGPS1-201ENST00000259351 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP17.16■□□□□ 0.34
RALGPS1-201ENST00000259351 PLEKHG5O94827 1062 aa17.14■□□□□ 0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 CEP162Q5TB80 1403 aa17.13■□□□□ 0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 KCNH8Q96L42 1107 aa17.12■□□□□ 0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP17.09■□□□□ 0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 SIN3AQ96ST3 1273 aa17.06■□□□□ 0.32
RALGPS1-201ENST00000259351 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP17.04■□□□□ 0.32
RALGPS1-201ENST00000259351 ZBTB7CA1YPR0 619 aa17.03■□□□□ 0.32
RALGPS1-201ENST00000259351 GOLGA3Q08378 1498 aa17.03■□□□□ 0.32
RALGPS1-201ENST00000259351 MYH16Q9H6N6 1097 aa17.02■□□□□ 0.32
RALGPS1-201ENST00000259351 A0A0G2JS52 829 aa17■□□□□ 0.31
RALGPS1-201ENST00000259351 PLEKHD1A6NEE1 506 aa17■□□□□ 0.31
RALGPS1-201ENST00000259351 C14orf37Q86TY3 774 aa16.99■□□□□ 0.31
RALGPS1-201ENST00000259351 NEUROD2Q15784 382 aa16.98■□□□□ 0.31
RALGPS1-201ENST00000259351 CARD11Q9BXL7 1154 aa16.97■□□□□ 0.31
RALGPS1-201ENST00000259351 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
RALGPS1-201ENST00000259351 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.31
RALGPS1-201ENST00000259351 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.31
RALGPS1-201ENST00000259351 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP16.96■□□□□ 0.3
RALGPS1-201ENST00000259351 KNSTRNQ9Y448 316 aa16.94■□□□□ 0.3
RALGPS1-201ENST00000259351 EEA1Q15075 1411 aa16.93■□□□□ 0.3
RALGPS1-201ENST00000259351 BECN1Q14457 450 aa16.92■□□□□ 0.3
RALGPS1-201ENST00000259351 TNIKQ9UKE5 1360 aa16.91■□□□□ 0.3
RALGPS1-201ENST00000259351 DDRGK1Q96HY6 314 aa16.9■□□□□ 0.3
RALGPS1-201ENST00000259351 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa16.89■□□□□ 0.3
RALGPS1-201ENST00000259351 RGS3P49796 1198 aa16.89■□□□□ 0.29
RALGPS1-201ENST00000259351 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
RALGPS1-201ENST00000259351 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
RALGPS1-201ENST00000259351 TPRNQ4KMQ1 711 aa16.87■□□□□ 0.29
RALGPS1-201ENST00000259351 CFAP53Q96M91 514 aa16.87■□□□□ 0.29
RALGPS1-201ENST00000259351 ANP32EQ9BTT0 268 aa16.87■□□□□ 0.29
RALGPS1-201ENST00000259351 NCLP19338 710 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
RALGPS1-201ENST00000259351 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa16.86■□□□□ 0.29
RALGPS1-201ENST00000259351 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
RALGPS1-201ENST00000259351 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
RALGPS1-201ENST00000259351 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
RALGPS1-201ENST00000259351 KIF27Q86VH2 1401 aa16.84■□□□□ 0.29
RALGPS1-201ENST00000259351 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.29
RALGPS1-201ENST00000259351 PPP4R2Q9NY27 417 aa16.83■□□□□ 0.28
RALGPS1-201ENST00000259351 CDCA8Q53HL2 280 aa16.82■□□□□ 0.28
RALGPS1-201ENST00000259351 CEP164Q9UPV0 1460 aa16.82■□□□□ 0.28
RALGPS1-201ENST00000259351 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa16.81■□□□□ 0.28
RALGPS1-201ENST00000259351 GOLGA6L22H0YM25 854 aa16.79■□□□□ 0.28
RALGPS1-201ENST00000259351 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP16.79■□□□□ 0.28
RALGPS1-201ENST00000259351 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
RALGPS1-201ENST00000259351 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa16.77■□□□□ 0.27
RALGPS1-201ENST00000259351 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.27
RALGPS1-201ENST00000259351 DCAF11Q8TEB1 546 aa16.76■□□□□ 0.27
RALGPS1-201ENST00000259351 CCNB3Q8WWL7 1395 aa16.75■□□□□ 0.27
RALGPS1-201ENST00000259351 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
RALGPS1-201ENST00000259351 POGKQ9P215 609 aa16.74■□□□□ 0.27
RALGPS1-201ENST00000259351 SOGA1O94964 1423 aa16.73■□□□□ 0.27
RALGPS1-201ENST00000259351 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
RALGPS1-201ENST00000259351 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa16.72■□□□□ 0.27
RALGPS1-201ENST00000259351 PTMAP06454 111 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
RALGPS1-201ENST00000259351 LMOD2Q6P5Q4 547 aa16.71■□□□□ 0.27
RALGPS1-201ENST00000259351 NUDCQ9Y266 331 aa16.71■□□□□ 0.27
RALGPS1-201ENST00000259351 TAOK2Q9UL54 1235 aa16.7■□□□□ 0.26
RALGPS1-201ENST00000259351 FOXD1Q16676 465 aa16.69■□□□□ 0.26
RALGPS1-201ENST00000259351 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
RALGPS1-201ENST00000259351 CASC1Q6TDU7 716 aa16.68■□□□□ 0.26
RALGPS1-201ENST00000259351 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
RALGPS1-201ENST00000259351 CECR2Q9BXF3 1484 aa16.66■□□□□ 0.26
RALGPS1-201ENST00000259351 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
RALGPS1-201ENST00000259351 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
RALGPS1-201ENST00000259351 SOX12O15370 315 aa16.65■□□□□ 0.26
RALGPS1-201ENST00000259351 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP16.65■□□□□ 0.26
RALGPS1-201ENST00000259351 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
RALGPS1-201ENST00000259351 PLCB2Q00722 1185 aa16.65■□□□□ 0.26
RALGPS1-201ENST00000259351 TMF1P82094 1093 aa16.64■□□□□ 0.26
RALGPS1-201ENST00000259351 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
RALGPS1-201ENST00000259351 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa16.62■□□□□ 0.25
RALGPS1-201ENST00000259351 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa16.61■□□□□ 0.25
RALGPS1-201ENST00000259351 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
RALGPS1-201ENST00000259351 ERICH6BQ5W0A0 696 aa16.61■□□□□ 0.25
RALGPS1-201ENST00000259351 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
RALGPS1-201ENST00000259351 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
RALGPS1-201ENST00000259351 FHAD1B1AJZ9 1412 aa16.59■□□□□ 0.25
RALGPS1-201ENST00000259351 CUX2O14529 1486 aa16.59■□□□□ 0.25
RALGPS1-201ENST00000259351 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.25
RALGPS1-201ENST00000259351 CCER2I3L3R5 266 aa16.58■□□□□ 0.24
RALGPS1-201ENST00000259351 PKD2Q13563 968 aa16.58■□□□□ 0.24
RALGPS1-201ENST00000259351 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
RALGPS1-201ENST00000259351 SETD5Q9C0A6 1442 aa16.57■□□□□ 0.24
RALGPS1-201ENST00000259351 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
RALGPS1-201ENST00000259351 MLECQ14165 292 aa16.57■□□□□ 0.24
RALGPS1-201ENST00000259351 MORC1Q86VD1 984 aa16.56■□□□□ 0.24
RALGPS1-201ENST00000259351 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
RALGPS1-201ENST00000259351 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa16.55■□□□□ 0.24
RALGPS1-201ENST00000259351 KCNJ4P48050 445 aa16.54■□□□□ 0.24
RALGPS1-201ENST00000259351 FGD1P98174 961 aa16.54■□□□□ 0.24
RALGPS1-201ENST00000259351 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
RALGPS1-201ENST00000259351 MS4A1P11836 297 aa16.53■□□□□ 0.24
RALGPS1-201ENST00000259351 STK26Q9P289 416 aa16.53■□□□□ 0.24
RALGPS1-201ENST00000259351 VPS8Q8N3P4 1428 aa16.52■□□□□ 0.24
RALGPS1-201ENST00000259351 APBB1O00213 710 aa16.52■□□□□ 0.23
RALGPS1-201ENST00000259351 GGT6Q6P531 493 aa16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.1 ms