RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258111.4

KCNMB4-201, Transcript of potassium calcium-activated channel subfamily M regulatory beta subunit 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNMB4, Length 4,731 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4-201ENST00000258111 MRS2Q9HD23 443 aa27.38■■□□□ 1.97
KCNMB4-201ENST00000258111 CANXP27824 592 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
KCNMB4-201ENST00000258111 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
KCNMB4-201ENST00000258111 ERCC6Q03468 1493 aa27.35■■□□□ 1.97
KCNMB4-201ENST00000258111 PLEKHD1A6NEE1 506 aa27.33■■□□□ 1.97
KCNMB4-201ENST00000258111 SOGA1O94964 1423 aa27.33■■□□□ 1.97
KCNMB4-201ENST00000258111 CUX2O14529 1486 aa27.3■■□□□ 1.96
KCNMB4-201ENST00000258111 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP27.29■■□□□ 1.96
KCNMB4-201ENST00000258111 CHGAP10645 457 aaKnown RBP27.28■■□□□ 1.96
KCNMB4-201ENST00000258111 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
KCNMB4-201ENST00000258111 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa27.27■■□□□ 1.96
KCNMB4-201ENST00000258111 TMC1Q8TDI8 760 aa27.24■■□□□ 1.95
KCNMB4-201ENST00000258111 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.23■■□□□ 1.95
KCNMB4-201ENST00000258111 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa27.22■■□□□ 1.95
KCNMB4-201ENST00000258111 WIZO95785 1651 aa27.21■■□□□ 1.95
KCNMB4-201ENST00000258111 KCNH8Q96L42 1107 aa27.19■■□□□ 1.94
KCNMB4-201ENST00000258111 STAG3Q9UJ98 1225 aa27.19■■□□□ 1.94
KCNMB4-201ENST00000258111 ABCC8Q09428 1581 aa27.19■■□□□ 1.94
KCNMB4-201ENST00000258111 PPP4R2Q9NY27 417 aa27.18■■□□□ 1.94
KCNMB4-201ENST00000258111 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
KCNMB4-201ENST00000258111 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
KCNMB4-201ENST00000258111 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP27.17■■□□□ 1.94
KCNMB4-201ENST00000258111 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa27.14■■□□□ 1.93
KCNMB4-201ENST00000258111 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.14■■□□□ 1.93
KCNMB4-201ENST00000258111 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
KCNMB4-201ENST00000258111 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
KCNMB4-201ENST00000258111 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.12■■□□□ 1.93
KCNMB4-201ENST00000258111 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.1■■□□□ 1.93
KCNMB4-201ENST00000258111 DDRGK1Q96HY6 314 aa27.1■■□□□ 1.93
KCNMB4-201ENST00000258111 NEFMP07197 916 aa27.09■■□□□ 1.93
KCNMB4-201ENST00000258111 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
KCNMB4-201ENST00000258111 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
KCNMB4-201ENST00000258111 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
KCNMB4-201ENST00000258111 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.05■■□□□ 1.92
KCNMB4-201ENST00000258111 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa27.04■■□□□ 1.92
KCNMB4-201ENST00000258111 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
KCNMB4-201ENST00000258111 SMARCA4P51532 1647 aa27.02■■□□□ 1.92
KCNMB4-201ENST00000258111 CCER2I3L3R5 266 aa27.02■■□□□ 1.92
KCNMB4-201ENST00000258111 DEKP35659 375 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
KCNMB4-201ENST00000258111 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
KCNMB4-201ENST00000258111 VPS8Q8N3P4 1428 aa26.94■■□□□ 1.9
KCNMB4-201ENST00000258111 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa26.94■■□□□ 1.9
KCNMB4-201ENST00000258111 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
KCNMB4-201ENST00000258111 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
KCNMB4-201ENST00000258111 CCNB3Q8WWL7 1395 aa26.91■■□□□ 1.9
KCNMB4-201ENST00000258111 PLPPR3Q6T4P5 718 aa26.91■■□□□ 1.9
KCNMB4-201ENST00000258111 ERICH6BQ5W0A0 696 aa26.88■■□□□ 1.89
KCNMB4-201ENST00000258111 SIN3AQ96ST3 1273 aa26.88■■□□□ 1.89
KCNMB4-201ENST00000258111 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa26.85■■□□□ 1.89
KCNMB4-201ENST00000258111 SLC24A1O60721 1099 aa26.82■■□□□ 1.88
KCNMB4-201ENST00000258111 BECN1Q14457 450 aa26.82■■□□□ 1.88
KCNMB4-201ENST00000258111 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP26.81■■□□□ 1.88
KCNMB4-201ENST00000258111 ARXQ96QS3 562 aa26.81■■□□□ 1.88
KCNMB4-201ENST00000258111 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
KCNMB4-201ENST00000258111 RGL3Q3MIN7 710 aa26.77■■□□□ 1.88
KCNMB4-201ENST00000258111 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
KCNMB4-201ENST00000258111 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa26.72■■□□□ 1.87
KCNMB4-201ENST00000258111 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
KCNMB4-201ENST00000258111 FMN1Q68DA7 1419 aa26.71■■□□□ 1.87
KCNMB4-201ENST00000258111 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26.68■■□□□ 1.86
KCNMB4-201ENST00000258111 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa26.64■■□□□ 1.85
KCNMB4-201ENST00000258111 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
KCNMB4-201ENST00000258111 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.63■■□□□ 1.85
KCNMB4-201ENST00000258111 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
KCNMB4-201ENST00000258111 SETD5Q9C0A6 1442 aa26.59■■□□□ 1.85
KCNMB4-201ENST00000258111 CARD11Q9BXL7 1154 aa26.57■■□□□ 1.84
KCNMB4-201ENST00000258111 NCAPD3P42695 1498 aa26.54■■□□□ 1.84
KCNMB4-201ENST00000258111 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.53■■□□□ 1.84
KCNMB4-201ENST00000258111 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa26.53■■□□□ 1.84
KCNMB4-201ENST00000258111 CDCA8Q53HL2 280 aa26.51■■□□□ 1.83
KCNMB4-201ENST00000258111 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
KCNMB4-201ENST00000258111 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
KCNMB4-201ENST00000258111 FHOD3Q2V2M9 1422 aa26.5■■□□□ 1.83
KCNMB4-201ENST00000258111 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
KCNMB4-201ENST00000258111 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa26.46■■□□□ 1.83
KCNMB4-201ENST00000258111 GOLGA6L22H0YM25 854 aa26.44■■□□□ 1.82
KCNMB4-201ENST00000258111 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
KCNMB4-201ENST00000258111 JPH4Q96JJ6 628 aa26.43■■□□□ 1.82
KCNMB4-201ENST00000258111 FANCIQ9NVI1 1328 aa26.43■■□□□ 1.82
KCNMB4-201ENST00000258111 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
KCNMB4-201ENST00000258111 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
KCNMB4-201ENST00000258111 RGS3P49796 1198 aa26.4■■□□□ 1.82
KCNMB4-201ENST00000258111 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
KCNMB4-201ENST00000258111 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa26.39■■□□□ 1.81
KCNMB4-201ENST00000258111 KANK1Q14678 1352 aa26.37■■□□□ 1.81
KCNMB4-201ENST00000258111 KNSTRNQ9Y448 316 aa26.37■■□□□ 1.81
KCNMB4-201ENST00000258111 DCAF11Q8TEB1 546 aa26.36■■□□□ 1.81
KCNMB4-201ENST00000258111 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
KCNMB4-201ENST00000258111 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.35■■□□□ 1.81
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KCNMB4-201ENST00000258111 IGF1RP08069 1367 aa26.32■■□□□ 1.8
KCNMB4-201ENST00000258111 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa26.28■■□□□ 1.8
KCNMB4-201ENST00000258111 MYH16Q9H6N6 1097 aa26.27■■□□□ 1.8
KCNMB4-201ENST00000258111 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.27■■□□□ 1.8
KCNMB4-201ENST00000258111 USP35Q9P2H5 1018 aa26.26■■□□□ 1.79
KCNMB4-201ENST00000258111 NUDCQ9Y266 331 aa26.25■■□□□ 1.79
KCNMB4-201ENST00000258111 CFAP53Q96M91 514 aa26.25■■□□□ 1.79
KCNMB4-201ENST00000258111 MPHOSPH9Q99550 1183 aa26.25■■□□□ 1.79
KCNMB4-201ENST00000258111 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
KCNMB4-201ENST00000258111 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.24■■□□□ 1.79
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