RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000255476.2

RFXAP-201, Transcript of regulatory factor X associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RFXAP, Length 2,304 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAP-201ENST00000255476 ADAMTS12P58397 1594 aa33.02■■■□□ 2.88
RFXAP-201ENST00000255476 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP33.02■■■□□ 2.88
RFXAP-201ENST00000255476 FHAD1B1AJZ9 1412 aa33.01■■■□□ 2.87
RFXAP-201ENST00000255476 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa32.94■■■□□ 2.86
RFXAP-201ENST00000255476 P3H3Q8IVL6 736 aa32.88■■■□□ 2.85
RFXAP-201ENST00000255476 APLP2Q06481 763 aa32.8■■■□□ 2.84
RFXAP-201ENST00000255476 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP32.78■■■□□ 2.84
RFXAP-201ENST00000255476 FHOD3Q2V2M9 1422 aa32.77■■■□□ 2.84
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RFXAP-201ENST00000255476 GRIN2AQ12879 1464 aa32.73■■■□□ 2.83
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RFXAP-201ENST00000255476 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP32.69■■■□□ 2.82
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RFXAP-201ENST00000255476 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP32.11■■■□□ 2.73
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RFXAP-201ENST00000255476 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP32.09■■■□□ 2.73
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RFXAP-201ENST00000255476 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP32.04■■■□□ 2.72
RFXAP-201ENST00000255476 CCNB3Q8WWL7 1395 aa32.04■■■□□ 2.72
RFXAP-201ENST00000255476 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa32.03■■■□□ 2.72
RFXAP-201ENST00000255476 PLB1Q6P1J6 1458 aa32.03■■■□□ 2.72
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RFXAP-201ENST00000255476 ARHGEF11O15085 1522 aa31.8■■■□□ 2.68
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RFXAP-201ENST00000255476 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP31.74■■■□□ 2.67
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RFXAP-201ENST00000255476 PTPN23Q9H3S7 1636 aa31.63■■■□□ 2.65
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RFXAP-201ENST00000255476 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP31.52■■■□□ 2.64
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RFXAP-201ENST00000255476 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa31.4■■■□□ 2.62
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RFXAP-201ENST00000255476 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP31.35■■■□□ 2.61
RFXAP-201ENST00000255476 KDM5BQ9UGL1 1544 aa31.34■■■□□ 2.61
RFXAP-201ENST00000255476 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa31.31■■■□□ 2.6
RFXAP-201ENST00000255476 HFM1A2PYH4 1435 aa31.3■■■□□ 2.6
RFXAP-201ENST00000255476 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa31.28■■■□□ 2.6
RFXAP-201ENST00000255476 KCNH8Q96L42 1107 aa31.27■■■□□ 2.6
RFXAP-201ENST00000255476 DAPK1P53355 1430 aa31.27■■■□□ 2.6
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