RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000211953.1

Lncbate1-201, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Lncbate1, Length 812 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Atf5O70191 283 aa11.24□□□□□ -0.61
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Col17a1Q07563 1470 aa11.23□□□□□ -0.61
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa11.23□□□□□ -0.61
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Ppp4r2Q0VGB7 417 aa11.22□□□□□ -0.61
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Arhgap35Q91YM2 1499 aa11.22□□□□□ -0.61
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Rad54l2Q99NG0 1466 aa11.18□□□□□ -0.62
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Npm2Q80W85 207 aa11.17□□□□□ -0.62
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Magi3Q9EQJ9 1476 aa11.17□□□□□ -0.62
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Gpatch8A2A6A1 1505 aa11.16□□□□□ -0.62
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Rsph4aQ8BYM7 716 aa11.15□□□□□ -0.62
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Znf219Q6IQX8 726 aa11.14□□□□□ -0.63
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa11.14□□□□□ -0.63
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 SynmQ70IV5 1561 aa11.14□□□□□ -0.63
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Grin2aP35436 1464 aa11.12□□□□□ -0.63
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 1700123L14RikQ3V2K7 440 aa11.12□□□□□ -0.63
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Carmil1Q6EDY6 1374 aa11.12□□□□□ -0.63
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Clip1Q922J3 1391 aa11.12□□□□□ -0.63
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Rpap1Q80TE0 1409 aa11.09□□□□□ -0.63
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Pla2r1Q62028 1487 aa11.09□□□□□ -0.63
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Polr1aO35134 1717 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Erich3F6QRE9 1637 aa11.06□□□□□ -0.64
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Eea1Q8BL66 1411 aa11.06□□□□□ -0.64
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Hs6st3Q9QYK4 470 aa11.05□□□□□ -0.64
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 EprsQ8CGC7 1512 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Fam71e1A1L3C1 212 aa11.03□□□□□ -0.64
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa11.03□□□□□ -0.64
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Fgd6Q69ZL1 1399 aa11.03□□□□□ -0.64
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Ankrd26Q811D2 1581 aa11.01□□□□□ -0.65
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Fyco1Q8VDC1 1437 aa11□□□□□ -0.65
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Myt1lP97500 1187 aa10.99□□□□□ -0.65
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Abcc2Q8VI47 1543 aa10.99□□□□□ -0.65
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa10.99□□□□□ -0.65
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Cep170Q6A065 1588 aa10.99□□□□□ -0.65
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Zeb1Q64318 1117 aa10.98□□□□□ -0.65
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Setd5Q5XJV7 1441 aa10.98□□□□□ -0.65
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Adamts12Q811B3 1600 aa10.98□□□□□ -0.65
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 PxdnQ3UQ28 1475 aa10.97□□□□□ -0.65
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa10.97□□□□□ -0.65
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Abcc1O35379 1528 aa10.97□□□□□ -0.65
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Adgrl3Q80TS3 1537 aa10.97□□□□□ -0.65
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Abca16E9PWJ7 1678 aa10.97□□□□□ -0.65
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Lmo7E9PYF4 1699 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Dnmt1P13864 1620 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Cux1P53564 1515 aa10.96□□□□□ -0.65
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Arap1Q4LDD4 1452 aa10.96□□□□□ -0.65
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 WizO88286 1684 aaKnown RBP10.95□□□□□ -0.66
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP10.95□□□□□ -0.66
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Rimbp2Q80U40 1072 aa10.95□□□□□ -0.66
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 AknaQ80VW7 1404 aa10.94□□□□□ -0.66
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Chd1P40201 1711 aa10.94□□□□□ -0.66
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 BC005561E9Q5E2 1589 aa10.94□□□□□ -0.66
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 PtprtQ99M80 1454 aa10.93□□□□□ -0.66
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Gm156Q58A37 223 aa10.93□□□□□ -0.66
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Map3k4O08648 1597 aa10.93□□□□□ -0.66
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Peg3Q3URU2 1571 aa10.93□□□□□ -0.66
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 CntlnA2AM05 1397 aa10.92□□□□□ -0.66
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Abca5Q8K448 1642 aa10.92□□□□□ -0.66
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Tiam1Q60610 1591 aa10.92□□□□□ -0.66
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 BlmO88700 1416 aa10.92□□□□□ -0.66
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 CadpsQ80TJ1 1355 aa10.91□□□□□ -0.66
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 TchhA0A0B4J1F9 1599 aa10.91□□□□□ -0.66
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Ythdc2B2RR83 1445 aaKnown RBP10.91□□□□□ -0.66
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Soga1E1U8D0 1418 aa10.91□□□□□ -0.66
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Neo1P97798 1493 aa10.9□□□□□ -0.66
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Gm7298A0A0N4SVU1 1476 aa10.89□□□□□ -0.67
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Pcf11G3X9Z4 1553 aa10.89□□□□□ -0.67
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Pprc1Q6NZN1 1644 aa10.88□□□□□ -0.67
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Arhgap27A2AB59 869 aa10.88□□□□□ -0.67
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Pcdh10E9PXQ7 1057 aa10.88□□□□□ -0.67
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Slx4Q6P1D7 1565 aa10.86□□□□□ -0.67
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Naip1Q9QWK5 1403 aa10.86□□□□□ -0.67
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Setbp1Q9Z180 1582 aa10.83□□□□□ -0.68
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Aebp1Q640N1 1128 aa10.83□□□□□ -0.68
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP10.83□□□□□ -0.68
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Arhgef12Q8R4H2 1543 aaKnown RBP10.82□□□□□ -0.68
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Gm14025A2AP89 1413 aa10.82□□□□□ -0.68
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa10.79□□□□□ -0.68
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Gm1043A0A140LJC2 1431 aa10.78□□□□□ -0.68
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 AI481877A2ALV5 1481 aa10.77□□□□□ -0.69
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Jph4Q80WT0 628 aa10.76□□□□□ -0.69
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Ncapd3Q6ZQK0 1506 aa10.75□□□□□ -0.69
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Nlrp6Q91WS2 869 aa10.75□□□□□ -0.69
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Lmtk2Q3TYD6 1471 aa10.74□□□□□ -0.69
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Ak9G3UYQ4 1894 aa10.74□□□□□ -0.69
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa10.74□□□□□ -0.69
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Kif27Q7M6Z4 1394 aa10.74□□□□□ -0.69
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 WrnO09053 1401 aa10.73□□□□□ -0.69
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Rapgef6Q5NCJ1 1609 aa10.73□□□□□ -0.69
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Rrbp1Q99PL5 1605 aaKnown RBP10.72□□□□□ -0.69
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Mier1Q5UAK0 511 aa10.7□□□□□ -0.7
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Ncoa2Q61026 1462 aa10.69□□□□□ -0.7
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 UbtfP25976 765 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa10.69□□□□□ -0.7
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Gcc2Q8CHG3 1679 aa10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 53 ms