RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000208454.1

BC030336-205, mousemouse

TSL 2 BASIC

Gene BC030336, Length 813 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC030336-205ENSMUST00000208454 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa48,32■■■■■ 5,33
BC030336-205ENSMUST00000208454 Pla2r1Q62028 1487 aa48,3■■■■■ 5,32
BC030336-205ENSMUST00000208454 Chd1P40201 1711 aa48,29■■■■■ 5,32
BC030336-205ENSMUST00000208454 CadpsQ80TJ1 1355 aa48,26■■■■■ 5,32
BC030336-205ENSMUST00000208454 NrkQ9R0G8 1455 aa48,26■■■■■ 5,32
BC030336-205ENSMUST00000208454 Gpatch8A2A6A1 1505 aa48,22■■■■■ 5,31
BC030336-205ENSMUST00000208454 SynmQ70IV5 1561 aa48,14■■■■■ 5,3
BC030336-205ENSMUST00000208454 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP48,12■■■■■ 5,29
BC030336-205ENSMUST00000208454 Soga1E1U8D0 1418 aa48,11■■■■■ 5,29
BC030336-205ENSMUST00000208454 Dnmt1P13864 1620 aaKnown RBP48,07■■■■■ 5,29
BC030336-205ENSMUST00000208454 Setbp1Q9Z180 1582 aa48,04■■■■■ 5,28
BC030336-205ENSMUST00000208454 Shroom4Q1W617 1475 aa48,04■■■■■ 5,28
BC030336-205ENSMUST00000208454 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa48,01■■■■■ 5,28
BC030336-205ENSMUST00000208454 Neo1P97798 1493 aa47,98■■■■■ 5,27
BC030336-205ENSMUST00000208454 Ppp1r18Q8BQ30 594 aa47,95■■■■■ 5,27
BC030336-205ENSMUST00000208454 Arhgap27A2AB59 869 aa47,93■■■■■ 5,26
BC030336-205ENSMUST00000208454 BC005561E9Q5E2 1589 aa47,88■■■■■ 5,26
BC030336-205ENSMUST00000208454 Abcc2Q8VI47 1543 aa47,87■■■■■ 5,25
BC030336-205ENSMUST00000208454 Zeb1Q64318 1117 aa47,87■■■■■ 5,25
BC030336-205ENSMUST00000208454 Abca16E9PWJ7 1678 aa47,86■■■■■ 5,25
BC030336-205ENSMUST00000208454 Gm14025A2AP89 1413 aa47,84■■■■■ 5,25
BC030336-205ENSMUST00000208454 Ak9G3UYQ4 1894 aa47,82■■■■■ 5,25
BC030336-205ENSMUST00000208454 Map3k4O08648 1597 aa47,82■■■■■ 5,25
BC030336-205ENSMUST00000208454 TchhA0A0B4J1F9 1599 aa47,79■■■■■ 5,24
BC030336-205ENSMUST00000208454 PxdnQ3UQ28 1475 aa47,76■■■■■ 5,24
BC030336-205ENSMUST00000208454 WizO88286 1684 aaKnown RBP47,76■■■■■ 5,24
BC030336-205ENSMUST00000208454 AI481877A2ALV5 1481 aa47,74■■■■■ 5,23
BC030336-205ENSMUST00000208454 Ifnlr1Q8CGK5 535 aa47,63■■■■■ 5,22
BC030336-205ENSMUST00000208454 Adamts12Q811B3 1600 aa47,6■■■■■ 5,21
BC030336-205ENSMUST00000208454 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa47,58■■■■■ 5,21
BC030336-205ENSMUST00000208454 EprsQ8CGC7 1512 aaKnown RBP47,56■■■■■ 5,2
BC030336-205ENSMUST00000208454 Chic1Q8CBW7 227 aa47,54■■■■■ 5,2
BC030336-205ENSMUST00000208454 Arhgef12Q8R4H2 1543 aaKnown RBP47,54■■■■■ 5,2
BC030336-205ENSMUST00000208454 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP47,5■■■■■ 5,19
BC030336-205ENSMUST00000208454 Slx4Q6P1D7 1565 aa47,46■■■■■ 5,19
BC030336-205ENSMUST00000208454 Clasp1Q80TV8 1535 aaKnown RBP47,35■■■■■ 5,17
BC030336-205ENSMUST00000208454 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa47,33■■■■■ 5,17
BC030336-205ENSMUST00000208454 AdgbG3UZ78 1657 aa47,33■■■■■ 5,17
BC030336-205ENSMUST00000208454 Jph4Q80WT0 628 aa47,32■■■■■ 5,17
BC030336-205ENSMUST00000208454 Ttc37F8VPK0 1563 aa47,28■■■■■ 5,16
BC030336-205ENSMUST00000208454 Rpap1Q80TE0 1409 aa47,27■■■■■ 5,16
BC030336-205ENSMUST00000208454 Fkbp15Q6P9Q6 1216 aaKnown RBP47,23■■■■■ 5,15
BC030336-205ENSMUST00000208454 Mapkbp1Q6NS57 1503 aa47,21■■■■■ 5,15
BC030336-205ENSMUST00000208454 Arid3cA6PWV5 409 aa47,17■■■■■ 5,14
BC030336-205ENSMUST00000208454 Npm2Q80W85 207 aa47,17■■■■■ 5,14
BC030336-205ENSMUST00000208454 Gm7298A0A0N4SVU1 1476 aa47,1■■■■■ 5,13
BC030336-205ENSMUST00000208454 Arhgef11Q68FM7 1552 aa47,09■■■■■ 5,13
BC030336-205ENSMUST00000208454 Depdc5P61460 1591 aa47,06■■■■■ 5,12
BC030336-205ENSMUST00000208454 Carmil1Q6EDY6 1374 aa47,01■■■■■ 5,12
BC030336-205ENSMUST00000208454 Lrrc9Q8CDN9 1456 aa47■■■■■ 5,11
BC030336-205ENSMUST00000208454 Alpk3Q924C5 1678 aa46,96■■■■■ 5,11
BC030336-205ENSMUST00000208454 Plppr3Q7TPB0 716 aa46,95■■■■■ 5,11
BC030336-205ENSMUST00000208454 Igf1rQ60751 1373 aa46,95■■■■■ 5,11
BC030336-205ENSMUST00000208454 Abca5Q8K448 1642 aa46,94■■■■■ 5,11
BC030336-205ENSMUST00000208454 Map3k1P53349 1493 aa46,9■■■■■ 5,1
BC030336-205ENSMUST00000208454 Zfyve16Q80U44 1528 aa46,89■■■■■ 5,1
BC030336-205ENSMUST00000208454 Znf608Q56A10 1511 aa46,88■■■■■ 5,09
BC030336-205ENSMUST00000208454 WrnO09053 1401 aa46,86■■■■■ 5,09
BC030336-205ENSMUST00000208454 Rrbp1Q99PL5 1605 aaKnown RBP46,84■■■■■ 5,09
BC030336-205ENSMUST00000208454 Fndc1E9Q043 1732 aa46,83■■■■■ 5,09
BC030336-205ENSMUST00000208454 Kdm5bQ80Y84 1544 aa46,83■■■■■ 5,09
BC030336-205ENSMUST00000208454 Wdr7Q920I9 1489 aa46,73■■■■■ 5,07
BC030336-205ENSMUST00000208454 Polr1aO35134 1717 aaKnown RBP46,72■■■■■ 5,07
BC030336-205ENSMUST00000208454 Dnajc5gQ8C632 165 aa46,64■■■■■ 5,06
BC030336-205ENSMUST00000208454 Arhgap35Q91YM2 1499 aa46,61■■■■■ 5,05
BC030336-205ENSMUST00000208454 NhsB1AV60 1647 aa46,53■■■■■ 5,04
BC030336-205ENSMUST00000208454 Cul7Q8VE73 1689 aa46,51■■■■■ 5,04
BC030336-205ENSMUST00000208454 MlecQ6ZQI3 291 aaKnown RBP46,49■■■■■ 5,03
BC030336-205ENSMUST00000208454 Cux1P53564 1515 aa46,47■■■■■ 5,03
BC030336-205ENSMUST00000208454 Arhgap31A6X8Z5 1425 aa46,45■■■■■ 5,03
BC030336-205ENSMUST00000208454 Atp10dQ8K2X1 1416 aa46,43■■■■■ 5,02
BC030336-205ENSMUST00000208454 AglF8VPN4 1532 aa46,43■■■■■ 5,02
BC030336-205ENSMUST00000208454 Ccdc141E9Q8Q6 1531 aa46,37■■■■■ 5,01
BC030336-205ENSMUST00000208454 Clip1Q922J3 1391 aa46,3■■■■■ 5
BC030336-205ENSMUST00000208454 Fyco1Q8VDC1 1437 aa46,25■■■■■ 4,99
BC030336-205ENSMUST00000208454 Rnf17Q99MV7 1640 aa46,24■■■■■ 4,99
BC030336-205ENSMUST00000208454 Cyb5rlB1AS42 316 aa46,23■■■■■ 4,99
BC030336-205ENSMUST00000208454 Gab3Q8BSM5 595 aa46,22■■■■■ 4,99
BC030336-205ENSMUST00000208454 Gcc2Q8CHG3 1679 aa46,15■■■■■ 4,98
BC030336-205ENSMUST00000208454 Kdm6bQ5NCY0 1641 aa46,13■■■■■ 4,97
BC030336-205ENSMUST00000208454 Mroh2aD3Z750 1679 aa46,11■■■■■ 4,97
BC030336-205ENSMUST00000208454 Brwd3A2AHJ4 1799 aa46,07■■■■■ 4,97
BC030336-205ENSMUST00000208454 A2mQ6GQT1 1474 aa46,06■■■■■ 4,96
BC030336-205ENSMUST00000208454 Abca8bQ8K440 1620 aa46,02■■■■■ 4,96
BC030336-205ENSMUST00000208454 Kiaa1210E9Q0C6 1637 aa45,99■■■■■ 4,95
BC030336-205ENSMUST00000208454 Fancd2Q80V62 1450 aa45,97■■■■■ 4,95
BC030336-205ENSMUST00000208454 Myt1lP97500 1187 aa45,96■■■■■ 4,95
BC030336-205ENSMUST00000208454 Cep162Q6ZQ06 1403 aa45,92■■■■■ 4,94
BC030336-205ENSMUST00000208454 Ncoa2Q61026 1462 aa45,92■■■■■ 4,94
BC030336-205ENSMUST00000208454 Naip2Q9QUK4 1447 aa45,9■■■■■ 4,94
BC030336-205ENSMUST00000208454 Rapgef6Q5NCJ1 1609 aa45,89■■■■■ 4,94
BC030336-205ENSMUST00000208454 BlmO88700 1416 aa45,85■■■■■ 4,93
BC030336-205ENSMUST00000208454 Ercc6l2Q9JIM3 1537 aa45,83■■■■■ 4,93
BC030336-205ENSMUST00000208454 Arap1Q4LDD4 1452 aa45,75■■■■■ 4,91
BC030336-205ENSMUST00000208454 Ankrd26Q811D2 1581 aa45,73■■■■■ 4,91
BC030336-205ENSMUST00000208454 Kif27Q7M6Z4 1394 aa45,72■■■■■ 4,91
BC030336-205ENSMUST00000208454 Aebp1Q640N1 1128 aa45,71■■■■■ 4,91
BC030336-205ENSMUST00000208454 Magi1Q6RHR9 1471 aa45,71■■■■■ 4,91
BC030336-205ENSMUST00000208454 Hecw2Q6I6G8 1578 aa45,71■■■■■ 4,91
BC030336-205ENSMUST00000208454 Mlh3A0A1Y7VMP7 1443 aa45,69■■■■■ 4,91
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 18,4 ms