RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000172480.1

Gm20508-201, mousemouse

TSL 2 BASIC

Gene Gm20508, Length 487 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20508-201ENSMUST00000172480 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa15.69■□□□□ 0.1
Gm20508-201ENSMUST00000172480 Pla2r1Q62028 1487 aa15.67■□□□□ 0.1
Gm20508-201ENSMUST00000172480 Gpatch8A2A6A1 1505 aa15.65■□□□□ 0.1
Gm20508-201ENSMUST00000172480 CadpsQ80TJ1 1355 aa15.63■□□□□ 0.09
Gm20508-201ENSMUST00000172480 Chd1P40201 1711 aa15.63■□□□□ 0.09
Gm20508-201ENSMUST00000172480 NrkQ9R0G8 1455 aa15.62■□□□□ 0.09
Gm20508-201ENSMUST00000172480 Setbp1Q9Z180 1582 aa15.6■□□□□ 0.09
Gm20508-201ENSMUST00000172480 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
Gm20508-201ENSMUST00000172480 Soga1E1U8D0 1418 aa15.58■□□□□ 0.08
Gm20508-201ENSMUST00000172480 SynmQ70IV5 1561 aa15.58■□□□□ 0.08
Gm20508-201ENSMUST00000172480 Dnmt1P13864 1620 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
Gm20508-201ENSMUST00000172480 Neo1P97798 1493 aa15.55■□□□□ 0.08
Gm20508-201ENSMUST00000172480 Abcc2Q8VI47 1543 aa15.54■□□□□ 0.08
Gm20508-201ENSMUST00000172480 Shroom4Q1W617 1475 aa15.54■□□□□ 0.08
Gm20508-201ENSMUST00000172480 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa15.54■□□□□ 0.08
Gm20508-201ENSMUST00000172480 BC005561E9Q5E2 1589 aa15.53■□□□□ 0.08
Gm20508-201ENSMUST00000172480 Ppp1r18Q8BQ30 594 aa15.52■□□□□ 0.08
Gm20508-201ENSMUST00000172480 Map3k4O08648 1597 aa15.5■□□□□ 0.07
Gm20508-201ENSMUST00000172480 Arhgap27A2AB59 869 aa15.5■□□□□ 0.07
Gm20508-201ENSMUST00000172480 Abca16E9PWJ7 1678 aa15.5■□□□□ 0.07
Gm20508-201ENSMUST00000172480 Gm14025A2AP89 1413 aa15.5■□□□□ 0.07
Gm20508-201ENSMUST00000172480 PxdnQ3UQ28 1475 aa15.49■□□□□ 0.07
Gm20508-201ENSMUST00000172480 AI481877A2ALV5 1481 aa15.48■□□□□ 0.07
Gm20508-201ENSMUST00000172480 Ak9G3UYQ4 1894 aa15.48■□□□□ 0.07
Gm20508-201ENSMUST00000172480 TchhA0A0B4J1F9 1599 aa15.46■□□□□ 0.07
Gm20508-201ENSMUST00000172480 WizO88286 1684 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
Gm20508-201ENSMUST00000172480 EprsQ8CGC7 1512 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
Gm20508-201ENSMUST00000172480 Arhgef12Q8R4H2 1543 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
Gm20508-201ENSMUST00000172480 Zeb1Q64318 1117 aa15.42■□□□□ 0.06
Gm20508-201ENSMUST00000172480 Adamts12Q811B3 1600 aa15.42■□□□□ 0.06
Gm20508-201ENSMUST00000172480 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa15.42■□□□□ 0.06
Gm20508-201ENSMUST00000172480 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
Gm20508-201ENSMUST00000172480 Ifnlr1Q8CGK5 535 aa15.4■□□□□ 0.06
Gm20508-201ENSMUST00000172480 Slx4Q6P1D7 1565 aa15.39■□□□□ 0.05
Gm20508-201ENSMUST00000172480 Chic1Q8CBW7 227 aa15.38■□□□□ 0.05
Gm20508-201ENSMUST00000172480 Clasp1Q80TV8 1535 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
Gm20508-201ENSMUST00000172480 Ttc37F8VPK0 1563 aa15.33■□□□□ 0.05
Gm20508-201ENSMUST00000172480 AdgbG3UZ78 1657 aa15.33■□□□□ 0.04
Gm20508-201ENSMUST00000172480 Jph4Q80WT0 628 aa15.32■□□□□ 0.04
Gm20508-201ENSMUST00000172480 Mapkbp1Q6NS57 1503 aa15.32■□□□□ 0.04
Gm20508-201ENSMUST00000172480 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa15.31■□□□□ 0.04
Gm20508-201ENSMUST00000172480 Rpap1Q80TE0 1409 aa15.29■□□□□ 0.04
Gm20508-201ENSMUST00000172480 Arid3cA6PWV5 409 aa15.27■□□□□ 0.04
Gm20508-201ENSMUST00000172480 Depdc5P61460 1591 aa15.27■□□□□ 0.03
Gm20508-201ENSMUST00000172480 Fkbp15Q6P9Q6 1216 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
Gm20508-201ENSMUST00000172480 Arhgef11Q68FM7 1552 aa15.26■□□□□ 0.03
Gm20508-201ENSMUST00000172480 Alpk3Q924C5 1678 aa15.25■□□□□ 0.03
Gm20508-201ENSMUST00000172480 Gm7298A0A0N4SVU1 1476 aa15.25■□□□□ 0.03
Gm20508-201ENSMUST00000172480 Lrrc9Q8CDN9 1456 aa15.25■□□□□ 0.03
Gm20508-201ENSMUST00000172480 Znf608Q56A10 1511 aa15.22■□□□□ 0.03
Gm20508-201ENSMUST00000172480 Carmil1Q6EDY6 1374 aa15.21■□□□□ 0.02
Gm20508-201ENSMUST00000172480 Abca5Q8K448 1642 aa15.21■□□□□ 0.02
Gm20508-201ENSMUST00000172480 Zfyve16Q80U44 1528 aa15.2■□□□□ 0.02
Gm20508-201ENSMUST00000172480 Plppr3Q7TPB0 716 aa15.19■□□□□ 0.02
Gm20508-201ENSMUST00000172480 Npm2Q80W85 207 aa15.19■□□□□ 0.02
Gm20508-201ENSMUST00000172480 Dnajc5gQ8C632 165 aa15.19■□□□□ 0.02
Gm20508-201ENSMUST00000172480 Fndc1E9Q043 1732 aa15.19■□□□□ 0.02
Gm20508-201ENSMUST00000172480 Igf1rQ60751 1373 aa15.19■□□□□ 0.02
Gm20508-201ENSMUST00000172480 Map3k1P53349 1493 aa15.19■□□□□ 0.02
Gm20508-201ENSMUST00000172480 Kdm5bQ80Y84 1544 aa15.18■□□□□ 0.02
Gm20508-201ENSMUST00000172480 WrnO09053 1401 aa15.17■□□□□ 0.02
Gm20508-201ENSMUST00000172480 Wdr7Q920I9 1489 aa15.14■□□□□ 0.01
Gm20508-201ENSMUST00000172480 Rrbp1Q99PL5 1605 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
Gm20508-201ENSMUST00000172480 Arhgap35Q91YM2 1499 aa15.09■□□□□ 0.01
Gm20508-201ENSMUST00000172480 NhsB1AV60 1647 aa15.07■□□□□ 0
Gm20508-201ENSMUST00000172480 Polr1aO35134 1717 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
Gm20508-201ENSMUST00000172480 Cul7Q8VE73 1689 aa15.06■□□□□ 0
Gm20508-201ENSMUST00000172480 AglF8VPN4 1532 aa15.06■□□□□ 0
Gm20508-201ENSMUST00000172480 MlecQ6ZQI3 291 aaKnown RBP15.05■□□□□ -0
Gm20508-201ENSMUST00000172480 Cux1P53564 1515 aa15.05■□□□□ -0
Gm20508-201ENSMUST00000172480 Atp10dQ8K2X1 1416 aa15.04■□□□□ -0
Gm20508-201ENSMUST00000172480 Arhgap31A6X8Z5 1425 aa15.03■□□□□ -0
Gm20508-201ENSMUST00000172480 Ccdc141E9Q8Q6 1531 aa14.99□□□□□ -0.01
Gm20508-201ENSMUST00000172480 Cyb5rlB1AS42 316 aa14.98□□□□□ -0.01
Gm20508-201ENSMUST00000172480 Rnf17Q99MV7 1640 aa14.98□□□□□ -0.01
Gm20508-201ENSMUST00000172480 Fyco1Q8VDC1 1437 aa14.95□□□□□ -0.02
Gm20508-201ENSMUST00000172480 Clip1Q922J3 1391 aa14.95□□□□□ -0.02
Gm20508-201ENSMUST00000172480 Kdm6bQ5NCY0 1641 aa14.95□□□□□ -0.02
Gm20508-201ENSMUST00000172480 Mroh2aD3Z750 1679 aa14.94□□□□□ -0.02
Gm20508-201ENSMUST00000172480 Brwd3A2AHJ4 1799 aa14.94□□□□□ -0.02
Gm20508-201ENSMUST00000172480 A2mQ6GQT1 1474 aa14.92□□□□□ -0.02
Gm20508-201ENSMUST00000172480 Gcc2Q8CHG3 1679 aa14.92□□□□□ -0.02
Gm20508-201ENSMUST00000172480 Gab3Q8BSM5 595 aa14.9□□□□□ -0.02
Gm20508-201ENSMUST00000172480 Abca8bQ8K440 1620 aa14.9□□□□□ -0.02
Gm20508-201ENSMUST00000172480 Ercc6l2Q9JIM3 1537 aa14.9□□□□□ -0.02
Gm20508-201ENSMUST00000172480 Fancd2Q80V62 1450 aa14.89□□□□□ -0.03
Gm20508-201ENSMUST00000172480 Kiaa1210E9Q0C6 1637 aa14.88□□□□□ -0.03
Gm20508-201ENSMUST00000172480 Naip2Q9QUK4 1447 aa14.88□□□□□ -0.03
Gm20508-201ENSMUST00000172480 Hecw2Q6I6G8 1578 aa14.85□□□□□ -0.03
Gm20508-201ENSMUST00000172480 BlmO88700 1416 aa14.85□□□□□ -0.03
Gm20508-201ENSMUST00000172480 Rapgef6Q5NCJ1 1609 aa14.84□□□□□ -0.03
Gm20508-201ENSMUST00000172480 Cep162Q6ZQ06 1403 aa14.83□□□□□ -0.03
Gm20508-201ENSMUST00000172480 Ncoa2Q61026 1462 aa14.83□□□□□ -0.03
Gm20508-201ENSMUST00000172480 Myt1lP97500 1187 aa14.81□□□□□ -0.04
Gm20508-201ENSMUST00000172480 Arap1Q4LDD4 1452 aa14.81□□□□□ -0.04
Gm20508-201ENSMUST00000172480 Mlh3A0A1Y7VMP7 1443 aa14.8□□□□□ -0.04
Gm20508-201ENSMUST00000172480 Magi1Q6RHR9 1471 aa14.79□□□□□ -0.04
Gm20508-201ENSMUST00000172480 Ankrd26Q811D2 1581 aa14.79□□□□□ -0.04
Gm20508-201ENSMUST00000172480 Aebp1Q640N1 1128 aa14.78□□□□□ -0.04
Gm20508-201ENSMUST00000172480 Qser1A2BIE1 1698 aa14.77□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 11.4 ms