RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000171737.2

Odc1-201, Transcript of Ornithine decarboxylase, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Odc1, Length 2,208 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odc1-201ENSMUST00000171737 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP38,08■■■■□ 3,69
Odc1-201ENSMUST00000171737 Eea1Q8BL66 1411 aa38,07■■■■□ 3,69
Odc1-201ENSMUST00000171737 Erich3F6QRE9 1637 aa38,07■■■■□ 3,68
Odc1-201ENSMUST00000171737 Gpatch8A2A6A1 1505 aa38,05■■■■□ 3,68
Odc1-201ENSMUST00000171737 Arap1Q4LDD4 1452 aa38,04■■■■□ 3,68
Odc1-201ENSMUST00000171737 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP38,02■■■■□ 3,68
Odc1-201ENSMUST00000171737 Setd5Q5XJV7 1441 aa38■■■■□ 3,67
Odc1-201ENSMUST00000171737 EprsQ8CGC7 1512 aaKnown RBP37,99■■■■□ 3,67
Odc1-201ENSMUST00000171737 Polr1aO35134 1717 aaKnown RBP37,98■■■■□ 3,67
Odc1-201ENSMUST00000171737 Rusc2Q80U22 1514 aa37,89■■■■□ 3,66
Odc1-201ENSMUST00000171737 Adamts12Q811B3 1600 aa37,88■■■■□ 3,65
Odc1-201ENSMUST00000171737 Lmo7E9PYF4 1699 aaKnown RBP37,87■■■■□ 3,65
Odc1-201ENSMUST00000171737 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa37,87■■■■□ 3,65
Odc1-201ENSMUST00000171737 WizO88286 1684 aaKnown RBP37,86■■■■□ 3,65
Odc1-201ENSMUST00000171737 Fyco1Q8VDC1 1437 aa37,85■■■■□ 3,65
Odc1-201ENSMUST00000171737 Pcf11G3X9Z4 1553 aa37,84■■■■□ 3,65
Odc1-201ENSMUST00000171737 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa37,82■■■■□ 3,65
Odc1-201ENSMUST00000171737 Rpap1Q80TE0 1409 aa37,78■■■■□ 3,64
Odc1-201ENSMUST00000171737 Abca16E9PWJ7 1678 aa37,78■■■■□ 3,64
Odc1-201ENSMUST00000171737 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa37,77■■■■□ 3,64
Odc1-201ENSMUST00000171737 CadpsQ80TJ1 1355 aa37,76■■■■□ 3,64
Odc1-201ENSMUST00000171737 Abca5Q8K448 1642 aa37,76■■■■□ 3,64
Odc1-201ENSMUST00000171737 PxdnQ3UQ28 1475 aa37,73■■■■□ 3,63
Odc1-201ENSMUST00000171737 TchhA0A0B4J1F9 1599 aa37,73■■■■□ 3,63
Odc1-201ENSMUST00000171737 Gm7298A0A0N4SVU1 1476 aa37,7■■■■□ 3,63
Odc1-201ENSMUST00000171737 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa37,67■■■■□ 3,62
Odc1-201ENSMUST00000171737 Tiam1Q60610 1591 aa37,65■■■■□ 3,62
Odc1-201ENSMUST00000171737 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP37,59■■■■□ 3,61
Odc1-201ENSMUST00000171737 Slx4Q6P1D7 1565 aa37,58■■■■□ 3,61
Odc1-201ENSMUST00000171737 Abcc2Q8VI47 1543 aa37,58■■■■□ 3,61
Odc1-201ENSMUST00000171737 Soga1E1U8D0 1418 aa37,57■■■■□ 3,61
Odc1-201ENSMUST00000171737 Naip1Q9QWK5 1403 aa37,56■■■■□ 3,6
Odc1-201ENSMUST00000171737 BlmO88700 1416 aa37,52■■■■□ 3,6
Odc1-201ENSMUST00000171737 Aebp1Q640N1 1128 aa37,49■■■■□ 3,59
Odc1-201ENSMUST00000171737 CntlnA2AM05 1397 aa37,46■■■■□ 3,59
Odc1-201ENSMUST00000171737 Peg3Q3URU2 1571 aa37,45■■■■□ 3,59
Odc1-201ENSMUST00000171737 UbtfP25976 765 aaKnown RBP37,43■■■■□ 3,58
Odc1-201ENSMUST00000171737 Arhgap27A2AB59 869 aa37,36■■■■□ 3,57
Odc1-201ENSMUST00000171737 Shroom2A2ALU4 1481 aa37,33■■■■□ 3,57
Odc1-201ENSMUST00000171737 Map3k4O08648 1597 aa37,32■■■■□ 3,57
Odc1-201ENSMUST00000171737 Dnmt1P13864 1620 aaKnown RBP37,32■■■■□ 3,57
Odc1-201ENSMUST00000171737 BC005561E9Q5E2 1589 aa37,29■■■■□ 3,56
Odc1-201ENSMUST00000171737 WrnO09053 1401 aa37,28■■■■□ 3,56
Odc1-201ENSMUST00000171737 Gm1043A0A140LJC2 1431 aa37,28■■■■□ 3,56
Odc1-201ENSMUST00000171737 Lmod2Q3UHZ5 550 aa37,2■■■■□ 3,54
Odc1-201ENSMUST00000171737 Kif27Q7M6Z4 1394 aa37,19■■■■□ 3,54
Odc1-201ENSMUST00000171737 Fgd6Q69ZL1 1399 aa37,18■■■■□ 3,54
Odc1-201ENSMUST00000171737 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP37,14■■■■□ 3,54
Odc1-201ENSMUST00000171737 Mier1Q5UAK0 511 aa37,14■■■■□ 3,54
Odc1-201ENSMUST00000171737 Neo1P97798 1493 aa37,12■■■■□ 3,53
Odc1-201ENSMUST00000171737 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa37,08■■■■□ 3,53
Odc1-201ENSMUST00000171737 Rapgef6Q5NCJ1 1609 aa37,07■■■■□ 3,53
Odc1-201ENSMUST00000171737 AknaQ80VW7 1404 aa37,07■■■■□ 3,53
Odc1-201ENSMUST00000171737 Ncapd3Q6ZQK0 1506 aa37,05■■■■□ 3,52
Odc1-201ENSMUST00000171737 Arhgef12Q8R4H2 1543 aaKnown RBP36,96■■■■□ 3,51
Odc1-201ENSMUST00000171737 Arhgap31A6X8Z5 1425 aa36,94■■■■□ 3,5
Odc1-201ENSMUST00000171737 Lmtk2Q3TYD6 1471 aa36,91■■■■□ 3,5
Odc1-201ENSMUST00000171737 Arhgef11Q68FM7 1552 aa36,91■■■■□ 3,5
Odc1-201ENSMUST00000171737 NexmifQ5DTT1 1515 aa36,9■■■■□ 3,5
Odc1-201ENSMUST00000171737 Chd1P40201 1711 aa36,88■■■■□ 3,49
Odc1-201ENSMUST00000171737 Ncoa3O09000 1398 aa36,87■■■■□ 3,49
Odc1-201ENSMUST00000171737 Abcc1O35379 1528 aa36,87■■■■□ 3,49
Odc1-201ENSMUST00000171737 Mroh2aD3Z750 1679 aa36,86■■■■□ 3,49
Odc1-201ENSMUST00000171737 3425401B19RikD3Z1D3 1412 aa36,86■■■■□ 3,49
Odc1-201ENSMUST00000171737 Rrbp1Q99PL5 1605 aaKnown RBP36,85■■■■□ 3,49
Odc1-201ENSMUST00000171737 Mug1P28665 1476 aa36,85■■■■□ 3,49
Odc1-201ENSMUST00000171737 Ccdc141E9Q8Q6 1531 aa36,85■■■■□ 3,49
Odc1-201ENSMUST00000171737 Jph4Q80WT0 628 aa36,83■■■■□ 3,49
Odc1-201ENSMUST00000171737 Gcc2Q8CHG3 1679 aa36,81■■■■□ 3,48
Odc1-201ENSMUST00000171737 Gm14025A2AP89 1413 aa36,79■■■■□ 3,48
Odc1-201ENSMUST00000171737 Cdc42bpaQ3UU96 1719 aa36,79■■■■□ 3,48
Odc1-201ENSMUST00000171737 Ccnb3Q810T2 1396 aa36,78■■■■□ 3,48
Odc1-201ENSMUST00000171737 Ncoa2Q61026 1462 aa36,76■■■■□ 3,48
Odc1-201ENSMUST00000171737 Kiaa1551Q5DTW7 1521 aa36,72■■■■□ 3,47
Odc1-201ENSMUST00000171737 Magi1Q6RHR9 1471 aa36,69■■■■□ 3,46
Odc1-201ENSMUST00000171737 Prex2Q3LAC4 1598 aa36,63■■■■□ 3,45
Odc1-201ENSMUST00000171737 Fkbp15Q6P9Q6 1216 aaKnown RBP36,61■■■■□ 3,45
Odc1-201ENSMUST00000171737 Kdm5bQ80Y84 1544 aa36,59■■■■□ 3,45
Odc1-201ENSMUST00000171737 Cul7Q8VE73 1689 aa36,59■■■■□ 3,45
Odc1-201ENSMUST00000171737 A2mQ6GQT1 1474 aa36,57■■■■□ 3,44
Odc1-201ENSMUST00000171737 Mapkbp1Q6NS57 1503 aa36,56■■■■□ 3,44
Odc1-201ENSMUST00000171737 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP36,54■■■■□ 3,44
Odc1-201ENSMUST00000171737 Dhx57Q6P5D3 1388 aaKnown RBP36,53■■■■□ 3,44
Odc1-201ENSMUST00000171737 Fam163aQ8CAA5 168 aa36,51■■■■□ 3,44
Odc1-201ENSMUST00000171737 Fancd2Q80V62 1450 aa36,51■■■■□ 3,44
Odc1-201ENSMUST00000171737 Arhgef40Q3UPH7 1517 aa36,48■■■■□ 3,43
Odc1-201ENSMUST00000171737 Adcy10Q8C0T9 1614 aa36,48■■■■□ 3,43
Odc1-201ENSMUST00000171737 Ythdc2B2RR83 1445 aaKnown RBP36,46■■■■□ 3,43
Odc1-201ENSMUST00000171737 NhsB1AV60 1647 aa36,45■■■■□ 3,43
Odc1-201ENSMUST00000171737 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP36,45■■■■□ 3,43
Odc1-201ENSMUST00000171737 Naip2Q9QUK4 1447 aa36,44■■■■□ 3,42
Odc1-201ENSMUST00000171737 Fam50aQ9WV03 339 aaKnown RBP36,43■■■■□ 3,42
Odc1-201ENSMUST00000171737 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa36,43■■■■□ 3,42
Odc1-201ENSMUST00000171737 Kdm6bQ5NCY0 1641 aa36,41■■■■□ 3,42
Odc1-201ENSMUST00000171737 PtprtQ99M80 1454 aa36,41■■■■□ 3,42
Odc1-201ENSMUST00000171737 NefmP08553 848 aa36,39■■■■□ 3,42
Odc1-201ENSMUST00000171737 Fam208aQ69ZR9 1610 aaKnown RBP36,39■■■■□ 3,42
Odc1-201ENSMUST00000171737 Kiaa1210E9Q0C6 1637 aa36,34■■■■□ 3,41
Odc1-201ENSMUST00000171737 Cep170Q6A065 1588 aa36,31■■■■□ 3,4
Odc1-201ENSMUST00000171737 Fhad1A6PWD2 1420 aa36,28■■■■□ 3,4
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 10,2 ms