RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000108868.10

Spg7-201, Transcript of Paraplegin, mousemouse

TSL 2 BASIC

Gene Spg7, Length 845 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spg7-201ENSMUST00000108868 Pla2r1Q62028 1487 aa42,77■■■■■ 4,44
Spg7-201ENSMUST00000108868 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa42,73■■■■■ 4,43
Spg7-201ENSMUST00000108868 CadpsQ80TJ1 1355 aa42,7■■■■■ 4,43
Spg7-201ENSMUST00000108868 Pprc1Q6NZN1 1644 aa42,7■■■■■ 4,43
Spg7-201ENSMUST00000108868 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa42,68■■■■■ 4,42
Spg7-201ENSMUST00000108868 Chd1P40201 1711 aa42,6■■■■■ 4,41
Spg7-201ENSMUST00000108868 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP42,6■■■■■ 4,41
Spg7-201ENSMUST00000108868 SynmQ70IV5 1561 aa42,6■■■■■ 4,41
Spg7-201ENSMUST00000108868 Shroom4Q1W617 1475 aa42,58■■■■■ 4,41
Spg7-201ENSMUST00000108868 Soga1E1U8D0 1418 aa42,55■■■■■ 4,4
Spg7-201ENSMUST00000108868 Arhgap27A2AB59 869 aa42,55■■■■■ 4,4
Spg7-201ENSMUST00000108868 Gpatch8A2A6A1 1505 aa42,54■■■■■ 4,4
Spg7-201ENSMUST00000108868 Zeb1Q64318 1117 aa42,49■■■■■ 4,39
Spg7-201ENSMUST00000108868 Dnmt1P13864 1620 aaKnown RBP42,47■■■■■ 4,39
Spg7-201ENSMUST00000108868 Chic1Q8CBW7 227 aa42,45■■■■■ 4,39
Spg7-201ENSMUST00000108868 Neo1P97798 1493 aa42,44■■■■■ 4,38
Spg7-201ENSMUST00000108868 Ppp1r18Q8BQ30 594 aa42,41■■■■■ 4,38
Spg7-201ENSMUST00000108868 Setbp1Q9Z180 1582 aa42,39■■■■■ 4,38
Spg7-201ENSMUST00000108868 Abcc2Q8VI47 1543 aa42,39■■■■■ 4,38
Spg7-201ENSMUST00000108868 PxdnQ3UQ28 1475 aa42,31■■■■■ 4,36
Spg7-201ENSMUST00000108868 Gm14025A2AP89 1413 aa42,31■■■■■ 4,36
Spg7-201ENSMUST00000108868 Abca16E9PWJ7 1678 aa42,3■■■■■ 4,36
Spg7-201ENSMUST00000108868 BC005561E9Q5E2 1589 aa42,3■■■■■ 4,36
Spg7-201ENSMUST00000108868 WizO88286 1684 aaKnown RBP42,26■■■■■ 4,36
Spg7-201ENSMUST00000108868 Map3k4O08648 1597 aa42,26■■■■■ 4,36
Spg7-201ENSMUST00000108868 Ifnlr1Q8CGK5 535 aa42,24■■■■■ 4,35
Spg7-201ENSMUST00000108868 TchhA0A0B4J1F9 1599 aa42,23■■■■■ 4,35
Spg7-201ENSMUST00000108868 AI481877A2ALV5 1481 aa42,17■■■■■ 4,34
Spg7-201ENSMUST00000108868 Ak9G3UYQ4 1894 aa42,15■■■■■ 4,34
Spg7-201ENSMUST00000108868 EprsQ8CGC7 1512 aaKnown RBP42,15■■■■■ 4,34
Spg7-201ENSMUST00000108868 Adamts12Q811B3 1600 aa42,09■■■■■ 4,33
Spg7-201ENSMUST00000108868 Slx4Q6P1D7 1565 aa42■■■■■ 4,31
Spg7-201ENSMUST00000108868 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa41,99■■■■■ 4,31
Spg7-201ENSMUST00000108868 Jph4Q80WT0 628 aa41,99■■■■■ 4,31
Spg7-201ENSMUST00000108868 Arhgef12Q8R4H2 1543 aaKnown RBP41,99■■■■■ 4,31
Spg7-201ENSMUST00000108868 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP41,98■■■■■ 4,31
Spg7-201ENSMUST00000108868 Fkbp15Q6P9Q6 1216 aaKnown RBP41,94■■■■■ 4,3
Spg7-201ENSMUST00000108868 Npm2Q80W85 207 aa41,94■■■■■ 4,3
Spg7-201ENSMUST00000108868 Rpap1Q80TE0 1409 aa41,92■■■■■ 4,3
Spg7-201ENSMUST00000108868 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa41,91■■■■■ 4,3
Spg7-201ENSMUST00000108868 Arid3cA6PWV5 409 aa41,83■■■■■ 4,29
Spg7-201ENSMUST00000108868 Clasp1Q80TV8 1535 aaKnown RBP41,78■■■■■ 4,28
Spg7-201ENSMUST00000108868 Gm7298A0A0N4SVU1 1476 aa41,75■■■■■ 4,27
Spg7-201ENSMUST00000108868 Carmil1Q6EDY6 1374 aa41,71■■■■■ 4,27
Spg7-201ENSMUST00000108868 Ttc37F8VPK0 1563 aa41,69■■■■■ 4,26
Spg7-201ENSMUST00000108868 AdgbG3UZ78 1657 aa41,64■■■■■ 4,26
Spg7-201ENSMUST00000108868 Mapkbp1Q6NS57 1503 aa41,63■■■■■ 4,25
Spg7-201ENSMUST00000108868 Igf1rQ60751 1373 aa41,59■■■■■ 4,25
Spg7-201ENSMUST00000108868 Map3k1P53349 1493 aa41,59■■■■■ 4,25
Spg7-201ENSMUST00000108868 Depdc5P61460 1591 aa41,58■■■■■ 4,25
Spg7-201ENSMUST00000108868 WrnO09053 1401 aa41,57■■■■■ 4,25
Spg7-201ENSMUST00000108868 Lrrc9Q8CDN9 1456 aa41,55■■■■■ 4,24
Spg7-201ENSMUST00000108868 Plppr3Q7TPB0 716 aa41,54■■■■■ 4,24
Spg7-201ENSMUST00000108868 Abca5Q8K448 1642 aa41,52■■■■■ 4,24
Spg7-201ENSMUST00000108868 Znf608Q56A10 1511 aa41,52■■■■■ 4,24
Spg7-201ENSMUST00000108868 Kdm5bQ80Y84 1544 aa41,43■■■■■ 4,22
Spg7-201ENSMUST00000108868 Arhgap35Q91YM2 1499 aa41,42■■■■■ 4,22
Spg7-201ENSMUST00000108868 Zfyve16Q80U44 1528 aa41,42■■■■■ 4,22
Spg7-201ENSMUST00000108868 Arhgef11Q68FM7 1552 aa41,42■■■■■ 4,22
Spg7-201ENSMUST00000108868 Dnajc5gQ8C632 165 aa41,37■■■■■ 4,21
Spg7-201ENSMUST00000108868 Rrbp1Q99PL5 1605 aaKnown RBP41,36■■■■■ 4,21
Spg7-201ENSMUST00000108868 Alpk3Q924C5 1678 aa41,35■■■■■ 4,21
Spg7-201ENSMUST00000108868 Fndc1E9Q043 1732 aa41,34■■■■■ 4,21
Spg7-201ENSMUST00000108868 Polr1aO35134 1717 aaKnown RBP41,32■■■■■ 4,2
Spg7-201ENSMUST00000108868 Wdr7Q920I9 1489 aa41,31■■■■■ 4,2
Spg7-201ENSMUST00000108868 Gab3Q8BSM5 595 aa41,27■■■■■ 4,2
Spg7-201ENSMUST00000108868 Cux1P53564 1515 aa41,23■■■■■ 4,19
Spg7-201ENSMUST00000108868 Arhgap31A6X8Z5 1425 aa41,17■■■■■ 4,18
Spg7-201ENSMUST00000108868 Clip1Q922J3 1391 aa41,14■■■■■ 4,18
Spg7-201ENSMUST00000108868 NhsB1AV60 1647 aa41,11■■■■■ 4,17
Spg7-201ENSMUST00000108868 Atp10dQ8K2X1 1416 aa41,1■■■■■ 4,17
Spg7-201ENSMUST00000108868 Cul7Q8VE73 1689 aa41,07■■■■■ 4,17
Spg7-201ENSMUST00000108868 MlecQ6ZQI3 291 aaKnown RBP41,07■■■■■ 4,17
Spg7-201ENSMUST00000108868 Fyco1Q8VDC1 1437 aa41,01■■■■■ 4,15
Spg7-201ENSMUST00000108868 Ccdc141E9Q8Q6 1531 aa41■■■■■ 4,15
Spg7-201ENSMUST00000108868 AglF8VPN4 1532 aa40,99■■■■■ 4,15
Spg7-201ENSMUST00000108868 Myt1lP97500 1187 aa40,95■■■■■ 4,15
Spg7-201ENSMUST00000108868 Cep162Q6ZQ06 1403 aa40,86■■■■■ 4,13
Spg7-201ENSMUST00000108868 Mroh2aD3Z750 1679 aa40,82■■■■■ 4,12
Spg7-201ENSMUST00000108868 Cyb5rlB1AS42 316 aa40,78■■■■■ 4,12
Spg7-201ENSMUST00000108868 Gcc2Q8CHG3 1679 aa40,78■■■■■ 4,12
Spg7-201ENSMUST00000108868 Rnf17Q99MV7 1640 aa40,75■■■■■ 4,11
Spg7-201ENSMUST00000108868 A2mQ6GQT1 1474 aa40,73■■■■■ 4,11
Spg7-201ENSMUST00000108868 Fancd2Q80V62 1450 aa40,7■■■■■ 4,11
Spg7-201ENSMUST00000108868 Aebp1Q640N1 1128 aa40,68■■■■■ 4,1
Spg7-201ENSMUST00000108868 Abca8bQ8K440 1620 aa40,67■■■■■ 4,1
Spg7-201ENSMUST00000108868 Ncoa2Q61026 1462 aa40,64■■■■■ 4,1
Spg7-201ENSMUST00000108868 Kiaa1210E9Q0C6 1637 aa40,62■■■■■ 4,09
Spg7-201ENSMUST00000108868 Rapgef6Q5NCJ1 1609 aa40,62■■■■■ 4,09
Spg7-201ENSMUST00000108868 Kdm6bQ5NCY0 1641 aa40,62■■■■■ 4,09
Spg7-201ENSMUST00000108868 BlmO88700 1416 aa40,59■■■■■ 4,09
Spg7-201ENSMUST00000108868 Kif27Q7M6Z4 1394 aa40,58■■■■■ 4,09
Spg7-201ENSMUST00000108868 Ankrd26Q811D2 1581 aa40,57■■■■■ 4,09
Spg7-201ENSMUST00000108868 Brwd3A2AHJ4 1799 aa40,56■■■■■ 4,08
Spg7-201ENSMUST00000108868 Naip2Q9QUK4 1447 aa40,52■■■■■ 4,08
Spg7-201ENSMUST00000108868 Magi1Q6RHR9 1471 aa40,51■■■■■ 4,08
Spg7-201ENSMUST00000108868 Arap1Q4LDD4 1452 aa40,48■■■■■ 4,07
Spg7-201ENSMUST00000108868 Mlh3A0A1Y7VMP7 1443 aa40,45■■■■■ 4,07
Spg7-201ENSMUST00000108868 Prex2Q3LAC4 1598 aa40,41■■■■■ 4,06
Spg7-201ENSMUST00000108868 Ercc6l2Q9JIM3 1537 aa40,36■■■■■ 4,05
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 10,5 ms