RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000097343.10

Nelfe-201, Transcript of Negative elongation factor E, mousemouse

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene Nelfe, Length 1,607 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Rusc2Q80U22 1514 aa37,63■■■■□ 3,61
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa37,59■■■■□ 3,61
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Polr1aO35134 1717 aaKnown RBP37,59■■■■□ 3,61
Nelfe-201ENSMUST00000097343 EprsQ8CGC7 1512 aaKnown RBP37,52■■■■□ 3,6
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Ankrd26Q811D2 1581 aa37,51■■■■□ 3,59
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Cux1P53564 1515 aa37,48■■■■□ 3,59
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Erich3F6QRE9 1637 aa37,47■■■■□ 3,59
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Adamts12Q811B3 1600 aa37,45■■■■□ 3,59
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Rpap1Q80TE0 1409 aa37,45■■■■□ 3,59
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Eea1Q8BL66 1411 aa37,44■■■■□ 3,58
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Fyco1Q8VDC1 1437 aa37,37■■■■□ 3,57
Nelfe-201ENSMUST00000097343 WizO88286 1684 aaKnown RBP37,35■■■■□ 3,57
Nelfe-201ENSMUST00000097343 TchhA0A0B4J1F9 1599 aa37,34■■■■□ 3,57
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Setd5Q5XJV7 1441 aa37,33■■■■□ 3,57
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Abca16E9PWJ7 1678 aa37,31■■■■□ 3,56
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Arap1Q4LDD4 1452 aa37,28■■■■□ 3,56
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Abca5Q8K448 1642 aa37,28■■■■□ 3,56
Nelfe-201ENSMUST00000097343 CadpsQ80TJ1 1355 aa37,27■■■■□ 3,56
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Lmo7E9PYF4 1699 aaKnown RBP37,25■■■■□ 3,55
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Gm7298A0A0N4SVU1 1476 aa37,23■■■■□ 3,55
Nelfe-201ENSMUST00000097343 PxdnQ3UQ28 1475 aa37,21■■■■□ 3,55
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa37,19■■■■□ 3,54
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Pcf11G3X9Z4 1553 aa37,16■■■■□ 3,54
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Soga1E1U8D0 1418 aa37,16■■■■□ 3,54
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Abcc2Q8VI47 1543 aa37,14■■■■□ 3,54
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP37,11■■■■□ 3,53
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Map3k4O08648 1597 aa37■■■■□ 3,51
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Tiam1Q60610 1591 aa36,99■■■■□ 3,51
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Dnmt1P13864 1620 aaKnown RBP36,96■■■■□ 3,51
Nelfe-201ENSMUST00000097343 BlmO88700 1416 aa36,95■■■■□ 3,51
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Fgd6Q69ZL1 1399 aa36,93■■■■□ 3,5
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Peg3Q3URU2 1571 aa36,92■■■■□ 3,5
Nelfe-201ENSMUST00000097343 CntlnA2AM05 1397 aa36,92■■■■□ 3,5
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Aebp1Q640N1 1128 aa36,91■■■■□ 3,5
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa36,9■■■■□ 3,5
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Shroom2A2ALU4 1481 aa36,9■■■■□ 3,5
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Arhgap27A2AB59 869 aa36,88■■■■□ 3,49
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Naip1Q9QWK5 1403 aa36,87■■■■□ 3,49
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Slx4Q6P1D7 1565 aa36,85■■■■□ 3,49
Nelfe-201ENSMUST00000097343 BC005561E9Q5E2 1589 aa36,83■■■■□ 3,49
Nelfe-201ENSMUST00000097343 WrnO09053 1401 aa36,79■■■■□ 3,48
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa36,75■■■■□ 3,47
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Neo1P97798 1493 aa36,69■■■■□ 3,46
Nelfe-201ENSMUST00000097343 AknaQ80VW7 1404 aa36,67■■■■□ 3,46
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Kif27Q7M6Z4 1394 aa36,66■■■■□ 3,46
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Gm1043A0A140LJC2 1431 aa36,65■■■■□ 3,46
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP36,62■■■■□ 3,45
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Rapgef6Q5NCJ1 1609 aa36,6■■■■□ 3,45
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Arhgef12Q8R4H2 1543 aaKnown RBP36,58■■■■□ 3,45
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Abcc1O35379 1528 aa36,57■■■■□ 3,45
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Rrbp1Q99PL5 1605 aaKnown RBP36,55■■■■□ 3,44
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Chd1P40201 1711 aa36,52■■■■□ 3,44
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Gm14025A2AP89 1413 aa36,48■■■■□ 3,43
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Jph4Q80WT0 628 aa36,47■■■■□ 3,43
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Arhgap31A6X8Z5 1425 aa36,46■■■■□ 3,43
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Ccdc141E9Q8Q6 1531 aa36,43■■■■□ 3,42
Nelfe-201ENSMUST00000097343 UbtfP25976 765 aaKnown RBP36,43■■■■□ 3,42
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Arhgef11Q68FM7 1552 aa36,41■■■■□ 3,42
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Ncoa2Q61026 1462 aa36,41■■■■□ 3,42
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Lmod2Q3UHZ5 550 aa36,4■■■■□ 3,42
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Lmtk2Q3TYD6 1471 aa36,35■■■■□ 3,41
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP36,34■■■■□ 3,41
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Mroh2aD3Z750 1679 aa36,33■■■■□ 3,41
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Mug1P28665 1476 aa36,33■■■■□ 3,41
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP36,29■■■■□ 3,4
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Ncoa3O09000 1398 aa36,29■■■■□ 3,4
Nelfe-201ENSMUST00000097343 NexmifQ5DTT1 1515 aa36,28■■■■□ 3,4
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Gcc2Q8CHG3 1679 aa36,25■■■■□ 3,39
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Magi1Q6RHR9 1471 aa36,24■■■■□ 3,39
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Kiaa1551Q5DTW7 1521 aa36,24■■■■□ 3,39
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Cdc42bpaQ3UU96 1719 aa36,24■■■■□ 3,39
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Kdm5bQ80Y84 1544 aa36,23■■■■□ 3,39
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP36,23■■■■□ 3,39
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Ncapd3Q6ZQK0 1506 aa36,21■■■■□ 3,39
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Dhx57Q6P5D3 1388 aaKnown RBP36,2■■■■□ 3,38
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa36,18■■■■□ 3,38
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Ythdc2B2RR83 1445 aaKnown RBP36,16■■■■□ 3,38
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Cul7Q8VE73 1689 aa36,14■■■■□ 3,38
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Ccnb3Q810T2 1396 aa36,14■■■■□ 3,38
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Fam163aQ8CAA5 168 aa36,13■■■■□ 3,37
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Mapkbp1Q6NS57 1503 aa36,13■■■■□ 3,37
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Fancd2Q80V62 1450 aa36,12■■■■□ 3,37
Nelfe-201ENSMUST00000097343 NhsB1AV60 1647 aa36,1■■■■□ 3,37
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Kiaa1210E9Q0C6 1637 aa36,09■■■■□ 3,37
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Cep170Q6A065 1588 aa36,09■■■■□ 3,37
Nelfe-201ENSMUST00000097343 3425401B19RikD3Z1D3 1412 aa36,08■■■■□ 3,37
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Prex2Q3LAC4 1598 aa36,08■■■■□ 3,37
Nelfe-201ENSMUST00000097343 PtprtQ99M80 1454 aa36,06■■■■□ 3,36
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Mier1Q5UAK0 511 aa36,05■■■■□ 3,36
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Fkbp15Q6P9Q6 1216 aaKnown RBP36,01■■■■□ 3,36
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Wdr7Q920I9 1489 aa35,99■■■■□ 3,35
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Fam208aQ69ZR9 1610 aaKnown RBP35,95■■■■□ 3,35
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Igf1rQ60751 1373 aa35,93■■■■□ 3,34
Nelfe-201ENSMUST00000097343 AI481877A2ALV5 1481 aa35,93■■■■□ 3,34
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Adcy10Q8C0T9 1614 aa35,9■■■■□ 3,34
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa35,87■■■■□ 3,33
Nelfe-201ENSMUST00000097343 A2mQ6GQT1 1474 aa35,86■■■■□ 3,33
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Abca8bQ8K440 1620 aa35,84■■■■□ 3,33
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Arhgef40Q3UPH7 1517 aa35,83■■■■□ 3,33
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Mlh3A0A1Y7VMP7 1443 aa35,82■■■■□ 3,33
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 11,4 ms