RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000065753.1

Trp53rkb-202, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Trp53rkb, Length 1,375 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 TchhA0A0B4J1F9 1599 aa42,47■■■■■ 4,39
Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 Abca16E9PWJ7 1678 aa42,46■■■■■ 4,39
Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa42,42■■■■■ 4,38
Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 Adamts12Q811B3 1600 aa42,42■■■■■ 4,38
Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 WizO88286 1684 aaKnown RBP42,41■■■■■ 4,38
Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 EprsQ8CGC7 1512 aaKnown RBP42,38■■■■■ 4,37
Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 AknaQ80VW7 1404 aa42,36■■■■■ 4,37
Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 Map3k1P53349 1493 aa42,36■■■■■ 4,37
Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 Dnmt1P13864 1620 aaKnown RBP42,33■■■■■ 4,37
Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 Arhgap35Q91YM2 1499 aa42,31■■■■■ 4,36
Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 Gab3Q8BSM5 595 aa42,31■■■■■ 4,36
Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 Abcc1O35379 1528 aa42,3■■■■■ 4,36
Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 Carmil1Q6EDY6 1374 aa42,3■■■■■ 4,36
Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 Abcc2Q8VI47 1543 aa42,28■■■■■ 4,36
Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 Cep170Q6A065 1588 aa42,26■■■■■ 4,36
Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 Map3k4O08648 1597 aa42,25■■■■■ 4,35
Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 PxdnQ3UQ28 1475 aa42,25■■■■■ 4,35
Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa42,25■■■■■ 4,35
Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 Chd1P40201 1711 aa42,25■■■■■ 4,35
Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP42,23■■■■■ 4,35
Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 CadpsQ80TJ1 1355 aa42,2■■■■■ 4,35
Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 Polr1aO35134 1717 aaKnown RBP42,18■■■■■ 4,34
Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 BC005561E9Q5E2 1589 aa42,17■■■■■ 4,34
Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 Adgrl3Q80TS3 1537 aa42,14■■■■■ 4,34
Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 Arhgap27A2AB59 869 aa42,11■■■■■ 4,33
Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 Neo1P97798 1493 aa42,1■■■■■ 4,33
Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 Cep162Q6ZQ06 1403 aa42,08■■■■■ 4,33
Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 Soga1E1U8D0 1418 aa42,01■■■■■ 4,32
Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 Gm7298A0A0N4SVU1 1476 aa42■■■■■ 4,31
Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 Abca5Q8K448 1642 aa41,98■■■■■ 4,31
Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 Rpap1Q80TE0 1409 aa41,97■■■■■ 4,31
Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 Slx4Q6P1D7 1565 aa41,97■■■■■ 4,31
Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 Ythdc2B2RR83 1445 aaKnown RBP41,96■■■■■ 4,31
Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 Clip1Q922J3 1391 aa41,95■■■■■ 4,31
Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 Gm14025A2AP89 1413 aa41,94■■■■■ 4,3
Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 Gm156Q58A37 223 aa41,88■■■■■ 4,3
Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 PtprtQ99M80 1454 aa41,86■■■■■ 4,29
Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa41,86■■■■■ 4,29
Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 Cux1P53564 1515 aa41,85■■■■■ 4,29
Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 Arhgef12Q8R4H2 1543 aaKnown RBP41,76■■■■■ 4,28
Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 Fyco1Q8VDC1 1437 aa41,75■■■■■ 4,27
Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 Myt1lP97500 1187 aa41,72■■■■■ 4,27
Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa41,65■■■■■ 4,26
Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 Rrbp1Q99PL5 1605 aaKnown RBP41,64■■■■■ 4,26
Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 WrnO09053 1401 aa41,62■■■■■ 4,25
Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 Pprc1Q6NZN1 1644 aa41,62■■■■■ 4,25
Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 Jph4Q80WT0 628 aa41,62■■■■■ 4,25
Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 AI481877A2ALV5 1481 aa41,6■■■■■ 4,25
Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 Setbp1Q9Z180 1582 aa41,58■■■■■ 4,25
Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 Ankrd26Q811D2 1581 aa41,56■■■■■ 4,24
Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 Ak9G3UYQ4 1894 aa41,5■■■■■ 4,23
Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 Erich3F6QRE9 1637 aa41,37■■■■■ 4,21
Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 Kdm5bQ80Y84 1544 aa41,36■■■■■ 4,21
Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 Ccdc141E9Q8Q6 1531 aa41,3■■■■■ 4,2
Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 Fkbp15Q6P9Q6 1216 aaKnown RBP41,27■■■■■ 4,2
Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 Arhgap31A6X8Z5 1425 aa41,27■■■■■ 4,2
Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 Igf1rQ60751 1373 aa41,23■■■■■ 4,19
Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 Lmo7E9PYF4 1699 aaKnown RBP41,23■■■■■ 4,19
Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 Cul7Q8VE73 1689 aa41,21■■■■■ 4,19
Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 Setd5Q5XJV7 1441 aa41,21■■■■■ 4,19
Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 Rapgef6Q5NCJ1 1609 aa41,18■■■■■ 4,18
Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 NhsB1AV60 1647 aa41,17■■■■■ 4,18
Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 Ifnlr1Q8CGK5 535 aa41,17■■■■■ 4,18
Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 Eea1Q8BL66 1411 aa41,16■■■■■ 4,18
Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 Lrrc9Q8CDN9 1456 aa41,15■■■■■ 4,18
Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 BlmO88700 1416 aa41,13■■■■■ 4,18
Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 Aebp1Q640N1 1128 aa41,13■■■■■ 4,18
Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 Pcdh10E9PXQ7 1057 aa41,12■■■■■ 4,17
Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 Pcf11G3X9Z4 1553 aa41,11■■■■■ 4,17
Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 Ppp1r18Q8BQ30 594 aa41,1■■■■■ 4,17
Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 Clasp1Q80TV8 1535 aaKnown RBP41,1■■■■■ 4,17
Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 Ncoa2Q61026 1462 aa41,1■■■■■ 4,17
Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 Mroh2aD3Z750 1679 aa41,09■■■■■ 4,17
Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 Wdr7Q920I9 1489 aa41,08■■■■■ 4,17
Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 Kif27Q7M6Z4 1394 aa41,07■■■■■ 4,17
Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 Gcc2Q8CHG3 1679 aa41,07■■■■■ 4,17
Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 Ttc37F8VPK0 1563 aa40,99■■■■■ 4,15
Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 Znf608Q56A10 1511 aa40,99■■■■■ 4,15
Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 Kiaa1210E9Q0C6 1637 aa40,98■■■■■ 4,15
Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 Arap1Q4LDD4 1452 aa40,94■■■■■ 4,14
Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 AdgbG3UZ78 1657 aa40,93■■■■■ 4,14
Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 Arid3cA6PWV5 409 aa40,91■■■■■ 4,14
Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 Fancd2Q80V62 1450 aa40,91■■■■■ 4,14
Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 Arhgef11Q68FM7 1552 aa40,9■■■■■ 4,14
Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 Atp10dQ8K2X1 1416 aa40,89■■■■■ 4,14
Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 Mapkbp1Q6NS57 1503 aa40,86■■■■■ 4,13
Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa40,86■■■■■ 4,13
Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 Magi1Q6RHR9 1471 aa40,85■■■■■ 4,13
Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 Abca8bQ8K440 1620 aa40,82■■■■■ 4,12
Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 Depdc5P61460 1591 aa40,79■■■■■ 4,12
Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 Zfyve16Q80U44 1528 aa40,75■■■■■ 4,11
Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 CntlnA2AM05 1397 aa40,73■■■■■ 4,11
Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 Prex2Q3LAC4 1598 aa40,72■■■■■ 4,11
Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 Peg3Q3URU2 1571 aa40,69■■■■■ 4,1
Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 Dhx57Q6P5D3 1388 aaKnown RBP40,65■■■■■ 4,1
Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 Mug1P28665 1476 aa40,65■■■■■ 4,1
Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 Cdc42bpaQ3UU96 1719 aa40,64■■■■■ 4,1
Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 AglF8VPN4 1532 aa40,63■■■■■ 4,09
Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 Ncoa3O09000 1398 aa40,63■■■■■ 4,09
Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 Fam163aQ8CAA5 168 aa40,58■■■■■ 4,09
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 6,7 ms