RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027592.5

Ubxn4-201, Transcript of UBX domain-containing protein 4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ubxn4, Length 4,113 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Ccdc18Q640L5 1455 aa18.95■□□□□ 0.62
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Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Ercc6F8VPZ5 1481 aa18.88■□□□□ 0.61
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Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Gm13697A2AK42 830 aa18.65■□□□□ 0.58
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Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Hdac5Q9Z2V6 1113 aa18.63■□□□□ 0.57
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Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Carmil1Q6EDY6 1374 aa18.43■□□□□ 0.54
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Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Gm13695A2AK44 830 aa18.41■□□□□ 0.54
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Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa18.35■□□□□ 0.53
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Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Rundc1Q0VDN7 615 aa18.35■□□□□ 0.53
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
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Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Ccnb3Q810T2 1396 aa18.31■□□□□ 0.52
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Apbb1Q9QXJ1 710 aa18.31■□□□□ 0.52
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Slc4a3P16283 1227 aa18.3■□□□□ 0.52
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Trim26Q99PN3 545 aa18.3■□□□□ 0.52
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa18.3■□□□□ 0.52
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Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Trim30dE9PWL0 497 aa18.22■□□□□ 0.51
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Ubxn4-201ENSMUST00000027592 AknaQ80VW7 1404 aa18.15■□□□□ 0.5
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Arap1Q4LDD4 1452 aa18.15■□□□□ 0.5
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Usp47Q8BY87 1376 aa18.15■□□□□ 0.5
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Plekhh2Q8C115 1491 aa18.14■□□□□ 0.49
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 UacaQ8CGB3 1411 aa18.13■□□□□ 0.49
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Cnga1P29974 684 aa18.13■□□□□ 0.49
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Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Dbr1Q923B1 550 aa18.13■□□□□ 0.49
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Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Zscan21Q07231 555 aa18.12■□□□□ 0.49
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 IqubQ8CDK3 788 aa18.12■□□□□ 0.49
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 B4galnt3Q6L8S8 986 aa18.11■□□□□ 0.49
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 PtprkP35822 1457 aa18.11■□□□□ 0.49
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Exosc9Q9JHI7 438 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Hsp90aa1P07901 733 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Hsp90ab1P11499 724 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Nup155Q99P88 1391 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Ncapd3Q6ZQK0 1506 aa18.09■□□□□ 0.49
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Efcab5A0JP43 1406 aa18.08■□□□□ 0.49
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 BicraF8VPZ9 1578 aa18.08■□□□□ 0.48
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 WrnO09053 1401 aa18.08■□□□□ 0.48
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Arid3cA6PWV5 409 aa18.07■□□□□ 0.48
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