RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000020501.14

Sumo3-201, Transcript of Small ubiquitin-related modifier 3, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sumo3, Length 2,630 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Cux1P53564 1515 aa22.73■■□□□ 1.23
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Ankrd26Q811D2 1581 aa22.7■■□□□ 1.22
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Setd5Q5XJV7 1441 aa22.69■■□□□ 1.22
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa22.68■■□□□ 1.22
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Eea1Q8BL66 1411 aa22.68■■□□□ 1.22
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
Sumo3-201ENSMUST00000020501 EprsQ8CGC7 1512 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Arap1Q4LDD4 1452 aa22.66■■□□□ 1.22
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Sumo3-201ENSMUST00000020501 Rusc2Q80U22 1514 aa22.59■■□□□ 1.21
Sumo3-201ENSMUST00000020501 WizO88286 1684 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Erich3F6QRE9 1637 aa22.58■■□□□ 1.2
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Supt5hO55201 1082 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa22.56■■□□□ 1.2
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Polr1aO35134 1717 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa22.56■■□□□ 1.2
Sumo3-201ENSMUST00000020501 CadpsQ80TJ1 1355 aa22.55■■□□□ 1.2
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Adamts12Q811B3 1600 aa22.54■■□□□ 1.2
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Fyco1Q8VDC1 1437 aa22.54■■□□□ 1.2
Sumo3-201ENSMUST00000020501 PxdnQ3UQ28 1475 aa22.54■■□□□ 1.2
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Gpatch8A2A6A1 1505 aa22.53■■□□□ 1.2
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa22.52■■□□□ 1.2
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Pcf11G3X9Z4 1553 aa22.51■■□□□ 1.19
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Gm7298A0A0N4SVU1 1476 aa22.5■■□□□ 1.19
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Abca16E9PWJ7 1678 aa22.5■■□□□ 1.19
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Rpap1Q80TE0 1409 aa22.5■■□□□ 1.19
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Lmo7E9PYF4 1699 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
Sumo3-201ENSMUST00000020501 TchhA0A0B4J1F9 1599 aa22.47■■□□□ 1.19
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Abca5Q8K448 1642 aa22.45■■□□□ 1.18
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Aebp1Q640N1 1128 aa22.43■■□□□ 1.18
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Abcc2Q8VI47 1543 aa22.42■■□□□ 1.18
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Arhgap27A2AB59 869 aa22.42■■□□□ 1.18
Sumo3-201ENSMUST00000020501 UbtfP25976 765 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Soga1E1U8D0 1418 aa22.39■■□□□ 1.17
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Tiam1Q60610 1591 aa22.38■■□□□ 1.17
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Naip1Q9QWK5 1403 aa22.38■■□□□ 1.17
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Slx4Q6P1D7 1565 aa22.37■■□□□ 1.17
Sumo3-201ENSMUST00000020501 BlmO88700 1416 aa22.34■■□□□ 1.17
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Lmod2Q3UHZ5 550 aa22.31■■□□□ 1.16
Sumo3-201ENSMUST00000020501 CntlnA2AM05 1397 aa22.3■■□□□ 1.16
Sumo3-201ENSMUST00000020501 WrnO09053 1401 aa22.3■■□□□ 1.16
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Shroom2A2ALU4 1481 aa22.27■■□□□ 1.16
Sumo3-201ENSMUST00000020501 BC005561E9Q5E2 1589 aa22.25■■□□□ 1.15
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Dnmt1P13864 1620 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Fgd6Q69ZL1 1399 aa22.23■■□□□ 1.15
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Map3k4O08648 1597 aa22.22■■□□□ 1.15
Sumo3-201ENSMUST00000020501 AknaQ80VW7 1404 aa22.22■■□□□ 1.15
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Gm1043A0A140LJC2 1431 aa22.21■■□□□ 1.15
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Kif27Q7M6Z4 1394 aa22.21■■□□□ 1.15
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Neo1P97798 1493 aa22.2■■□□□ 1.14
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Peg3Q3URU2 1571 aa22.19■■□□□ 1.14
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Mier1Q5UAK0 511 aa22.16■■□□□ 1.14
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Neurod1Q60867 357 aa22.15■■□□□ 1.14
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Rapgef6Q5NCJ1 1609 aa22.07■■□□□ 1.12
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Arhgap31A6X8Z5 1425 aa22.07■■□□□ 1.12
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Jph4Q80WT0 628 aa22.06■■□□□ 1.12
Sumo3-201ENSMUST00000020501 NefmP08553 848 aa22.05■■□□□ 1.12
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Fkbp15Q6P9Q6 1216 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Arhgef12Q8R4H2 1543 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Ncoa3O09000 1398 aa22.03■■□□□ 1.12
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Abcc1O35379 1528 aa22.03■■□□□ 1.12
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Ncapd3Q6ZQK0 1506 aa22.02■■□□□ 1.12
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
Sumo3-201ENSMUST00000020501 NexmifQ5DTT1 1515 aa21.99■■□□□ 1.11
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Chd1P40201 1711 aa21.99■■□□□ 1.11
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Gm14025A2AP89 1413 aa21.98■■□□□ 1.11
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Mug1P28665 1476 aa21.98■■□□□ 1.11
Sumo3-201ENSMUST00000020501 3425401B19RikD3Z1D3 1412 aa21.98■■□□□ 1.11
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Arhgef11Q68FM7 1552 aa21.98■■□□□ 1.11
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Mroh2aD3Z750 1679 aa21.97■■□□□ 1.11
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Ccdc141E9Q8Q6 1531 aa21.97■■□□□ 1.11
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Ccnb3Q810T2 1396 aa21.96■■□□□ 1.11
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Lmtk2Q3TYD6 1471 aa21.94■■□□□ 1.1
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Rrbp1Q99PL5 1605 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Ncoa2Q61026 1462 aa21.89■■□□□ 1.09
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Magi1Q6RHR9 1471 aa21.89■■□□□ 1.09
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Sall2Q9QX96 1004 aa21.89■■□□□ 1.09
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Cdc42bpaQ3UU96 1719 aa21.87■■□□□ 1.09
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Prex2Q3LAC4 1598 aa21.85■■□□□ 1.09
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Kiaa1551Q5DTW7 1521 aa21.85■■□□□ 1.09
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Ythdc2B2RR83 1445 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Gcc2Q8CHG3 1679 aa21.83■■□□□ 1.08
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Fam50aQ9WV03 339 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa21.8■■□□□ 1.08
Sumo3-201ENSMUST00000020501 PtprtQ99M80 1454 aa21.8■■□□□ 1.08
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Fam163aQ8CAA5 168 aa21.79■■□□□ 1.08
Sumo3-201ENSMUST00000020501 A2mQ6GQT1 1474 aa21.79■■□□□ 1.08
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Kdm5bQ80Y84 1544 aa21.78■■□□□ 1.08
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Cul7Q8VE73 1689 aa21.78■■□□□ 1.08
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Arhgef40Q3UPH7 1517 aa21.77■■□□□ 1.08
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Mapkbp1Q6NS57 1503 aa21.77■■□□□ 1.08
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Fancd2Q80V62 1450 aa21.77■■□□□ 1.07
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Ifnlr1Q8CGK5 535 aa21.76■■□□□ 1.07
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Dhx57Q6P5D3 1388 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Adcy10Q8C0T9 1614 aa21.72■■□□□ 1.07
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Kdm6bQ5NCY0 1641 aa21.72■■□□□ 1.07
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Chic2Q9D9G3 165 aa21.71■■□□□ 1.07
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