RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000020374.5

Cnot2-201, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 2, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Cnot2, Length 1,059 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot2-201ENSMUST00000020374 Dmrta2A2A9A2 531 aa17,5■□□□□ 0,39
Cnot2-201ENSMUST00000020374 Pde4dQ01063 747 aa17,49■□□□□ 0,39
Cnot2-201ENSMUST00000020374 Znf516Q7TSH3 1157 aa17,46■□□□□ 0,39
Cnot2-201ENSMUST00000020374 Zbtb7bQ64321 544 aa17,45■□□□□ 0,38
Cnot2-201ENSMUST00000020374 Dcbld2Q91ZV3 769 aa17,44■□□□□ 0,38
Cnot2-201ENSMUST00000020374 Gm45233A0A0N4SVE0 221 aa17,42■□□□□ 0,38
Cnot2-201ENSMUST00000020374 Repin1Q5U4E2 545 aa17,41■□□□□ 0,38
Cnot2-201ENSMUST00000020374 Atad2Q8CDM1 1040 aa17,39■□□□□ 0,37
Cnot2-201ENSMUST00000020374 Hdac5Q9Z2V6 1113 aa17,32■□□□□ 0,36
Cnot2-201ENSMUST00000020374 MycnP03966 462 aaKnown RBP17,29■□□□□ 0,36
Cnot2-201ENSMUST00000020374 Ndufv2Q9D6J6 248 aa17,29■□□□□ 0,36
Cnot2-201ENSMUST00000020374 Fam117bQ3U3E2 584 aa17,28■□□□□ 0,36
Cnot2-201ENSMUST00000020374 Pdap1Q3UHX2 181 aaKnown RBP17,23■□□□□ 0,35
Cnot2-201ENSMUST00000020374 Abcc8B2RUS7 1588 aa17,2■□□□□ 0,34
Cnot2-201ENSMUST00000020374 Gm13697A2AK42 830 aa17,13■□□□□ 0,33
Cnot2-201ENSMUST00000020374 ZxdbA2CE44 873 aa17,12■□□□□ 0,33
Cnot2-201ENSMUST00000020374 Kank4Q6P9J5 1016 aa17,12■□□□□ 0,33
Cnot2-201ENSMUST00000020374 ScribQ80U72 1612 aa17,11■□□□□ 0,33
Cnot2-201ENSMUST00000020374 Prim1P20664 417 aa17,09■□□□□ 0,33
Cnot2-201ENSMUST00000020374 St18Q80TY4 1045 aa17,05■□□□□ 0,32
Cnot2-201ENSMUST00000020374 Tulp1Q9Z273 543 aa17,04■□□□□ 0,32
Cnot2-201ENSMUST00000020374 Bclaf1Q8K019 919 aaKnown RBP17■□□□□ 0,31
Cnot2-201ENSMUST00000020374 Znf579Q80VM4 562 aa16,99■□□□□ 0,31
Cnot2-201ENSMUST00000020374 Arhgef1Q61210 920 aaKnown RBP16,92■□□□□ 0,3
Cnot2-201ENSMUST00000020374 Pak3Q61036 559 aa16,87■□□□□ 0,29
Cnot2-201ENSMUST00000020374 Fam181bQ80VF6 417 aa16,87■□□□□ 0,29
Cnot2-201ENSMUST00000020374 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP16,86■□□□□ 0,29
Cnot2-201ENSMUST00000020374 Jph4Q80WT0 628 aa16,83■□□□□ 0,28
Cnot2-201ENSMUST00000020374 Ube2uB1AUC4 352 aa16,77■□□□□ 0,28
Cnot2-201ENSMUST00000020374 Pcdhb17Q91VD8 799 aa16,77■□□□□ 0,28
Cnot2-201ENSMUST00000020374 Axin1O35625 863 aa16,76■□□□□ 0,27
Cnot2-201ENSMUST00000020374 Hmx1O70218 332 aa16,75■□□□□ 0,27
Cnot2-201ENSMUST00000020374 C1qbpO35658 278 aa16,73■□□□□ 0,27
Cnot2-201ENSMUST00000020374 Chrm1P12657 460 aa16,67■□□□□ 0,26
Cnot2-201ENSMUST00000020374 Lce6aD3YV94 81 aa16,64■□□□□ 0,25
Cnot2-201ENSMUST00000020374 Scarf1Q5ND28 820 aa16,63■□□□□ 0,25
Cnot2-201ENSMUST00000020374 EdaraddQ8VHX2 208 aa16,63■□□□□ 0,25
Cnot2-201ENSMUST00000020374 Spock2Q9ER58 423 aa16,63■□□□□ 0,25
Cnot2-201ENSMUST00000020374 Ppp6r1Q7TSI3 856 aa16,56■□□□□ 0,24
Cnot2-201ENSMUST00000020374 Dkk1O54908 272 aa16,53■□□□□ 0,24
Cnot2-201ENSMUST00000020374 E9Q0B3 247 aa16,52■□□□□ 0,24
Cnot2-201ENSMUST00000020374 Evi5P97366 809 aa16,51■□□□□ 0,23
Cnot2-201ENSMUST00000020374 Ferd3lQ923Z4 168 aa16,5■□□□□ 0,23
Cnot2-201ENSMUST00000020374 Irx5Q9JKQ4 484 aa16,45■□□□□ 0,22
Cnot2-201ENSMUST00000020374 Fndc3aQ8BX90 1198 aa16,44■□□□□ 0,22
Cnot2-201ENSMUST00000020374 Pcdh10E9PXQ7 1057 aa16,42■□□□□ 0,22
Cnot2-201ENSMUST00000020374 Scnn1bQ9WU38 638 aa16,42■□□□□ 0,22
Cnot2-201ENSMUST00000020374 Ecm2Q5FW85 670 aa16,41■□□□□ 0,22
Cnot2-201ENSMUST00000020374 Msh5Q9QUM7 833 aa16,4■□□□□ 0,22
Cnot2-201ENSMUST00000020374 TimelessQ9R1X4 1197 aa16,38■□□□□ 0,21
Cnot2-201ENSMUST00000020374 Actn4P57780 912 aaKnown RBP16,36■□□□□ 0,21
Cnot2-201ENSMUST00000020374 NacadQ5SWP3 1504 aa16,34■□□□□ 0,21
Cnot2-201ENSMUST00000020374 Adnp2Q8CHC8 1165 aaKnown RBP16,33■□□□□ 0,2
Cnot2-201ENSMUST00000020374 Kdm5dQ62240 1548 aa16,33■□□□□ 0,2
Cnot2-201ENSMUST00000020374 Gm11563B1AQ90 168 aa16,31■□□□□ 0,2
Cnot2-201ENSMUST00000020374 Ier5lQ99J55 406 aa16,31■□□□□ 0,2
Cnot2-201ENSMUST00000020374 Krtap4-7Q9D732 168 aa16,31■□□□□ 0,2
Cnot2-201ENSMUST00000020374 Fkbp4P30416 458 aa16,3■□□□□ 0,2
Cnot2-201ENSMUST00000020374 ElnP54320 860 aa16,3■□□□□ 0,2
Cnot2-201ENSMUST00000020374 PsdQ5DTT2 1024 aa16,28■□□□□ 0,2
Cnot2-201ENSMUST00000020374 Gm11555B1AQ89 175 aa16,24■□□□□ 0,19
Cnot2-201ENSMUST00000020374 Thap8E9Q695 213 aa16,22■□□□□ 0,19
Cnot2-201ENSMUST00000020374 Gga1Q8R0H9 635 aa16,22■□□□□ 0,19
Cnot2-201ENSMUST00000020374 Stk3Q9JI10 497 aa16,21■□□□□ 0,19
Cnot2-201ENSMUST00000020374 Zbtb22Q9Z0G7 638 aa16,2■□□□□ 0,18
Cnot2-201ENSMUST00000020374 RragcQ99K70 398 aa16,18■□□□□ 0,18
Cnot2-201ENSMUST00000020374 Pdzrn4E9PUZ9 1014 aa16,17■□□□□ 0,18
Cnot2-201ENSMUST00000020374 Ankrd65F6YK91 380 aa16,14■□□□□ 0,17
Cnot2-201ENSMUST00000020374 Apba1B2RUJ5 842 aa16,11■□□□□ 0,17
Cnot2-201ENSMUST00000020374 Nap1l5Q9JJF0 156 aa16,11■□□□□ 0,17
Cnot2-201ENSMUST00000020374 Sycp2Q9CUU3 1500 aa16,1■□□□□ 0,17
Cnot2-201ENSMUST00000020374 Sall2Q9QX96 1004 aa16,09■□□□□ 0,17
Cnot2-201ENSMUST00000020374 BicraF8VPZ9 1578 aa16,09■□□□□ 0,17
Cnot2-201ENSMUST00000020374 Smpd1Q04519 627 aa16,08■□□□□ 0,16
Cnot2-201ENSMUST00000020374 Otop3Q80UF9 577 aa16,05■□□□□ 0,16
Cnot2-201ENSMUST00000020374 Dnm1lQ8K1M6 742 aa16,02■□□□□ 0,16
Cnot2-201ENSMUST00000020374 Tox2A2A472 547 aa16,01■□□□□ 0,15
Cnot2-201ENSMUST00000020374 Rnf166Q3U9F6 237 aa15,98■□□□□ 0,15
Cnot2-201ENSMUST00000020374 Dnajc5P60904 198 aa15,97■□□□□ 0,15
Cnot2-201ENSMUST00000020374 Slc4a2P13808 1237 aaKnown RBP15,94■□□□□ 0,14
Cnot2-201ENSMUST00000020374 Hoxa2P31245 372 aa15,91■□□□□ 0,14
Cnot2-201ENSMUST00000020374 Myt1lP97500 1187 aa15,91■□□□□ 0,14
Cnot2-201ENSMUST00000020374 Rgl2Q61193 778 aa15,91■□□□□ 0,14
Cnot2-201ENSMUST00000020374 Mnx1Q9QZW9 404 aa15,91■□□□□ 0,14
Cnot2-201ENSMUST00000020374 Stk24Q99KH8 431 aa15,9■□□□□ 0,14
Cnot2-201ENSMUST00000020374 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP15,9■□□□□ 0,14
Cnot2-201ENSMUST00000020374 Setdb2Q8C267 713 aa15,87■□□□□ 0,13
Cnot2-201ENSMUST00000020374 Sptlc1O35704 473 aa15,85■□□□□ 0,13
Cnot2-201ENSMUST00000020374 Mier1Q5UAK0 511 aa15,85■□□□□ 0,13
Cnot2-201ENSMUST00000020374 Neurod1Q60867 357 aa15,83■□□□□ 0,12
Cnot2-201ENSMUST00000020374 Fmr1nbQ80ZA7 238 aa15,81■□□□□ 0,12
Cnot2-201ENSMUST00000020374 Stk25Q9Z2W1 426 aa15,8■□□□□ 0,12
Cnot2-201ENSMUST00000020374 Kdm2aP59997 1161 aa15,73■□□□□ 0,11
Cnot2-201ENSMUST00000020374 Lhx6Q9R1R0 363 aa15,73■□□□□ 0,11
Cnot2-201ENSMUST00000020374 Rsph6aQ8CDR2 708 aa15,72■□□□□ 0,11
Cnot2-201ENSMUST00000020374 Gm11939A2A592 99 aa15,7■□□□□ 0,1
Cnot2-201ENSMUST00000020374 Ano8Q6PB70 1060 aa15,7■□□□□ 0,1
Cnot2-201ENSMUST00000020374 UncxO08934 530 aa15,68■□□□□ 0,1
Cnot2-201ENSMUST00000020374 Cypt1Q8CH20 168 aa15,68■□□□□ 0,1
Cnot2-201ENSMUST00000020374 Lrrc14bQ3UJB3 510 aa15,67■□□□□ 0,1
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 45,4 ms