RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641601.1

SAMMSON-218, survival associated mitochondrial melanoma specific oncogenic non-coding RNA, humanhuman

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Gene SAMMSON, Length 1,847 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMMSON-218ENST00000641601 TGFAP01135 160 aa7.4□□□□□ -1.23
SAMMSON-218ENST00000641601 DEFB131AP59861 70 aa7.4□□□□□ -1.23
SAMMSON-218ENST00000641601 DNAJC30Q96LL9 226 aa7.4□□□□□ -1.23
SAMMSON-218ENST00000641601 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa7.4□□□□□ -1.23
SAMMSON-218ENST00000641601 LRRK2Q5S007 2527 aa7.39□□□□□ -1.23
SAMMSON-218ENST00000641601 HECTD1Q9ULT8 2610 aa7.39□□□□□ -1.23
SAMMSON-218ENST00000641601 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa7.39□□□□□ -1.23
SAMMSON-218ENST00000641601 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa7.39□□□□□ -1.23
SAMMSON-218ENST00000641601 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
SAMMSON-218ENST00000641601 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
SAMMSON-218ENST00000641601 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
SAMMSON-218ENST00000641601 Q8N2B8 174 aa7.39□□□□□ -1.23
SAMMSON-218ENST00000641601 DUX3Q96PT4 197 aa7.39□□□□□ -1.23
SAMMSON-218ENST00000641601 LITAFQ99732 161 aa7.39□□□□□ -1.23
SAMMSON-218ENST00000641601 SPANXDQ9BXN6 97 aa7.39□□□□□ -1.23
SAMMSON-218ENST00000641601 SPANXCQ9NY87 97 aa7.39□□□□□ -1.23
SAMMSON-218ENST00000641601 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP7.39□□□□□ -1.23
SAMMSON-218ENST00000641601 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa7.39□□□□□ -1.23
SAMMSON-218ENST00000641601 ZFHX3Q15911 3703 aa7.39□□□□□ -1.23
SAMMSON-218ENST00000641601 SLC25A20O43772 301 aa7.38□□□□□ -1.23
SAMMSON-218ENST00000641601 PROK1P58294 105 aa7.38□□□□□ -1.23
SAMMSON-218ENST00000641601 ANKRD29Q8N6D5 301 aa7.38□□□□□ -1.23
SAMMSON-218ENST00000641601 RNF183Q96D59 192 aa7.38□□□□□ -1.23
SAMMSON-218ENST00000641601 RAX2Q96IS3 184 aa7.38□□□□□ -1.23
SAMMSON-218ENST00000641601 SPXQ9BT56 116 aa7.38□□□□□ -1.23
SAMMSON-218ENST00000641601 CHCHD7Q9BUK0 85 aa7.38□□□□□ -1.23
SAMMSON-218ENST00000641601 PEMTQ9UBM1 199 aa7.38□□□□□ -1.23
SAMMSON-218ENST00000641601 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa7.38□□□□□ -1.23
SAMMSON-218ENST00000641601 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa7.38□□□□□ -1.23
SAMMSON-218ENST00000641601 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa7.38□□□□□ -1.23
SAMMSON-218ENST00000641601 IGHV3-53P01767 116 aa7.38□□□□□ -1.23
SAMMSON-218ENST00000641601 SLURP1P55000 103 aa7.38□□□□□ -1.23
SAMMSON-218ENST00000641601 FHL3Q13643 280 aa7.38□□□□□ -1.23
SAMMSON-218ENST00000641601 BEAN1Q3B7T3 259 aa7.38□□□□□ -1.23
SAMMSON-218ENST00000641601 NRGNQ92686 78 aa7.38□□□□□ -1.23
SAMMSON-218ENST00000641601 VSIG2Q96IQ7 327 aa7.38□□□□□ -1.23
SAMMSON-218ENST00000641601 TMEM262E9PQX1 116 aa7.37□□□□□ -1.23
SAMMSON-218ENST00000641601 ATXN8Q156A1 80 aa7.37□□□□□ -1.23
SAMMSON-218ENST00000641601 Q6ZUT4 128 aa7.37□□□□□ -1.23
SAMMSON-218ENST00000641601 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
SAMMSON-218ENST00000641601 CELSR2Q9HCU4 2923 aa7.37□□□□□ -1.23
SAMMSON-218ENST00000641601 C9JAW5 83 aa7.36□□□□□ -1.23
SAMMSON-218ENST00000641601 TIMM17BO60830 172 aa7.36□□□□□ -1.23
SAMMSON-218ENST00000641601 SPINK8P0C7L1 97 aa7.36□□□□□ -1.23
SAMMSON-218ENST00000641601 HTN1P15515 57 aa7.36□□□□□ -1.23
SAMMSON-218ENST00000641601 MIAQ16674 131 aa7.36□□□□□ -1.23
SAMMSON-218ENST00000641601 Q6ZSN1 163 aa7.36□□□□□ -1.23
SAMMSON-218ENST00000641601 C11orf72Q8NBR9 251 aa7.36□□□□□ -1.23
SAMMSON-218ENST00000641601 CLUHP3Q96NS8 147 aa7.36□□□□□ -1.23
SAMMSON-218ENST00000641601 MAP6D1Q9H9H5 199 aa7.36□□□□□ -1.23
SAMMSON-218ENST00000641601 NDUFA12Q9UI09 145 aa7.36□□□□□ -1.23
SAMMSON-218ENST00000641601 NACAE9PAV3 2078 aa7.36□□□□□ -1.23
SAMMSON-218ENST00000641601 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa7.36□□□□□ -1.23
SAMMSON-218ENST00000641601 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa7.36□□□□□ -1.23
SAMMSON-218ENST00000641601 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa7.36□□□□□ -1.23
SAMMSON-218ENST00000641601 RS1O15537 224 aa7.36□□□□□ -1.23
SAMMSON-218ENST00000641601 IGHV4-31P0DP07 118 aa7.36□□□□□ -1.23
SAMMSON-218ENST00000641601 Q1RN00 199 aa7.36□□□□□ -1.23
SAMMSON-218ENST00000641601 LINC01620Q4KN68 170 aa7.36□□□□□ -1.23
SAMMSON-218ENST00000641601 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
SAMMSON-218ENST00000641601 TMEM61Q8N0U2 210 aa7.36□□□□□ -1.23
SAMMSON-218ENST00000641601 C4orf3Q8WVX3 66 aa7.36□□□□□ -1.23
SAMMSON-218ENST00000641601 YAE1D1Q9NRH1 226 aa7.36□□□□□ -1.23
SAMMSON-218ENST00000641601 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa7.35□□□□□ -1.23
SAMMSON-218ENST00000641601 INSP01308 110 aa7.35□□□□□ -1.23
SAMMSON-218ENST00000641601 XGP55808 180 aa7.35□□□□□ -1.23
SAMMSON-218ENST00000641601 TIRAPP58753 221 aa7.35□□□□□ -1.23
SAMMSON-218ENST00000641601 ZFAND6Q6FIF0 208 aa7.35□□□□□ -1.23
SAMMSON-218ENST00000641601 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
SAMMSON-218ENST00000641601 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa7.34□□□□□ -1.23
SAMMSON-218ENST00000641601 H7C2G1 150 aa7.34□□□□□ -1.23
SAMMSON-218ENST00000641601 MT-ATP8P03928 68 aa7.34□□□□□ -1.23
SAMMSON-218ENST00000641601 IFITM1P13164 125 aa7.34□□□□□ -1.23
SAMMSON-218ENST00000641601 KRTAP10-9P60411 292 aa7.34□□□□□ -1.23
SAMMSON-218ENST00000641601 CKS1BP61024 79 aa7.34□□□□□ -1.23
SAMMSON-218ENST00000641601 DEFB136Q30KP8 78 aa7.34□□□□□ -1.23
SAMMSON-218ENST00000641601 C18orf65Q6ZTR6 163 aa7.34□□□□□ -1.23
SAMMSON-218ENST00000641601 LINC01587Q99440 93 aa7.34□□□□□ -1.23
SAMMSON-218ENST00000641601 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
SAMMSON-218ENST00000641601 CSMD2Q7Z408 3487 aa7.34□□□□□ -1.24
SAMMSON-218ENST00000641601 TRIAP1O43715 76 aa7.34□□□□□ -1.24
SAMMSON-218ENST00000641601 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa7.34□□□□□ -1.24
SAMMSON-218ENST00000641601 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa7.34□□□□□ -1.24
SAMMSON-218ENST00000641601 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.24
SAMMSON-218ENST00000641601 Q9UF83 564 aa7.34□□□□□ -1.24
SAMMSON-218ENST00000641601 VPS13CQ709C8 3753 aa7.33□□□□□ -1.24
SAMMSON-218ENST00000641601 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
SAMMSON-218ENST00000641601 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa7.33□□□□□ -1.24
SAMMSON-218ENST00000641601 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
SAMMSON-218ENST00000641601 NDUFA1O15239 70 aa7.33□□□□□ -1.24
SAMMSON-218ENST00000641601 PRM2P04554 102 aa7.33□□□□□ -1.24
SAMMSON-218ENST00000641601 PRSS2P07478 247 aa7.33□□□□□ -1.24
SAMMSON-218ENST00000641601 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
SAMMSON-218ENST00000641601 DEFB114Q30KQ6 69 aa7.33□□□□□ -1.24
SAMMSON-218ENST00000641601 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
SAMMSON-218ENST00000641601 DYNLRB2Q8TF09 96 aa7.33□□□□□ -1.24
SAMMSON-218ENST00000641601 ICOSQ9Y6W8 199 aa7.33□□□□□ -1.24
SAMMSON-218ENST00000641601 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
SAMMSON-218ENST00000641601 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa7.32□□□□□ -1.24
SAMMSON-218ENST00000641601 PTPN13Q12923 2485 aa7.32□□□□□ -1.24
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