RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635853.1

SPTAN1-228, Transcript of spectrin alpha, non-erythrocytic 1, humanhuman

TSL 5

Gene SPTAN1, Length 5,870 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1-228ENST00000635853 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa7.44□□□□□ -1.22
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SPTAN1-228ENST00000635853 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa7.44□□□□□ -1.22
SPTAN1-228ENST00000635853 MAP6D1Q9H9H5 199 aa7.44□□□□□ -1.22
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SPTAN1-228ENST00000635853 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa7.41□□□□□ -1.22
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SPTAN1-228ENST00000635853 ENHOQ6UWT2 76 aa7.4□□□□□ -1.22
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SPTAN1-228ENST00000635853 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
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SPTAN1-228ENST00000635853 CEP290O15078 2479 aa7.36□□□□□ -1.23
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SPTAN1-228ENST00000635853 LINC00574Q9H8X3 128 aa7.35□□□□□ -1.23
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SPTAN1-228ENST00000635853 SHANK1Q9Y566 2161 aa7.35□□□□□ -1.23
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SPTAN1-228ENST00000635853 SCXQ7RTU7 201 aa7.34□□□□□ -1.24
SPTAN1-228ENST00000635853 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa7.33□□□□□ -1.24
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SPTAN1-228ENST00000635853 TET1Q8NFU7 2136 aa7.33□□□□□ -1.24
SPTAN1-228ENST00000635853 SYCNQ0VAF6 134 aa7.33□□□□□ -1.24
SPTAN1-228ENST00000635853 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTAN1-228ENST00000635853 LY6LH3BQJ8 138 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTAN1-228ENST00000635853 PLAC8L1A1L4L8 177 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTAN1-228ENST00000635853 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTAN1-228ENST00000635853 FHL3Q13643 280 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTAN1-228ENST00000635853 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTAN1-228ENST00000635853 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa7.31□□□□□ -1.24
SPTAN1-228ENST00000635853 IGKV2D-28P01615 120 aa7.31□□□□□ -1.24
SPTAN1-228ENST00000635853 C19orf84I3L1E1 186 aa7.31□□□□□ -1.24
SPTAN1-228ENST00000635853 DCANP1Q8TF63 244 aa7.31□□□□□ -1.24
SPTAN1-228ENST00000635853 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa7.31□□□□□ -1.24
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