RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000625668.2

LINC02028-223, Transcript of long intergenic non-protein coding RNA 2028, human

TSL 5

Gene LINC02028, Length 646 nt, Biotype lincRNA.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINC02028-223	ENST00000625668	MUC4	Q99102	2169 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINC02028-223	ENST00000625668	TRBV7-3	A0A075B6L6	115 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINC02028-223	ENST00000625668	TRAV8-6	A0A0B4J262	113 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINC02028-223	ENST00000625668	TRAV26-2	A0A0B4J265	109 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINC02028-223	ENST00000625668	IGHV3-38	A0A0C4DH36	116 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINC02028-223	ENST00000625668		A0A1B0GUT8	65 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINC02028-223	ENST00000625668	FAM231B	A6NCW3	169 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINC02028-223	ENST00000625668	DNAH10OS	P0CZ25	163 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINC02028-223	ENST00000625668	ADCYAP1	P18509	176 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINC02028-223	ENST00000625668	UQCC3	Q6UW78	93 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINC02028-223	ENST00000625668	COMMD7	Q86VX2	200 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINC02028-223	ENST00000625668	NUP35	Q8NFH5	326 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINC02028-223	ENST00000625668	NAT8B	Q9UHF3	227 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINC02028-223	ENST00000625668		A0A087WWC5	75 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINC02028-223	ENST00000625668	SMIM27	A0A1W2PRY6	76 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINC02028-223	ENST00000625668		H7C1H1	209 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINC02028-223	ENST00000625668	IGHV3-30	P01768	117 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINC02028-223	ENST00000625668	IGHV3-33	P01772	117 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINC02028-223	ENST00000625668	IGHV3-30-3	P0DP02	117 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINC02028-223	ENST00000625668	IGHV3-30-5	P0DP03	117 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINC02028-223	ENST00000625668	PNRC1	Q12796	327 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
LINC02028-223	ENST00000625668	LINC01556	Q5JQF7	62 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINC02028-223	ENST00000625668	RASL11A	Q6T310	242 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINC02028-223	ENST00000625668	LINC00336	Q6ZUF6	198 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINC02028-223	ENST00000625668	SMIM15	Q7Z3B0	74 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINC02028-223	ENST00000625668	DNAH2	Q9P225	4427 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINC02028-223	ENST00000625668	TRAV9-2	A0A087WT02	112 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINC02028-223	ENST00000625668	IGLV5-39	A0A0G2JS06	123 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINC02028-223	ENST00000625668	TMEM218	A2RU14	115 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINC02028-223	ENST00000625668	RIG	Q13278	110 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINC02028-223	ENST00000625668	GATD1	Q8NB37	220 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINC02028-223	ENST00000625668	DNAJC30	Q96LL9	226 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINC02028-223	ENST00000625668	TMEM191A	Q9H0A3	160 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINC02028-223	ENST00000625668	NIT2	Q9NQR4	276 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINC02028-223	ENST00000625668	PKHD1	P08F94	4074 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LINC02028-223	ENST00000625668	TRBV6-8	A0A0A6YYG3	113 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LINC02028-223	ENST00000625668		A0A1B0GVY2	172 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LINC02028-223	ENST00000625668	LINC00862	A6NCI5	91 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LINC02028-223	ENST00000625668		F8W036	122 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LINC02028-223	ENST00000625668		K7EP13	123 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LINC02028-223	ENST00000625668	PPP1R2P9	O14990	202 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LINC02028-223	ENST00000625668	GAS8-AS1	O95177	125 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LINC02028-223	ENST00000625668	CAMP	P49913	170 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LINC02028-223	ENST00000625668		Q6ZRN7	208 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
LINC02028-223	ENST00000625668	NTM-AS1	Q6ZSK4	140 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LINC02028-223	ENST00000625668	DAZ4	Q86SG3	579 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
LINC02028-223	ENST00000625668	NIT1	Q86X76	327 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LINC02028-223	ENST00000625668	AMN1	Q8IY45	258 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LINC02028-223	ENST00000625668	C10orf126	Q8N4M7	172 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LINC02028-223	ENST00000625668	SREK1IP1	Q8N9Q2	155 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
LINC02028-223	ENST00000625668	DEFB104A	Q8WTQ1	72 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LINC02028-223	ENST00000625668	RPL39L	Q96EH5	51 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
LINC02028-223	ENST00000625668	RNF185	Q96GF1	192 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LINC02028-223	ENST00000625668	DAZ3	Q9NR90	486 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
LINC02028-223	ENST00000625668	DYNC1H1	Q14204	4646 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
LINC02028-223	ENST00000625668		A0A1B0GXF2	115 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINC02028-223	ENST00000625668	IBA57-AS1	B1ANH7	110 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINC02028-223	ENST00000625668	SMKR1	H3BMG3	65 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINC02028-223	ENST00000625668	NCR2	O95944	276 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINC02028-223	ENST00000625668	MT-ND4L	P03901	98 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINC02028-223	ENST00000625668	BTF3	P20290	206 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
LINC02028-223	ENST00000625668	RAB4A	P20338	218 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINC02028-223	ENST00000625668	HBB	P68871	147 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINC02028-223	ENST00000625668	MRPL54	Q6P161	138 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
LINC02028-223	ENST00000625668	FRZB	Q92765	325 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINC02028-223	ENST00000625668	CHCHD5	Q9BSY4	110 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINC02028-223	ENST00000625668	SEC11C	Q9BY50	192 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINC02028-223	ENST00000625668		Q9HAA7	133 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINC02028-223	ENST00000625668	URGCP-MRPS24	S4R325	110 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINC02028-223	ENST00000625668	DNAH6	Q9C0G6	4158 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINC02028-223	ENST00000625668	DNAH11	Q96DT5	4516 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINC02028-223	ENST00000625668		A0A087WX48	190 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINC02028-223	ENST00000625668	IGHV1-24	A0A0C4DH33	117 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINC02028-223	ENST00000625668		A0A1B0GW15	77 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINC02028-223	ENST00000625668	SDHAF1	A6NFY7	115 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINC02028-223	ENST00000625668	RPS10	P46783	165 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LINC02028-223	ENST00000625668	GAGE6	Q13070	117 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINC02028-223	ENST00000625668	IQCJ	Q1A5X6	159 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINC02028-223	ENST00000625668	MPV17L2	Q567V2	206 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINC02028-223	ENST00000625668	TMEM97	Q5BJF2	176 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINC02028-223	ENST00000625668	NFE4	Q86UQ8	179 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINC02028-223	ENST00000625668	MRAP2	Q96G30	205 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINC02028-223	ENST00000625668	FAT2	Q9NYQ8	4349 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINC02028-223	ENST00000625668	NACA	E9PAV3	2078 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINC02028-223	ENST00000625668	TRBV25-1	A0A075B6N4	114 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINC02028-223	ENST00000625668	TRBV6-5	A0A0K0K1A5	114 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINC02028-223	ENST00000625668	TMEM262	E9PQX1	116 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINC02028-223	ENST00000625668	S100A8	P05109	93 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINC02028-223	ENST00000625668	AMT	P48728	403 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINC02028-223	ENST00000625668	COTL1	Q14019	142 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINC02028-223	ENST00000625668	LAGE3	Q14657	143 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINC02028-223	ENST00000625668	MRPL51	Q4U2R6	128 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
LINC02028-223	ENST00000625668	FAM104B	Q5XKR9	115 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINC02028-223	ENST00000625668	KCNIP4	Q6PIL6	250 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINC02028-223	ENST00000625668	ATP5L2	Q7Z4Y8	100 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINC02028-223	ENST00000625668		Q8N976	141 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINC02028-223	ENST00000625668	CHCHD7	Q9BUK0	85 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINC02028-223	ENST00000625668	ST20	Q9HBF5	79 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINC02028-223	ENST00000625668	KLK12	Q9UKR0	248 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINC02028-223	ENST00000625668	CARHSP1	Q9Y2V2	147 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.9 ms