RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623267.3

SNHG5-216, Transcript of small nucleolar RNA host gene 5, human

TSL 5

Gene SNHG5, Length 374 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG5-216	ENST00000623267	GAGE1	Q13065	139 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SNHG5-216	ENST00000623267	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	4.1	□□□□□ -1.75
SNHG5-216	ENST00000623267	BVES-AS1	Q5T3Y7	98 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SNHG5-216	ENST00000623267	AMMECR1L	Q6DCA0	310 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SNHG5-216	ENST00000623267	NEGR1	Q7Z3B1	354 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SNHG5-216	ENST00000623267	COPS9	Q8WXC6	57 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SNHG5-216	ENST00000623267	HIST1H4G	Q99525	98 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SNHG5-216	ENST00000623267	GEMIN7	Q9H840	131 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SNHG5-216	ENST00000623267	UNC79	Q9P2D8	2635 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SNHG5-216	ENST00000623267	SVEP1	Q4LDE5	3571 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SNHG5-216	ENST00000623267	HELZ2	Q9BYK8	2649 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SNHG5-216	ENST00000623267	TRBV25-1	A0A075B6N4	114 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNHG5-216	ENST00000623267		A0A1B0GV90	55 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNHG5-216	ENST00000623267	LEPROT	O15243	131 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNHG5-216	ENST00000623267	CCL25	O15444	150 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNHG5-216	ENST00000623267	GIG44	P09565	113 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SNHG5-216	ENST00000623267	SPART-AS1	P0CW21	52 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNHG5-216	ENST00000623267	FGF6	P10767	208 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNHG5-216	ENST00000623267	TIRAP	P58753	221 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNHG5-216	ENST00000623267	UBE2D3	P61077	147 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNHG5-216	ENST00000623267	UBE2D2	P62837	147 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNHG5-216	ENST00000623267	RPL39	P62891	51 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SNHG5-216	ENST00000623267	HERVK_113	P63121	156 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNHG5-216	ENST00000623267	CIRBP	Q14011	172 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SNHG5-216	ENST00000623267		Q6ZTI0	123 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNHG5-216	ENST00000623267	SLC25A29	Q8N8R3	303 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNHG5-216	ENST00000623267	OR5A1	Q8NGJ0	315 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNHG5-216	ENST00000623267	ZNF479	Q96JC4	524 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNHG5-216	ENST00000623267	AMELX	Q99217	191 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNHG5-216	ENST00000623267	TMEM243	Q9BU79	118 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNHG5-216	ENST00000623267	PRO0255	Q9UI72	69 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNHG5-216	ENST00000623267	MAP1A	P78559	2803 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SNHG5-216	ENST00000623267	ITPR3	Q14573	2671 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNHG5-216	ENST00000623267	IGLV4-3	A0A075B6K6	122 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNHG5-216	ENST00000623267	ZNF815P	A8K554	130 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNHG5-216	ENST00000623267		A8MZ25	164 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNHG5-216	ENST00000623267	EREG	O14944	169 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNHG5-216	ENST00000623267	PDZD2	O15018	2839 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNHG5-216	ENST00000623267	PRM2	P04554	102 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNHG5-216	ENST00000623267	HIST2H2BD	Q6DRA6	164 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNHG5-216	ENST00000623267		Q6ZVH6	145 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNHG5-216	ENST00000623267	GTF2H5	Q6ZYL4	71 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNHG5-216	ENST00000623267	PCP2	Q8IVA1	136 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNHG5-216	ENST00000623267	CEND1	Q8N111	149 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNHG5-216	ENST00000623267	CHCHD7	Q9BUK0	85 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNHG5-216	ENST00000623267	CHAC1	Q9BUX1	264 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNHG5-216	ENST00000623267	TM2D2	Q9BX73	214 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNHG5-216	ENST00000623267	UBE2D4	Q9Y2X8	147 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNHG5-216	ENST00000623267	COX11	Q9Y6N1	276 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNHG5-216	ENST00000623267	GAGE12J	A6NER3	117 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SNHG5-216	ENST00000623267	TMEM238	C9JI98	176 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SNHG5-216	ENST00000623267		J3QQQ9	107 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SNHG5-216	ENST00000623267	DEFB130B	P0DP73	79 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SNHG5-216	ENST00000623267	DEFB130A	P0DP74	79 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SNHG5-216	ENST00000623267	EMP1	P54849	157 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SNHG5-216	ENST00000623267	DAD1	P61803	113 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SNHG5-216	ENST00000623267	GAGE4	Q13068	117 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SNHG5-216	ENST00000623267	GAGE5	Q13069	117 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SNHG5-216	ENST00000623267	FHL2	Q14192	279 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SNHG5-216	ENST00000623267	VAMP3	Q15836	100 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SNHG5-216	ENST00000623267	GAGE13	Q4V321	117 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SNHG5-216	ENST00000623267	SFTA2	Q6UW10	78 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SNHG5-216	ENST00000623267		Q6ZSN1	163 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SNHG5-216	ENST00000623267	C2orf91	Q6ZV80	131 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SNHG5-216	ENST00000623267	LINC00612	Q8N6U2	182 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SNHG5-216	ENST00000623267	PHLDA1	Q8WV24	401 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SNHG5-216	ENST00000623267	RNF183	Q96D59	192 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SNHG5-216	ENST00000623267	TENM4	Q6N022	2769 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SNHG5-216	ENST00000623267	MYO9A	B2RTY4	2548 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SNHG5-216	ENST00000623267	FLNA	P21333	2647 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
SNHG5-216	ENST00000623267	IGLV4-69	A0A075B6H9	119 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SNHG5-216	ENST00000623267	TRAV26-1	A0A087WT03	109 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SNHG5-216	ENST00000623267	TRBV6-8	A0A0A6YYG3	113 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SNHG5-216	ENST00000623267	IGHV1-58	A0A0C4DH39	117 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SNHG5-216	ENST00000623267	TMEM223	A0PJW6	202 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SNHG5-216	ENST00000623267	PLAC8L1	A1L4L8	177 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SNHG5-216	ENST00000623267	C9orf118	A6NHY6	69 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SNHG5-216	ENST00000623267	PAX4	O43316	350 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SNHG5-216	ENST00000623267	ATP5G1	P05496	136 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SNHG5-216	ENST00000623267	RPL24	P83731	157 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
SNHG5-216	ENST00000623267	UBE2V1	Q13404	147 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SNHG5-216	ENST00000623267	LYRM7	Q5U5X0	104 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SNHG5-216	ENST00000623267	FAM19A3	Q7Z5A8	133 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SNHG5-216	ENST00000623267	ATP6V0E2	Q8NHE4	81 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SNHG5-216	ENST00000623267	WFDC10A	Q9H1F0	79 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SNHG5-216	ENST00000623267	SPANXB1	Q9NS25	103 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
SNHG5-216	ENST00000623267	TP73-AS1	Q9UF72	201 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SNHG5-216	ENST00000623267	VPS13C	Q709C8	3753 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SNHG5-216	ENST00000623267	NOTCH2	Q04721	2471 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SNHG5-216	ENST00000623267	MXRA5	Q9NR99	2828 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SNHG5-216	ENST00000623267	IGKV2D-29	A0A075B6S2	120 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
SNHG5-216	ENST00000623267	IGKV2D-26	A0A0A0MRZ7	120 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SNHG5-216	ENST00000623267	TRAV16	A0A0A6YYK6	109 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
SNHG5-216	ENST00000623267	IGHV3-38	A0A0C4DH36	116 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SNHG5-216	ENST00000623267		A0A0J9YXV3	536 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SNHG5-216	ENST00000623267		A0A1B0GUV1	79 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SNHG5-216	ENST00000623267	IGKV2-29	A2NJV5	120 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
SNHG5-216	ENST00000623267	GAGE10	A6NGK3	116 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SNHG5-216	ENST00000623267	IGHV4-30-4	P0DP06	118 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SNHG5-216	ENST00000623267	FABP2	P12104	132 aa		4.05	□□□□□ -1.76

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