RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616306.1

UBXN8-208, Transcript of UBX domain protein 8, humanhuman

TSL 5

Gene UBXN8, Length 571 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8-208ENST00000616306 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
UBXN8-208ENST00000616306 ABCA13Q86UQ4 5058 aa6.68□□□□□ -1.34
UBXN8-208ENST00000616306 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa6.68□□□□□ -1.34
UBXN8-208ENST00000616306 EPM2AB3EWF7 344 aa6.68□□□□□ -1.34
UBXN8-208ENST00000616306 K7EN84 100 aa6.68□□□□□ -1.34
UBXN8-208ENST00000616306 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
UBXN8-208ENST00000616306 MGPP08493 103 aa6.68□□□□□ -1.34
UBXN8-208ENST00000616306 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa6.68□□□□□ -1.34
UBXN8-208ENST00000616306 Q8N976 141 aa6.68□□□□□ -1.34
UBXN8-208ENST00000616306 CHCHD5Q9BSY4 110 aa6.68□□□□□ -1.34
UBXN8-208ENST00000616306 DPH3P1Q9H4G8 78 aa6.68□□□□□ -1.34
UBXN8-208ENST00000616306 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
UBXN8-208ENST00000616306 DNAH5Q8TE73 4624 aa6.68□□□□□ -1.34
UBXN8-208ENST00000616306 APOBP04114 4563 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
UBXN8-208ENST00000616306 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa6.67□□□□□ -1.34
UBXN8-208ENST00000616306 IQCJQ1A5X6 159 aa6.67□□□□□ -1.34
UBXN8-208ENST00000616306 MPV17L2Q567V2 206 aa6.67□□□□□ -1.34
UBXN8-208ENST00000616306 SUMO4Q6EEV6 95 aa6.67□□□□□ -1.34
UBXN8-208ENST00000616306 RASL11AQ6T310 242 aa6.67□□□□□ -1.34
UBXN8-208ENST00000616306 BAALCQ8WXS3 180 aa6.67□□□□□ -1.34
UBXN8-208ENST00000616306 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
UBXN8-208ENST00000616306 NIT2Q9NQR4 276 aa6.67□□□□□ -1.34
UBXN8-208ENST00000616306 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa6.66□□□□□ -1.34
UBXN8-208ENST00000616306 LECT2O14960 151 aa6.66□□□□□ -1.34
UBXN8-208ENST00000616306 CRPP02741 224 aa6.66□□□□□ -1.34
UBXN8-208ENST00000616306 ANGP03950 147 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
UBXN8-208ENST00000616306 IFITM2Q01629 132 aa6.66□□□□□ -1.34
UBXN8-208ENST00000616306 ENHOQ6UWT2 76 aa6.66□□□□□ -1.34
UBXN8-208ENST00000616306 FAM231DQ6ZW35 169 aa6.66□□□□□ -1.34
UBXN8-208ENST00000616306 C15orf54Q8N8G6 183 aa6.66□□□□□ -1.34
UBXN8-208ENST00000616306 FRZBQ92765 325 aa6.66□□□□□ -1.34
UBXN8-208ENST00000616306 PGLYRP4Q96LB8 373 aa6.66□□□□□ -1.34
UBXN8-208ENST00000616306 C1orf43Q9BWL3 253 aa6.66□□□□□ -1.34
UBXN8-208ENST00000616306 GAGE12HA6NDE8 117 aa6.65□□□□□ -1.34
UBXN8-208ENST00000616306 A8MWL6 223 aa6.65□□□□□ -1.34
UBXN8-208ENST00000616306 RBX1P62877 108 aa6.65□□□□□ -1.34
UBXN8-208ENST00000616306 TWIST1Q15672 202 aa6.65□□□□□ -1.34
UBXN8-208ENST00000616306 MIAQ16674 131 aa6.65□□□□□ -1.34
UBXN8-208ENST00000616306 C14orf177Q52M58 125 aa6.65□□□□□ -1.34
UBXN8-208ENST00000616306 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa6.65□□□□□ -1.34
UBXN8-208ENST00000616306 PRR34Q9NV39 138 aa6.65□□□□□ -1.34
UBXN8-208ENST00000616306 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
UBXN8-208ENST00000616306 GATCO43716 136 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
UBXN8-208ENST00000616306 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
UBXN8-208ENST00000616306 Q6ZSA8 131 aa6.64□□□□□ -1.35
UBXN8-208ENST00000616306 GTSF1Q8WW33 167 aa6.64□□□□□ -1.35
UBXN8-208ENST00000616306 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
UBXN8-208ENST00000616306 A0A1B0GUV1 79 aa6.63□□□□□ -1.35
UBXN8-208ENST00000616306 CEBPGP53567 150 aa6.63□□□□□ -1.35
UBXN8-208ENST00000616306 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
UBXN8-208ENST00000616306 GAGE6Q13070 117 aa6.63□□□□□ -1.35
UBXN8-208ENST00000616306 Q5VSD8 79 aa6.63□□□□□ -1.35
UBXN8-208ENST00000616306 TEX261Q6UWH6 196 aa6.63□□□□□ -1.35
UBXN8-208ENST00000616306 SMIM15Q7Z3B0 74 aa6.63□□□□□ -1.35
UBXN8-208ENST00000616306 SMIM7Q9BQ49 75 aa6.63□□□□□ -1.35
UBXN8-208ENST00000616306 TMEM243Q9BU79 118 aa6.63□□□□□ -1.35
UBXN8-208ENST00000616306 FAM30AQ9NZY2 134 aa6.63□□□□□ -1.35
UBXN8-208ENST00000616306 FAM231BA6NCW3 169 aa6.62□□□□□ -1.35
UBXN8-208ENST00000616306 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
UBXN8-208ENST00000616306 COTL1Q14019 142 aa6.62□□□□□ -1.35
UBXN8-208ENST00000616306 LINC01551Q86U37 167 aa6.62□□□□□ -1.35
UBXN8-208ENST00000616306 LINC00269Q8N2A0 174 aa6.62□□□□□ -1.35
UBXN8-208ENST00000616306 GATD1Q8NB37 220 aa6.62□□□□□ -1.35
UBXN8-208ENST00000616306 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
UBXN8-208ENST00000616306 ZNF727A8MUV8 499 aa6.61□□□□□ -1.35
UBXN8-208ENST00000616306 SRP19P09132 144 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
UBXN8-208ENST00000616306 REG3AQ06141 175 aa6.61□□□□□ -1.35
UBXN8-208ENST00000616306 GFRA4Q9GZZ7 299 aa6.61□□□□□ -1.35
UBXN8-208ENST00000616306 OSTCQ9NRP0 149 aa6.61□□□□□ -1.35
UBXN8-208ENST00000616306 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa6.6□□□□□ -1.35
UBXN8-208ENST00000616306 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa6.6□□□□□ -1.35
UBXN8-208ENST00000616306 USP17L23D6RBM5 183 aa6.6□□□□□ -1.35
UBXN8-208ENST00000616306 NCR2O95944 276 aa6.6□□□□□ -1.35
UBXN8-208ENST00000616306 HLA-DQA1P01909 254 aa6.6□□□□□ -1.35
UBXN8-208ENST00000616306 INAFM2P0DMQ5 153 aa6.6□□□□□ -1.35
UBXN8-208ENST00000616306 AMTP48728 403 aa6.6□□□□□ -1.35
UBXN8-208ENST00000616306 HAMPP81172 84 aa6.6□□□□□ -1.35
UBXN8-208ENST00000616306 FAM74A3Q4VXF1 159 aa6.6□□□□□ -1.35
UBXN8-208ENST00000616306 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa6.6□□□□□ -1.35
UBXN8-208ENST00000616306 C20orf203Q8NBC4 194 aa6.6□□□□□ -1.35
UBXN8-208ENST00000616306 TSKUQ8WUA8 353 aa6.6□□□□□ -1.35
UBXN8-208ENST00000616306 BORCS7Q96B45 105 aa6.6□□□□□ -1.35
UBXN8-208ENST00000616306 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa6.59□□□□□ -1.35
UBXN8-208ENST00000616306 A0A1B0GUT8 65 aa6.59□□□□□ -1.35
UBXN8-208ENST00000616306 LINC00862A6NCI5 91 aa6.59□□□□□ -1.35
UBXN8-208ENST00000616306 HIGD1CA8MV81 97 aa6.59□□□□□ -1.35
UBXN8-208ENST00000616306 UBE2L6O14933 153 aa6.59□□□□□ -1.35
UBXN8-208ENST00000616306 LINC01620Q4KN68 170 aa6.59□□□□□ -1.35
UBXN8-208ENST00000616306 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa6.59□□□□□ -1.35
UBXN8-208ENST00000616306 CLPSL2Q6UWE3 100 aa6.59□□□□□ -1.35
UBXN8-208ENST00000616306 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa6.58□□□□□ -1.36
UBXN8-208ENST00000616306 SDHAF1A6NFY7 115 aa6.58□□□□□ -1.36
UBXN8-208ENST00000616306 H7C423 109 aa6.58□□□□□ -1.36
UBXN8-208ENST00000616306 RAB14P61106 215 aa6.58□□□□□ -1.36
UBXN8-208ENST00000616306 TMEM241Q24JQ0 296 aa6.58□□□□□ -1.36
UBXN8-208ENST00000616306 CLLU1Q5K131 121 aa6.58□□□□□ -1.36
UBXN8-208ENST00000616306 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
UBXN8-208ENST00000616306 CHAC1Q9BUX1 264 aa6.58□□□□□ -1.36
UBXN8-208ENST00000616306 TMEM191AQ9H0A3 160 aa6.58□□□□□ -1.36
UBXN8-208ENST00000616306 SMDT1Q9H4I9 107 aa6.58□□□□□ -1.36
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