RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608473.5

GTF3C2-AS1-211, GTF3C2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene GTF3C2-AS1, Length 554 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 CYTL1Q9NRR1 136 aa5.56□□□□□ -1.52
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 PRR34Q9NV39 138 aa5.56□□□□□ -1.52
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 TEX46H3BTG2 121 aa5.55□□□□□ -1.52
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 TRGC1P0CF51 173 aa5.55□□□□□ -1.52
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 GZMBP10144 247 aa5.55□□□□□ -1.52
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 SULT1A2P50226 295 aa5.55□□□□□ -1.52
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 RGS21Q2M5E4 152 aa5.55□□□□□ -1.52
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 CFAP161Q6P656 301 aa5.55□□□□□ -1.52
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 SDIM1Q6ZPB5 146 aa5.55□□□□□ -1.52
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa5.55□□□□□ -1.52
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa5.55□□□□□ -1.52
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 OR2D3Q8NGH3 330 aa5.55□□□□□ -1.52
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 MLST8Q9BVC4 326 aa5.55□□□□□ -1.52
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 F2Z2F3 143 aa5.54□□□□□ -1.52
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 RPL35P42766 123 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 RAB5CP51148 216 aa5.54□□□□□ -1.52
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ZNF345Q14585 488 aa5.54□□□□□ -1.52
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 RASL11AQ6T310 242 aa5.54□□□□□ -1.52
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 Q6ZRU5 148 aa5.54□□□□□ -1.52
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 C7orf33Q8WU49 177 aa5.54□□□□□ -1.52
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 MANBALQ9NQG1 85 aa5.54□□□□□ -1.52
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 BIN3Q9NQY0 253 aa5.54□□□□□ -1.52
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 GNG13Q9P2W3 67 aa5.54□□□□□ -1.52
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 A0A1B0GUV1 79 aa5.53□□□□□ -1.52
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 M0QY20 66 aa5.53□□□□□ -1.52
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 IFNA1P01562 189 aa5.53□□□□□ -1.52
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 AMTP48728 403 aa5.53□□□□□ -1.52
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 GNG4P50150 75 aa5.53□□□□□ -1.52
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 CNBPP62633 177 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 COTL1Q14019 142 aa5.53□□□□□ -1.52
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 SUMO4Q6EEV6 95 aa5.53□□□□□ -1.52
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 RNF185Q96GF1 192 aa5.53□□□□□ -1.52
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 NIT2Q9NQR4 276 aa5.53□□□□□ -1.52
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa5.53□□□□□ -1.52
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa5.52□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 SMLR1H3BR10 107 aa5.52□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 BCL2L11O43521 198 aa5.52□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 CENPWQ5EE01 88 aa5.52□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa5.52□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 A0A087WYN8 130 aa5.51□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa5.51□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 HMSDA8MTL9 139 aa5.51□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa5.51□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 SMIM15Q7Z3B0 74 aa5.51□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 C20orf203Q8NBC4 194 aa5.51□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 SMIM12Q96EX1 92 aa5.51□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 PGLYRP4Q96LB8 373 aa5.51□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 MED9Q9NWA0 146 aa5.51□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa5.5□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 G3V3Q6 166 aa5.5□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 PANO1I0J062 215 aa5.5□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 PDE6DO43924 150 aa5.5□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 IGLC6P0CF74 106 aa5.5□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 NTF3P20783 257 aa5.5□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 CCL20P78556 96 aa5.5□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 TWIST1Q15672 202 aa5.5□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 LYZL1Q6UWQ5 148 aa5.5□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 GTSF1Q8WW33 167 aa5.5□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 C11orf52Q96A22 123 aa5.5□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 PKIGQ9Y2B9 76 aa5.5□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 DNAH8Q96JB1 4490 aa5.5□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa5.49□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 RAB19A4D1S5 217 aa5.49□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 CHTF8P0CG12 524 aa5.49□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 RPS10P46783 165 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 MAJINQ3KP22 176 aa5.49□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 LCE1DQ5T752 114 aa5.49□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 BTF3L4Q96K17 158 aa5.49□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa5.48□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 C19orf71A6NCJ1 209 aa5.48□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 COX6A2Q02221 97 aa5.48□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 HIGD2BQ4VC39 106 aa5.48□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 TEX261Q6UWH6 196 aa5.48□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 C9orf62Q8N4C0 152 aa5.48□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 SPACA4Q8TDM5 124 aa5.48□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 TMEM101Q96IK0 257 aa5.48□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 HMCN2Q8NDA2 5059 aa5.47□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 H7C423 109 aa5.47□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 PHOX2AO14813 284 aa5.47□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 NCR2O95944 276 aa5.47□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 APCSP02743 223 aa5.47□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 GFRA4Q9GZZ7 299 aa5.47□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 PLAC8Q9NZF1 115 aa5.47□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 LINC00474Q9P2X8 69 aa5.47□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 TRIAP1O43715 76 aa5.46□□□□□ -1.54
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 SLPIP03973 132 aa5.46□□□□□ -1.54
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 PMCHP20382 165 aa5.46□□□□□ -1.54
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 CTRLP40313 264 aa5.46□□□□□ -1.54
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 STPG4Q8N801 248 aa5.46□□□□□ -1.54
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 LYPD6BQ8NI32 183 aa5.46□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.2 ms