RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598539.5

FCHO1-225, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 5

Gene FCHO1, Length 551 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-225ENST00000598539 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa8.79□□□□□ -1
FCHO1-225ENST00000598539 HLA-DQA1P01909 254 aa8.79□□□□□ -1
FCHO1-225ENST00000598539 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
FCHO1-225ENST00000598539 MT-ND6P03923 174 aa8.79□□□□□ -1
FCHO1-225ENST00000598539 RAB4AP20338 218 aa8.79□□□□□ -1
FCHO1-225ENST00000598539 LELP1Q5T871 98 aa8.79□□□□□ -1
FCHO1-225ENST00000598539 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
FCHO1-225ENST00000598539 RNF185Q96GF1 192 aa8.79□□□□□ -1
FCHO1-225ENST00000598539 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa8.79□□□□□ -1
FCHO1-225ENST00000598539 MYCBP2O75592 4640 aa8.78□□□□□ -1
FCHO1-225ENST00000598539 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa8.78□□□□□ -1
FCHO1-225ENST00000598539 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa8.78□□□□□ -1
FCHO1-225ENST00000598539 GCSHP23434 173 aa8.78□□□□□ -1
FCHO1-225ENST00000598539 LYPD5Q6UWN5 251 aa8.78□□□□□ -1
FCHO1-225ENST00000598539 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa8.78□□□□□ -1
FCHO1-225ENST00000598539 PHOX2AO14813 284 aa8.77□□□□□ -1.01
FCHO1-225ENST00000598539 CKS2P33552 79 aa8.77□□□□□ -1.01
FCHO1-225ENST00000598539 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
FCHO1-225ENST00000598539 ORMDL3Q8N138 153 aa8.77□□□□□ -1.01
FCHO1-225ENST00000598539 TMEM70Q9BUB7 260 aa8.77□□□□□ -1.01
FCHO1-225ENST00000598539 SMCO4Q9NRQ5 59 aa8.77□□□□□ -1.01
FCHO1-225ENST00000598539 A0A087WTM6 91 aa8.76□□□□□ -1.01
FCHO1-225ENST00000598539 K7EP13 123 aa8.76□□□□□ -1.01
FCHO1-225ENST00000598539 NCR2O95944 276 aa8.76□□□□□ -1.01
FCHO1-225ENST00000598539 KRTAP10-1P60331 282 aa8.76□□□□□ -1.01
FCHO1-225ENST00000598539 ST20Q9HBF5 79 aa8.76□□□□□ -1.01
FCHO1-225ENST00000598539 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa8.75□□□□□ -1.01
FCHO1-225ENST00000598539 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa8.75□□□□□ -1.01
FCHO1-225ENST00000598539 SDHAF1A6NFY7 115 aa8.75□□□□□ -1.01
FCHO1-225ENST00000598539 TCAPO15273 167 aa8.75□□□□□ -1.01
FCHO1-225ENST00000598539 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
FCHO1-225ENST00000598539 COTL1Q14019 142 aa8.75□□□□□ -1.01
FCHO1-225ENST00000598539 C10orf126Q8N4M7 172 aa8.75□□□□□ -1.01
FCHO1-225ENST00000598539 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
FCHO1-225ENST00000598539 C20orf78Q9BR46 151 aa8.75□□□□□ -1.01
FCHO1-225ENST00000598539 CHCHD7Q9BUK0 85 aa8.75□□□□□ -1.01
FCHO1-225ENST00000598539 GNB1LQ9BYB4 327 aa8.75□□□□□ -1.01
FCHO1-225ENST00000598539 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa8.74□□□□□ -1.01
FCHO1-225ENST00000598539 D6R8Y8 96 aa8.74□□□□□ -1.01
FCHO1-225ENST00000598539 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP8.74□□□□□ -1.01
FCHO1-225ENST00000598539 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
FCHO1-225ENST00000598539 RPL32P62910 135 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
FCHO1-225ENST00000598539 ELOBQ15370 118 aa8.74□□□□□ -1.01
FCHO1-225ENST00000598539 TMEM136Q6ZRR5 245 aa8.74□□□□□ -1.01
FCHO1-225ENST00000598539 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa8.73□□□□□ -1.01
FCHO1-225ENST00000598539 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
FCHO1-225ENST00000598539 I3L3M4 83 aa8.73□□□□□ -1.01
FCHO1-225ENST00000598539 APCSP02743 223 aa8.73□□□□□ -1.01
FCHO1-225ENST00000598539 NRACQ8N912 160 aa8.73□□□□□ -1.01
FCHO1-225ENST00000598539 Q9UF83 564 aa8.73□□□□□ -1.01
FCHO1-225ENST00000598539 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa8.72□□□□□ -1.01
FCHO1-225ENST00000598539 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa8.72□□□□□ -1.01
FCHO1-225ENST00000598539 SMKR1H3BMG3 65 aa8.72□□□□□ -1.01
FCHO1-225ENST00000598539 DNAH10OSP0CZ25 163 aa8.72□□□□□ -1.01
FCHO1-225ENST00000598539 AMTP48728 403 aa8.72□□□□□ -1.01
FCHO1-225ENST00000598539 IQCJQ1A5X6 159 aa8.72□□□□□ -1.01
FCHO1-225ENST00000598539 LINC01556Q5JQF7 62 aa8.72□□□□□ -1.01
FCHO1-225ENST00000598539 ATRAIDQ6UW56 229 aa8.72□□□□□ -1.01
FCHO1-225ENST00000598539 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa8.72□□□□□ -1.01
FCHO1-225ENST00000598539 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
FCHO1-225ENST00000598539 PRELID3AQ96N28 172 aa8.72□□□□□ -1.01
FCHO1-225ENST00000598539 KIR2DL4Q99706 377 aa8.72□□□□□ -1.01
FCHO1-225ENST00000598539 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa8.71□□□□□ -1.01
FCHO1-225ENST00000598539 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa8.71□□□□□ -1.02
FCHO1-225ENST00000598539 VCYO14598 125 aa8.71□□□□□ -1.02
FCHO1-225ENST00000598539 TNFRSF6BO95407 300 aa8.71□□□□□ -1.02
FCHO1-225ENST00000598539 PMCHP20382 165 aa8.71□□□□□ -1.02
FCHO1-225ENST00000598539 S100A1P23297 94 aa8.71□□□□□ -1.02
FCHO1-225ENST00000598539 RPS10P46783 165 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
FCHO1-225ENST00000598539 SMAGPQ0VAQ4 97 aa8.71□□□□□ -1.02
FCHO1-225ENST00000598539 WFDC10BQ8IUB3 73 aa8.71□□□□□ -1.02
FCHO1-225ENST00000598539 CBLN2Q8IUK8 224 aa8.71□□□□□ -1.02
FCHO1-225ENST00000598539 TMEM243Q9BU79 118 aa8.71□□□□□ -1.02
FCHO1-225ENST00000598539 SMIM2Q9BVW6 85 aa8.71□□□□□ -1.02
FCHO1-225ENST00000598539 MAP1LC3AQ9H492 121 aa8.71□□□□□ -1.02
FCHO1-225ENST00000598539 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa8.7□□□□□ -1.02
FCHO1-225ENST00000598539 UBE2L6O14933 153 aa8.7□□□□□ -1.02
FCHO1-225ENST00000598539 FCER1GP30273 86 aa8.7□□□□□ -1.02
FCHO1-225ENST00000598539 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
FCHO1-225ENST00000598539 CHCHD5Q9BSY4 110 aa8.7□□□□□ -1.02
FCHO1-225ENST00000598539 A0A087WX48 190 aa8.69□□□□□ -1.02
FCHO1-225ENST00000598539 H7C423 109 aa8.69□□□□□ -1.02
FCHO1-225ENST00000598539 PSCAO43653 123 aa8.69□□□□□ -1.02
FCHO1-225ENST00000598539 NPYP01303 97 aa8.69□□□□□ -1.02
FCHO1-225ENST00000598539 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
FCHO1-225ENST00000598539 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa8.69□□□□□ -1.02
FCHO1-225ENST00000598539 GAS8-AS1O95177 125 aa8.68□□□□□ -1.02
FCHO1-225ENST00000598539 FABP9Q0Z7S8 132 aa8.68□□□□□ -1.02
FCHO1-225ENST00000598539 LAGE3Q14657 143 aa8.68□□□□□ -1.02
FCHO1-225ENST00000598539 NIT1Q86X76 327 aa8.68□□□□□ -1.02
FCHO1-225ENST00000598539 YPEL4Q96NS1 127 aa8.68□□□□□ -1.02
FCHO1-225ENST00000598539 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa8.68□□□□□ -1.02
FCHO1-225ENST00000598539 FAT1Q14517 4588 aa8.68□□□□□ -1.02
FCHO1-225ENST00000598539 K7EMI3 77 aa8.67□□□□□ -1.02
FCHO1-225ENST00000598539 ATP6V1G1O75348 118 aa8.67□□□□□ -1.02
FCHO1-225ENST00000598539 TSHBP01222 138 aa8.67□□□□□ -1.02
FCHO1-225ENST00000598539 TMEM18Q96B42 140 aa8.67□□□□□ -1.02
FCHO1-225ENST00000598539 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
FCHO1-225ENST00000598539 PRSS47A8MTI9 375 aa8.66□□□□□ -1.02
FCHO1-225ENST00000598539 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
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