RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593200.5

EFTUD2-226, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 485 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-226ENST00000593200 COX6A2Q02221 97 aa6.48□□□□□ -1.37
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF345Q14585 488 aa6.48□□□□□ -1.37
EFTUD2-226ENST00000593200 OR2D3Q8NGH3 330 aa6.48□□□□□ -1.37
EFTUD2-226ENST00000593200 C11orf52Q96A22 123 aa6.48□□□□□ -1.37
EFTUD2-226ENST00000593200 LINC01600Q96MT4 127 aa6.48□□□□□ -1.37
EFTUD2-226ENST00000593200 NIT2Q9NQR4 276 aa6.48□□□□□ -1.37
EFTUD2-226ENST00000593200 C19orf71A6NCJ1 209 aa6.47□□□□□ -1.37
EFTUD2-226ENST00000593200 GAGE12HA6NDE8 117 aa6.47□□□□□ -1.37
EFTUD2-226ENST00000593200 F2Z2F3 143 aa6.47□□□□□ -1.37
EFTUD2-226ENST00000593200 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
EFTUD2-226ENST00000593200 TRGC1P0CF51 173 aa6.47□□□□□ -1.37
EFTUD2-226ENST00000593200 RPS10P46783 165 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
EFTUD2-226ENST00000593200 AMTP48728 403 aa6.47□□□□□ -1.37
EFTUD2-226ENST00000593200 PRR3P79522 188 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
EFTUD2-226ENST00000593200 COTL1Q14019 142 aa6.47□□□□□ -1.37
EFTUD2-226ENST00000593200 MAJINQ3KP22 176 aa6.47□□□□□ -1.37
EFTUD2-226ENST00000593200 CENPWQ5EE01 88 aa6.47□□□□□ -1.37
EFTUD2-226ENST00000593200 CFAP161Q6P656 301 aa6.47□□□□□ -1.37
EFTUD2-226ENST00000593200 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa6.47□□□□□ -1.37
EFTUD2-226ENST00000593200 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa6.46□□□□□ -1.38
EFTUD2-226ENST00000593200 XKRY2A2RUG3 117 aa6.46□□□□□ -1.38
EFTUD2-226ENST00000593200 SMLR1H3BR10 107 aa6.46□□□□□ -1.38
EFTUD2-226ENST00000593200 HIGD2BQ4VC39 106 aa6.46□□□□□ -1.38
EFTUD2-226ENST00000593200 GTSF1Q8WW33 167 aa6.46□□□□□ -1.38
EFTUD2-226ENST00000593200 MANBALQ9NQG1 85 aa6.46□□□□□ -1.38
EFTUD2-226ENST00000593200 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa6.45□□□□□ -1.38
EFTUD2-226ENST00000593200 NTF3P20783 257 aa6.45□□□□□ -1.38
EFTUD2-226ENST00000593200 ODF1Q14990 250 aa6.45□□□□□ -1.38
EFTUD2-226ENST00000593200 LYZL1Q6UWQ5 148 aa6.45□□□□□ -1.38
EFTUD2-226ENST00000593200 STPG4Q8N801 248 aa6.45□□□□□ -1.38
EFTUD2-226ENST00000593200 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
EFTUD2-226ENST00000593200 SMIM12Q96EX1 92 aa6.45□□□□□ -1.38
EFTUD2-226ENST00000593200 GNG13Q9P2W3 67 aa6.45□□□□□ -1.38
EFTUD2-226ENST00000593200 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
EFTUD2-226ENST00000593200 A0A0J9YXV3 536 aa6.44□□□□□ -1.38
EFTUD2-226ENST00000593200 BCL2L11O43521 198 aa6.44□□□□□ -1.38
EFTUD2-226ENST00000593200 CTRLP40313 264 aa6.44□□□□□ -1.38
EFTUD2-226ENST00000593200 GNG4P50150 75 aa6.44□□□□□ -1.38
EFTUD2-226ENST00000593200 CCL20P78556 96 aa6.44□□□□□ -1.38
EFTUD2-226ENST00000593200 BATF3Q9NR55 127 aa6.44□□□□□ -1.38
EFTUD2-226ENST00000593200 A0A096LNI7 61 aa6.43□□□□□ -1.38
EFTUD2-226ENST00000593200 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa6.43□□□□□ -1.38
EFTUD2-226ENST00000593200 RAB19A4D1S5 217 aa6.43□□□□□ -1.38
EFTUD2-226ENST00000593200 HMSDA8MTL9 139 aa6.43□□□□□ -1.38
EFTUD2-226ENST00000593200 IFNA1P01562 189 aa6.43□□□□□ -1.38
EFTUD2-226ENST00000593200 LCE2CQ5TA81 110 aa6.43□□□□□ -1.38
EFTUD2-226ENST00000593200 Q6ZNX1 250 aa6.43□□□□□ -1.38
EFTUD2-226ENST00000593200 C9orf62Q8N4C0 152 aa6.43□□□□□ -1.38
EFTUD2-226ENST00000593200 GATD1Q8NB37 220 aa6.43□□□□□ -1.38
EFTUD2-226ENST00000593200 LYPD6BQ8NI32 183 aa6.43□□□□□ -1.38
EFTUD2-226ENST00000593200 CNFNQ9BYD5 112 aa6.43□□□□□ -1.38
EFTUD2-226ENST00000593200 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa6.42□□□□□ -1.38
EFTUD2-226ENST00000593200 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa6.42□□□□□ -1.38
EFTUD2-226ENST00000593200 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa6.42□□□□□ -1.38
EFTUD2-226ENST00000593200 NCR2O95944 276 aa6.42□□□□□ -1.38
EFTUD2-226ENST00000593200 KRTAP10-8P60410 259 aa6.42□□□□□ -1.38
EFTUD2-226ENST00000593200 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
EFTUD2-226ENST00000593200 FOXI1Q12951 378 aa6.42□□□□□ -1.38
EFTUD2-226ENST00000593200 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa6.42□□□□□ -1.38
EFTUD2-226ENST00000593200 SPINK6Q6UWN8 80 aa6.42□□□□□ -1.38
EFTUD2-226ENST00000593200 LINC00474Q9P2X8 69 aa6.42□□□□□ -1.38
EFTUD2-226ENST00000593200 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
EFTUD2-226ENST00000593200 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
EFTUD2-226ENST00000593200 H7C423 109 aa6.41□□□□□ -1.38
EFTUD2-226ENST00000593200 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
EFTUD2-226ENST00000593200 TWIST1Q15672 202 aa6.41□□□□□ -1.38
EFTUD2-226ENST00000593200 RGS21Q2M5E4 152 aa6.41□□□□□ -1.38
EFTUD2-226ENST00000593200 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
EFTUD2-226ENST00000593200 REG3GQ6UW15 175 aa6.41□□□□□ -1.38
EFTUD2-226ENST00000593200 BIN3Q9NQY0 253 aa6.41□□□□□ -1.38
EFTUD2-226ENST00000593200 PDE6DO43924 150 aa6.4□□□□□ -1.38
EFTUD2-226ENST00000593200 APCSP02743 223 aa6.4□□□□□ -1.38
EFTUD2-226ENST00000593200 FGF6P10767 208 aa6.4□□□□□ -1.38
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
EFTUD2-226ENST00000593200 NUDT10Q8NFP7 164 aa6.4□□□□□ -1.38
EFTUD2-226ENST00000593200 OR5A1Q8NGJ0 315 aa6.4□□□□□ -1.38
EFTUD2-226ENST00000593200 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
EFTUD2-226ENST00000593200 NUDT11Q96G61 164 aa6.4□□□□□ -1.38
EFTUD2-226ENST00000593200 PKIGQ9Y2B9 76 aa6.4□□□□□ -1.38
EFTUD2-226ENST00000593200 SDHAF1A6NFY7 115 aa6.39□□□□□ -1.39
EFTUD2-226ENST00000593200 TEX46H3BTG2 121 aa6.39□□□□□ -1.39
EFTUD2-226ENST00000593200 XCL1P47992 114 aa6.39□□□□□ -1.39
EFTUD2-226ENST00000593200 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP6.39□□□□□ -1.39
EFTUD2-226ENST00000593200 Q6ZRP5 223 aa6.39□□□□□ -1.39
EFTUD2-226ENST00000593200 LINC00526Q96FQ7 95 aa6.39□□□□□ -1.39
EFTUD2-226ENST00000593200 CARD19Q96LW7 228 aa6.39□□□□□ -1.39
EFTUD2-226ENST00000593200 MED9Q9NWA0 146 aa6.39□□□□□ -1.39
EFTUD2-226ENST00000593200 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa6.38□□□□□ -1.39
EFTUD2-226ENST00000593200 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa6.38□□□□□ -1.39
EFTUD2-226ENST00000593200 CCL25O15444 150 aa6.38□□□□□ -1.39
EFTUD2-226ENST00000593200 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
EFTUD2-226ENST00000593200 FAM231BA6NCW3 169 aa6.37□□□□□ -1.39
EFTUD2-226ENST00000593200 K7EN84 100 aa6.37□□□□□ -1.39
EFTUD2-226ENST00000593200 BCL2P10415 239 aa6.37□□□□□ -1.39
EFTUD2-226ENST00000593200 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
EFTUD2-226ENST00000593200 TEX261Q6UWH6 196 aa6.37□□□□□ -1.39
EFTUD2-226ENST00000593200 SMIM15Q7Z3B0 74 aa6.37□□□□□ -1.39
EFTUD2-226ENST00000593200 BTF3L4Q96K17 158 aa6.37□□□□□ -1.39
EFTUD2-226ENST00000593200 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
EFTUD2-226ENST00000593200 I3L3M4 83 aa6.36□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 124.3 ms