RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592483.5

CAPNS1-214, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 431 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-214ENST00000592483 FABP9Q0Z7S8 132 aa16.28■□□□□ 0.2
CAPNS1-214ENST00000592483 Q9UF83 564 aa16.28■□□□□ 0.2
CAPNS1-214ENST00000592483 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa16.27■□□□□ 0.2
CAPNS1-214ENST00000592483 RPL32P62910 135 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.2
CAPNS1-214ENST00000592483 TMEM97Q5BJF2 176 aa16.27■□□□□ 0.2
CAPNS1-214ENST00000592483 C1orf134Q5TEV5 83 aa16.27■□□□□ 0.2
CAPNS1-214ENST00000592483 TNFRSF6BO95407 300 aa16.26■□□□□ 0.19
CAPNS1-214ENST00000592483 RPS10P46783 165 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
CAPNS1-214ENST00000592483 SDHAF1A6NFY7 115 aa16.25■□□□□ 0.19
CAPNS1-214ENST00000592483 GAS8-AS1O95177 125 aa16.25■□□□□ 0.19
CAPNS1-214ENST00000592483 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
CAPNS1-214ENST00000592483 GTSF1LQ9H1H1 148 aa16.24■□□□□ 0.19
CAPNS1-214ENST00000592483 PRSS47A8MTI9 375 aa16.23■□□□□ 0.19
CAPNS1-214ENST00000592483 NPYP01303 97 aa16.23■□□□□ 0.19
CAPNS1-214ENST00000592483 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
CAPNS1-214ENST00000592483 TMEM70Q9BUB7 260 aa16.23■□□□□ 0.19
CAPNS1-214ENST00000592483 VCYO14598 125 aa16.22■□□□□ 0.19
CAPNS1-214ENST00000592483 CCL18P55774 89 aa16.22■□□□□ 0.19
CAPNS1-214ENST00000592483 KIAA1644Q3SXP7 199 aa16.22■□□□□ 0.19
CAPNS1-214ENST00000592483 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
CAPNS1-214ENST00000592483 MAP1LC3AQ9H492 121 aa16.22■□□□□ 0.19
CAPNS1-214ENST00000592483 DNAH5Q8TE73 4624 aa16.22■□□□□ 0.19
CAPNS1-214ENST00000592483 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa16.21■□□□□ 0.19
CAPNS1-214ENST00000592483 I3L3M4 83 aa16.21■□□□□ 0.19
CAPNS1-214ENST00000592483 TCAPO15273 167 aa16.21■□□□□ 0.19
CAPNS1-214ENST00000592483 LYPD5Q6UWN5 251 aa16.2■□□□□ 0.18
CAPNS1-214ENST00000592483 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa16.2■□□□□ 0.18
CAPNS1-214ENST00000592483 SMIM2Q9BVW6 85 aa16.2■□□□□ 0.18
CAPNS1-214ENST00000592483 PMCHP20382 165 aa16.19■□□□□ 0.18
CAPNS1-214ENST00000592483 TNP2Q05952 138 aa16.19■□□□□ 0.18
CAPNS1-214ENST00000592483 COTL1Q14019 142 aa16.19■□□□□ 0.18
CAPNS1-214ENST00000592483 ESRGQ1W209 222 aa16.18■□□□□ 0.18
CAPNS1-214ENST00000592483 LELP1Q5T871 98 aa16.18■□□□□ 0.18
CAPNS1-214ENST00000592483 KIR2DL4Q99706 377 aa16.18■□□□□ 0.18
CAPNS1-214ENST00000592483 TRGC2P03986 189 aa16.17■□□□□ 0.18
CAPNS1-214ENST00000592483 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
CAPNS1-214ENST00000592483 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa16.16■□□□□ 0.18
CAPNS1-214ENST00000592483 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa16.16■□□□□ 0.18
CAPNS1-214ENST00000592483 K7EMI3 77 aa16.16■□□□□ 0.18
CAPNS1-214ENST00000592483 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
CAPNS1-214ENST00000592483 UPK3BQ9BT76 320 aa16.15■□□□□ 0.18
CAPNS1-214ENST00000592483 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa16.14■□□□□ 0.17
CAPNS1-214ENST00000592483 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa16.14■□□□□ 0.17
CAPNS1-214ENST00000592483 IQCJQ1A5X6 159 aa16.14■□□□□ 0.17
CAPNS1-214ENST00000592483 Q8N8P6 123 aa16.14■□□□□ 0.17
CAPNS1-214ENST00000592483 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa16.13■□□□□ 0.17
CAPNS1-214ENST00000592483 FCER1GP30273 86 aa16.13■□□□□ 0.17
CAPNS1-214ENST00000592483 PKIAP61925 76 aa16.13■□□□□ 0.17
CAPNS1-214ENST00000592483 LINC00588Q9Y4M8 146 aa16.13■□□□□ 0.17
CAPNS1-214ENST00000592483 EPM2AB3EWF7 344 aa16.12■□□□□ 0.17
CAPNS1-214ENST00000592483 INAFM2P0DMQ5 153 aa16.12■□□□□ 0.17
CAPNS1-214ENST00000592483 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
CAPNS1-214ENST00000592483 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa16.11■□□□□ 0.17
CAPNS1-214ENST00000592483 TSHBP01222 138 aa16.11■□□□□ 0.17
CAPNS1-214ENST00000592483 AMTP48728 403 aa16.11■□□□□ 0.17
CAPNS1-214ENST00000592483 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa16.11■□□□□ 0.17
CAPNS1-214ENST00000592483 C18orf32Q8TCD1 76 aa16.11■□□□□ 0.17
CAPNS1-214ENST00000592483 UBR4Q5T4S7 5183 aa16.11■□□□□ 0.17
CAPNS1-214ENST00000592483 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa16.1■□□□□ 0.17
CAPNS1-214ENST00000592483 TMEM243Q9BU79 118 aa16.1■□□□□ 0.17
CAPNS1-214ENST00000592483 RAB5BP61020 215 aa16.09■□□□□ 0.17
CAPNS1-214ENST00000592483 H7C423 109 aa16.08■□□□□ 0.16
CAPNS1-214ENST00000592483 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
CAPNS1-214ENST00000592483 ORMDL2Q53FV1 153 aa16.07■□□□□ 0.16
CAPNS1-214ENST00000592483 CHCHD7Q9BUK0 85 aa16.07■□□□□ 0.16
CAPNS1-214ENST00000592483 LINC01546A6NGU7 62 aa16.06■□□□□ 0.16
CAPNS1-214ENST00000592483 ESDP10768 282 aa16.06■□□□□ 0.16
CAPNS1-214ENST00000592483 G0S2P27469 103 aa16.06■□□□□ 0.16
CAPNS1-214ENST00000592483 Q0VG73 95 aa16.06■□□□□ 0.16
CAPNS1-214ENST00000592483 FA2HQ7L5A8 372 aa16.06■□□□□ 0.16
CAPNS1-214ENST00000592483 TMEM18Q96B42 140 aa16.06■□□□□ 0.16
CAPNS1-214ENST00000592483 CHCHD5Q9BSY4 110 aa16.06■□□□□ 0.16
CAPNS1-214ENST00000592483 SMAGPQ0VAQ4 97 aa16.05■□□□□ 0.16
CAPNS1-214ENST00000592483 MYCBP2O75592 4640 aa16.04■□□□□ 0.16
CAPNS1-214ENST00000592483 C1orf196B1AJZ1 125 aa16.04■□□□□ 0.16
CAPNS1-214ENST00000592483 UBE2L6O14933 153 aa16.04■□□□□ 0.16
CAPNS1-214ENST00000592483 SIVA1O15304 175 aa16.04■□□□□ 0.16
CAPNS1-214ENST00000592483 LAGE3Q14657 143 aa16.04■□□□□ 0.16
CAPNS1-214ENST00000592483 K7EP13 123 aa16.03■□□□□ 0.16
CAPNS1-214ENST00000592483 DNAH10OSP0CZ25 163 aa16.03■□□□□ 0.16
CAPNS1-214ENST00000592483 SPATA12Q7Z6I5 190 aa16.03■□□□□ 0.16
CAPNS1-214ENST00000592483 NIT1Q86X76 327 aa16.03■□□□□ 0.16
CAPNS1-214ENST00000592483 C6orf223Q8N319 242 aa16.03■□□□□ 0.16
CAPNS1-214ENST00000592483 AP5S1Q9NUS5 200 aa16.03■□□□□ 0.16
CAPNS1-214ENST00000592483 LINC01549A6NIU2 74 aa16.02■□□□□ 0.16
CAPNS1-214ENST00000592483 LINC00614P0C842 121 aa16.02■□□□□ 0.16
CAPNS1-214ENST00000592483 LINC01556Q5JQF7 62 aa16.02■□□□□ 0.16
CAPNS1-214ENST00000592483 WFDC10BQ8IUB3 73 aa16.02■□□□□ 0.16
CAPNS1-214ENST00000592483 BAGE3Q86Y29 109 aa16.01■□□□□ 0.15
CAPNS1-214ENST00000592483 C20orf203Q8NBC4 194 aa16.01■□□□□ 0.15
CAPNS1-214ENST00000592483 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
CAPNS1-214ENST00000592483 Q9H8V8 135 aa16.01■□□□□ 0.15
CAPNS1-214ENST00000592483 HIST1H2BKO60814 126 aa16■□□□□ 0.15
CAPNS1-214ENST00000592483 HIST1H2BJP06899 126 aa16■□□□□ 0.15
CAPNS1-214ENST00000592483 HIST1H2BOP23527 126 aa16■□□□□ 0.15
CAPNS1-214ENST00000592483 HIST1H2BBP33778 126 aa16■□□□□ 0.15
CAPNS1-214ENST00000592483 HIST1H2BDP58876 126 aa16■□□□□ 0.15
CAPNS1-214ENST00000592483 HIST1H2BCP62807 126 aa16■□□□□ 0.15
CAPNS1-214ENST00000592483 HIST2H2BEQ16778 126 aa16■□□□□ 0.15
CAPNS1-214ENST00000592483 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
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