RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592408.5

EFTUD2-222, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 561 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-222ENST00000592408 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
EFTUD2-222ENST00000592408 CD28P10747 220 aa6.73□□□□□ -1.33
EFTUD2-222ENST00000592408 SMAGPQ0VAQ4 97 aa6.73□□□□□ -1.33
EFTUD2-222ENST00000592408 FHL3Q13643 280 aa6.73□□□□□ -1.33
EFTUD2-222ENST00000592408 RRN3P1Q2M238 152 aa6.73□□□□□ -1.33
EFTUD2-222ENST00000592408 C18orf65Q6ZTR6 163 aa6.73□□□□□ -1.33
EFTUD2-222ENST00000592408 STHQ8IWL8 128 aa6.73□□□□□ -1.33
EFTUD2-222ENST00000592408 SPANXA1Q9NS26 97 aa6.73□□□□□ -1.33
EFTUD2-222ENST00000592408 J3QQQ9 107 aa6.72□□□□□ -1.33
EFTUD2-222ENST00000592408 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
EFTUD2-222ENST00000592408 RBMY1CP0DJD4 496 aa6.72□□□□□ -1.33
EFTUD2-222ENST00000592408 HTN1P15515 57 aa6.72□□□□□ -1.33
EFTUD2-222ENST00000592408 RBX1P62877 108 aa6.72□□□□□ -1.33
EFTUD2-222ENST00000592408 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
EFTUD2-222ENST00000592408 RNF151Q2KHN1 245 aa6.72□□□□□ -1.33
EFTUD2-222ENST00000592408 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
EFTUD2-222ENST00000592408 VPS25Q9BRG1 176 aa6.72□□□□□ -1.33
EFTUD2-222ENST00000592408 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
EFTUD2-222ENST00000592408 NOTCH2Q04721 2471 aa6.71□□□□□ -1.33
EFTUD2-222ENST00000592408 MUC4Q99102 2169 aa6.71□□□□□ -1.33
EFTUD2-222ENST00000592408 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa6.71□□□□□ -1.34
EFTUD2-222ENST00000592408 TMEM223A0PJW6 202 aa6.71□□□□□ -1.34
EFTUD2-222ENST00000592408 BEAN1Q3B7T3 259 aa6.71□□□□□ -1.34
EFTUD2-222ENST00000592408 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
EFTUD2-222ENST00000592408 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
EFTUD2-222ENST00000592408 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
EFTUD2-222ENST00000592408 NAV2Q8IVL1 2488 aa6.7□□□□□ -1.34
EFTUD2-222ENST00000592408 A0A0J9YY99 117 aa6.7□□□□□ -1.34
EFTUD2-222ENST00000592408 TMEM238C9JI98 176 aa6.7□□□□□ -1.34
EFTUD2-222ENST00000592408 F8W1H4 67 aa6.7□□□□□ -1.34
EFTUD2-222ENST00000592408 J3QR89 54 aa6.7□□□□□ -1.34
EFTUD2-222ENST00000592408 CCL24O00175 119 aa6.7□□□□□ -1.34
EFTUD2-222ENST00000592408 RS1O15537 224 aa6.7□□□□□ -1.34
EFTUD2-222ENST00000592408 IGHV3-53P01767 116 aa6.7□□□□□ -1.34
EFTUD2-222ENST00000592408 COTL1Q14019 142 aa6.7□□□□□ -1.34
EFTUD2-222ENST00000592408 CFAP126Q5VTH2 177 aa6.7□□□□□ -1.34
EFTUD2-222ENST00000592408 C11orf72Q8NBR9 251 aa6.7□□□□□ -1.34
EFTUD2-222ENST00000592408 WFDC11Q8NEX6 87 aa6.7□□□□□ -1.34
EFTUD2-222ENST00000592408 C16orf95Q9H693 158 aa6.7□□□□□ -1.34
EFTUD2-222ENST00000592408 CREBBPQ92793 2442 aa6.7□□□□□ -1.34
EFTUD2-222ENST00000592408 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
EFTUD2-222ENST00000592408 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa6.69□□□□□ -1.34
EFTUD2-222ENST00000592408 P0DMU3 169 aa6.69□□□□□ -1.34
EFTUD2-222ENST00000592408 FAM231AP0DMU4 169 aa6.69□□□□□ -1.34
EFTUD2-222ENST00000592408 FAM231CP0DMU5 169 aa6.69□□□□□ -1.34
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
EFTUD2-222ENST00000592408 EMP1P54849 157 aa6.69□□□□□ -1.34
EFTUD2-222ENST00000592408 ODF3L2Q3SX64 289 aa6.69□□□□□ -1.34
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC25A29Q8N8R3 303 aa6.69□□□□□ -1.34
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNRF2Q8NHG8 242 aa6.69□□□□□ -1.34
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
EFTUD2-222ENST00000592408 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa6.68□□□□□ -1.34
EFTUD2-222ENST00000592408 UBE2D1P51668 147 aa6.68□□□□□ -1.34
EFTUD2-222ENST00000592408 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
EFTUD2-222ENST00000592408 RPL24P83731 157 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
EFTUD2-222ENST00000592408 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
EFTUD2-222ENST00000592408 AMELXQ99217 191 aa6.68□□□□□ -1.34
EFTUD2-222ENST00000592408 FAM110AQ9BQ89 295 aa6.68□□□□□ -1.34
EFTUD2-222ENST00000592408 TIMM21Q9BVV7 248 aa6.68□□□□□ -1.34
EFTUD2-222ENST00000592408 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa6.68□□□□□ -1.34
EFTUD2-222ENST00000592408 YAE1D1Q9NRH1 226 aa6.68□□□□□ -1.34
EFTUD2-222ENST00000592408 SPG11Q96JI7 2443 aa6.68□□□□□ -1.34
EFTUD2-222ENST00000592408 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
EFTUD2-222ENST00000592408 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa6.67□□□□□ -1.34
EFTUD2-222ENST00000592408 A0A1W2PRX2 142 aa6.67□□□□□ -1.34
EFTUD2-222ENST00000592408 CIDEAO60543 219 aa6.67□□□□□ -1.34
EFTUD2-222ENST00000592408 TSPEAR-AS2P59090 65 aa6.67□□□□□ -1.34
EFTUD2-222ENST00000592408 IL17DQ8TAD2 202 aa6.67□□□□□ -1.34
EFTUD2-222ENST00000592408 FAM30AQ9NZY2 134 aa6.67□□□□□ -1.34
EFTUD2-222ENST00000592408 A0A0J9YXV3 536 aa6.66□□□□□ -1.34
EFTUD2-222ENST00000592408 NDUFA7O95182 113 aa6.66□□□□□ -1.34
EFTUD2-222ENST00000592408 IGHV3-30P01768 117 aa6.66□□□□□ -1.34
EFTUD2-222ENST00000592408 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa6.66□□□□□ -1.34
EFTUD2-222ENST00000592408 AZU1P20160 251 aa6.66□□□□□ -1.34
EFTUD2-222ENST00000592408 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
EFTUD2-222ENST00000592408 GAGE13Q4V321 117 aa6.66□□□□□ -1.34
EFTUD2-222ENST00000592408 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa6.66□□□□□ -1.34
EFTUD2-222ENST00000592408 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
EFTUD2-222ENST00000592408 C16orf74Q96GX8 76 aa6.66□□□□□ -1.34
EFTUD2-222ENST00000592408 CHCHD7Q9BUK0 85 aa6.66□□□□□ -1.34
EFTUD2-222ENST00000592408 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
EFTUD2-222ENST00000592408 XCL2Q9UBD3 114 aa6.66□□□□□ -1.34
EFTUD2-222ENST00000592408 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa6.66□□□□□ -1.34
EFTUD2-222ENST00000592408 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
EFTUD2-222ENST00000592408 CSPG4Q6UVK1 2322 aa6.65□□□□□ -1.34
EFTUD2-222ENST00000592408 COL12A1Q99715 3063 aa6.65□□□□□ -1.34
EFTUD2-222ENST00000592408 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa6.65□□□□□ -1.34
EFTUD2-222ENST00000592408 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa6.65□□□□□ -1.34
EFTUD2-222ENST00000592408 TRAV4A0A0B4J268 109 aa6.65□□□□□ -1.34
EFTUD2-222ENST00000592408 A0A0B4J2C4 111 aa6.65□□□□□ -1.34
EFTUD2-222ENST00000592408 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa6.65□□□□□ -1.34
EFTUD2-222ENST00000592408 G3V4G9 280 aa6.65□□□□□ -1.34
EFTUD2-222ENST00000592408 K7EQD1 137 aa6.65□□□□□ -1.34
EFTUD2-222ENST00000592408 SAP30O75446 220 aa6.65□□□□□ -1.34
EFTUD2-222ENST00000592408 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
EFTUD2-222ENST00000592408 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa6.65□□□□□ -1.34
EFTUD2-222ENST00000592408 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
EFTUD2-222ENST00000592408 NDUFA11Q86Y39 141 aa6.65□□□□□ -1.34
EFTUD2-222ENST00000592408 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
EFTUD2-222ENST00000592408 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 128.2 ms