RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588672.1

LDLRAD4-AS1-201, LDLRAD4 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LDLRAD4-AS1, Length 2,190 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 IGHV3-53P01767 116 aa9.81□□□□□ -0.84
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa9.81□□□□□ -0.84
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 RAB37Q96AX2 223 aa9.81□□□□□ -0.84
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 H3BRM9 83 aa9.81□□□□□ -0.84
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 Q6ZTI0 123 aa9.81□□□□□ -0.84
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 NDUFA11Q86Y39 141 aa9.81□□□□□ -0.84
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 FAM104AQ969W3 186 aa9.81□□□□□ -0.84
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 TMEM170BQ5T4T1 132 aa9.8□□□□□ -0.84
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 ZNF479Q96JC4 524 aa9.8□□□□□ -0.84
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 PF4P02776 101 aa9.8□□□□□ -0.84
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 CEND1Q8N111 149 aa9.8□□□□□ -0.84
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 SPATA3Q8NHX4 192 aa9.8□□□□□ -0.84
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 CHCHD7Q9BUK0 85 aa9.8□□□□□ -0.84
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa9.79□□□□□ -0.84
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 OR4C5Q8NGB2 326 aa9.79□□□□□ -0.84
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 PLEKHB2Q96CS7 222 aa9.79□□□□□ -0.84
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 NOTCH3Q9UM47 2321 aa9.79□□□□□ -0.84
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 C9orf118A6NHY6 69 aa9.78□□□□□ -0.84
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 ZNF815PA8K554 130 aa9.78□□□□□ -0.84
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 K7ERJ3 54 aa9.78□□□□□ -0.84
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 TSPEAR-AS2P59090 65 aa9.78□□□□□ -0.84
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 LINC00482Q8N8I6 264 aa9.78□□□□□ -0.84
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 FAM110AQ9BQ89 295 aa9.78□□□□□ -0.84
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 HIST1H4GQ99525 98 aa9.78□□□□□ -0.84
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 TM2D2Q9BX73 214 aa9.78□□□□□ -0.84
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 A0A0J9YXV3 536 aa9.77□□□□□ -0.85
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 PLAC8L1A1L4L8 177 aa9.77□□□□□ -0.85
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 H3BUT2 72 aa9.77□□□□□ -0.85
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 NFE4Q86UQ8 179 aa9.77□□□□□ -0.85
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa9.77□□□□□ -0.85
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 VCX2Q9H322 139 aa9.77□□□□□ -0.85
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa9.77□□□□□ -0.85
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 HERVK_113P61574 105 aa9.77□□□□□ -0.85
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 DNAJC30Q96LL9 226 aa9.77□□□□□ -0.85
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 SMIM13P0DJ93 91 aa9.76□□□□□ -0.85
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa9.76□□□□□ -0.85
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 FN1P02751 2386 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa9.75□□□□□ -0.85
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa9.75□□□□□ -0.85
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 COTL1Q14019 142 aa9.75□□□□□ -0.85
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 TAL2Q16559 108 aa9.75□□□□□ -0.85
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 AMELXQ99217 191 aa9.75□□□□□ -0.85
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 C2CD3Q4AC94 2353 aa9.75□□□□□ -0.85
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 SCGB1D4Q6XE38 83 aa9.74□□□□□ -0.85
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 TRAV4A0A0B4J268 109 aa9.74□□□□□ -0.85
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 TMEM223A0PJW6 202 aa9.74□□□□□ -0.85
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 GAGE12BA1L429 117 aa9.74□□□□□ -0.85
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 GAGE7O76087 117 aa9.74□□□□□ -0.85
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 GAGE12FP0CL80 117 aa9.74□□□□□ -0.85
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 GAGE12GP0CL81 117 aa9.74□□□□□ -0.85
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 GAGE12IP0CL82 117 aa9.74□□□□□ -0.85
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 C16orf74Q96GX8 76 aa9.74□□□□□ -0.85
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 Q6ZUT4 128 aa9.73□□□□□ -0.85
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 SLC25A29Q8N8R3 303 aa9.73□□□□□ -0.85
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 K7EQD1 137 aa9.73□□□□□ -0.85
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 J3QQQ9 107 aa9.72□□□□□ -0.85
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 RRN3P1Q2M238 152 aa9.72□□□□□ -0.85
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa9.72□□□□□ -0.85
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 GAGE12JA6NER3 117 aa9.71□□□□□ -0.85
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 GAGE4Q13068 117 aa9.71□□□□□ -0.85
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 GAGE5Q13069 117 aa9.71□□□□□ -0.85
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 GAGE13Q4V321 117 aa9.71□□□□□ -0.85
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 SPANXA1Q9NS26 97 aa9.71□□□□□ -0.85
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.85
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 TRGV2A0A075B6R0 118 aa9.71□□□□□ -0.86
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 A0A0J9YY99 117 aa9.71□□□□□ -0.86
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 A0A1W2PPM0 123 aa9.71□□□□□ -0.86
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 C12orf74Q32Q52 190 aa9.71□□□□□ -0.86
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 GAGE10A6NGK3 116 aa9.7□□□□□ -0.86
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 SAMD5Q5TGI4 173 aa9.7□□□□□ -0.86
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa9.7□□□□□ -0.86
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 SVIPQ8NHG7 77 aa9.7□□□□□ -0.86
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 HIVEP1P15822 2718 aa9.7□□□□□ -0.86
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa9.7□□□□□ -0.86
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 LEPROTO15243 131 aa9.7□□□□□ -0.86
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 LINC00694P0DN24 101 aa9.69□□□□□ -0.86
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 CRYBA4P53673 196 aa9.69□□□□□ -0.86
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 UBE2D3P61077 147 aa9.69□□□□□ -0.86
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 UBE2D2P62837 147 aa9.69□□□□□ -0.86
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP9.69□□□□□ -0.86
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 OVOL2Q9BRP0 275 aa9.69□□□□□ -0.86
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa9.68□□□□□ -0.86
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 K7EP34 96 aa9.68□□□□□ -0.86
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 CRLF1O75462 422 aa9.68□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.1 ms