RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580713.1

TOP3A-210, Transcript of DNA topoisomerase III alpha, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3A, Length 474 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3A-210ENST00000580713 A0A087WWL8 130 aa7.27□□□□□ -1.25
TOP3A-210ENST00000580713 A0A096LPF7 62 aa7.27□□□□□ -1.25
TOP3A-210ENST00000580713 C1orf196B1AJZ1 125 aa7.27□□□□□ -1.25
TOP3A-210ENST00000580713 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa7.27□□□□□ -1.25
TOP3A-210ENST00000580713 MGPP08493 103 aa7.27□□□□□ -1.25
TOP3A-210ENST00000580713 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
TOP3A-210ENST00000580713 FAM74A4Q5TZK3 123 aa7.27□□□□□ -1.25
TOP3A-210ENST00000580713 AMN1Q8IY45 258 aa7.27□□□□□ -1.25
TOP3A-210ENST00000580713 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa7.27□□□□□ -1.25
TOP3A-210ENST00000580713 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa7.27□□□□□ -1.25
TOP3A-210ENST00000580713 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa7.26□□□□□ -1.25
TOP3A-210ENST00000580713 RS1O15537 224 aa7.26□□□□□ -1.25
TOP3A-210ENST00000580713 CRYGDP07320 174 aa7.26□□□□□ -1.25
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TOP3A-210ENST00000580713 KIAA1644Q3SXP7 199 aa7.26□□□□□ -1.25
TOP3A-210ENST00000580713 CFAP126Q5VTH2 177 aa7.26□□□□□ -1.25
TOP3A-210ENST00000580713 OR4C5Q8NGB2 326 aa7.26□□□□□ -1.25
TOP3A-210ENST00000580713 RNF185Q96GF1 192 aa7.26□□□□□ -1.25
TOP3A-210ENST00000580713 SAMD10Q9BYL1 202 aa7.26□□□□□ -1.25
TOP3A-210ENST00000580713 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa7.26□□□□□ -1.25
TOP3A-210ENST00000580713 TRGV2A0A075B6R0 118 aa7.25□□□□□ -1.25
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TOP3A-210ENST00000580713 RHODO00212 210 aa7.25□□□□□ -1.25
TOP3A-210ENST00000580713 PHOX2AO14813 284 aa7.25□□□□□ -1.25
TOP3A-210ENST00000580713 ZNF56Q15929 161 aa7.25□□□□□ -1.25
TOP3A-210ENST00000580713 LINC00612Q8N6U2 182 aa7.25□□□□□ -1.25
TOP3A-210ENST00000580713 FAM30AQ9NZY2 134 aa7.25□□□□□ -1.25
TOP3A-210ENST00000580713 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
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TOP3A-210ENST00000580713 UFSP1Q6NVU6 142 aa7.24□□□□□ -1.25
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TOP3A-210ENST00000580713 ORMDL3Q8N138 153 aa7.24□□□□□ -1.25
TOP3A-210ENST00000580713 MRAP2Q96G30 205 aa7.24□□□□□ -1.25
TOP3A-210ENST00000580713 VSIG2Q96IQ7 327 aa7.24□□□□□ -1.25
TOP3A-210ENST00000580713 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa7.23□□□□□ -1.25
TOP3A-210ENST00000580713 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa7.23□□□□□ -1.25
TOP3A-210ENST00000580713 SMKR1H3BMG3 65 aa7.23□□□□□ -1.25
TOP3A-210ENST00000580713 PSCAO43653 123 aa7.23□□□□□ -1.25
TOP3A-210ENST00000580713 CIDEAO60543 219 aa7.23□□□□□ -1.25
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TOP3A-210ENST00000580713 IGHV3-53P01767 116 aa7.23□□□□□ -1.25
TOP3A-210ENST00000580713 PPBPP02775 128 aa7.23□□□□□ -1.25
TOP3A-210ENST00000580713 SRIP30626 198 aa7.23□□□□□ -1.25
TOP3A-210ENST00000580713 SUMO4Q6EEV6 95 aa7.23□□□□□ -1.25
TOP3A-210ENST00000580713 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
TOP3A-210ENST00000580713 ZNF479Q96JC4 524 aa7.23□□□□□ -1.25
TOP3A-210ENST00000580713 PRELID3AQ96N28 172 aa7.23□□□□□ -1.25
TOP3A-210ENST00000580713 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
TOP3A-210ENST00000580713 ICOSQ9Y6W8 199 aa7.23□□□□□ -1.25
TOP3A-210ENST00000580713 HIST1H2BKO60814 126 aa7.22□□□□□ -1.25
TOP3A-210ENST00000580713 OXTP01178 125 aa7.22□□□□□ -1.25
TOP3A-210ENST00000580713 HIST1H2BJP06899 126 aa7.22□□□□□ -1.25
TOP3A-210ENST00000580713 HIST1H2BOP23527 126 aa7.22□□□□□ -1.25
TOP3A-210ENST00000580713 HIST1H2BBP33778 126 aa7.22□□□□□ -1.25
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TOP3A-210ENST00000580713 HIST1H2BCP62807 126 aa7.22□□□□□ -1.25
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TOP3A-210ENST00000580713 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
TOP3A-210ENST00000580713 HIST1H2BHQ93079 126 aa7.22□□□□□ -1.25
TOP3A-210ENST00000580713 HIST1H2BNQ99877 126 aa7.22□□□□□ -1.25
TOP3A-210ENST00000580713 HIST1H2BMQ99879 126 aa7.22□□□□□ -1.25
TOP3A-210ENST00000580713 H7C1H1 209 aa7.21□□□□□ -1.26
TOP3A-210ENST00000580713 GAS8-AS1O95177 125 aa7.21□□□□□ -1.26
TOP3A-210ENST00000580713 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
TOP3A-210ENST00000580713 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa7.21□□□□□ -1.26
TOP3A-210ENST00000580713 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa7.2□□□□□ -1.26
TOP3A-210ENST00000580713 M0QY20 66 aa7.2□□□□□ -1.26
TOP3A-210ENST00000580713 TNFRSF6BO95407 300 aa7.2□□□□□ -1.26
TOP3A-210ENST00000580713 PPP1R17O96001 155 aa7.2□□□□□ -1.26
TOP3A-210ENST00000580713 NPYP01303 97 aa7.2□□□□□ -1.26
TOP3A-210ENST00000580713 OR10J3Q5JRS4 329 aa7.2□□□□□ -1.26
TOP3A-210ENST00000580713 LYPD5Q6UWN5 251 aa7.2□□□□□ -1.26
TOP3A-210ENST00000580713 NRACQ8N912 160 aa7.2□□□□□ -1.26
TOP3A-210ENST00000580713 C18orf32Q8TCD1 76 aa7.2□□□□□ -1.26
TOP3A-210ENST00000580713 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
TOP3A-210ENST00000580713 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
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TOP3A-210ENST00000580713 Q0VG73 95 aa7.19□□□□□ -1.26
TOP3A-210ENST00000580713 FHL2Q14192 279 aa7.19□□□□□ -1.26
TOP3A-210ENST00000580713 MAP1LC3AQ9H492 121 aa7.19□□□□□ -1.26
TOP3A-210ENST00000580713 K7EP13 123 aa7.18□□□□□ -1.26
TOP3A-210ENST00000580713 NDUFA6P56556 154 aa7.18□□□□□ -1.26
TOP3A-210ENST00000580713 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
TOP3A-210ENST00000580713 IQCJQ1A5X6 159 aa7.18□□□□□ -1.26
TOP3A-210ENST00000580713 BAGE3Q86Y29 109 aa7.18□□□□□ -1.26
TOP3A-210ENST00000580713 WFDC10BQ8IUB3 73 aa7.18□□□□□ -1.26
TOP3A-210ENST00000580713 Q8N814 137 aa7.18□□□□□ -1.26
TOP3A-210ENST00000580713 SLC25A29Q8N8R3 303 aa7.18□□□□□ -1.26
TOP3A-210ENST00000580713 C20orf78Q9BR46 151 aa7.18□□□□□ -1.26
TOP3A-210ENST00000580713 ST20Q9HBF5 79 aa7.18□□□□□ -1.26
TOP3A-210ENST00000580713 NIT2Q9NQR4 276 aa7.18□□□□□ -1.26
TOP3A-210ENST00000580713 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa7.17□□□□□ -1.26
TOP3A-210ENST00000580713 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa7.17□□□□□ -1.26
TOP3A-210ENST00000580713 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa7.17□□□□□ -1.26
TOP3A-210ENST00000580713 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa7.17□□□□□ -1.26
TOP3A-210ENST00000580713 LRCOL1A6NCL2 159 aa7.17□□□□□ -1.26
TOP3A-210ENST00000580713 S100A6P06703 90 aa7.17□□□□□ -1.26
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