RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578334.5

TSPOAP1-AS1-202, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 956 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 GFRA4Q9GZZ7 299 aa18.13■□□□□ 0.49
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 C9orf62Q8N4C0 152 aa18.12■□□□□ 0.49
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 NUDT10Q8NFP7 164 aa18.12■□□□□ 0.49
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 NUDT11Q96G61 164 aa18.12■□□□□ 0.49
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CTRLP40313 264 aa18.11■□□□□ 0.49
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 AMTP48728 403 aa18.11■□□□□ 0.49
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 COTL1Q14019 142 aa18.11■□□□□ 0.49
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TWIST1Q15672 202 aa18.1■□□□□ 0.49
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa18.1■□□□□ 0.49
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 AP5S1Q9NUS5 200 aa18.09■□□□□ 0.49
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TCTE3Q8IZS6 198 aa18.04■□□□□ 0.48
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa18.03■□□□□ 0.48
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP17.95■□□□□ 0.46
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PLAC8Q9NZF1 115 aa17.87■□□□□ 0.45
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 BTF3L4Q96K17 158 aa17.86■□□□□ 0.45
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PHOX2AO14813 284 aa17.84■□□□□ 0.45
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 MAJINQ3KP22 176 aa17.84■□□□□ 0.45
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CT83Q5H943 113 aa17.84■□□□□ 0.45
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 OR5A1Q8NGJ0 315 aa17.84■□□□□ 0.45
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 C7orf33Q8WU49 177 aa17.84■□□□□ 0.45
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 FAM231BA6NCW3 169 aa17.83■□□□□ 0.44
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 FOXI1Q12951 378 aa17.83■□□□□ 0.44
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 GAS8-AS1O95177 125 aa17.82■□□□□ 0.44
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 MT1HL1P0DM35 61 aa17.82■□□□□ 0.44
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 XCL1P47992 114 aa17.82■□□□□ 0.44
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 AKAP14Q86UN6 197 aa17.82■□□□□ 0.44
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ST20Q9HBF5 79 aa17.82■□□□□ 0.44
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TMEM242Q9NWH2 141 aa17.81■□□□□ 0.44
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TSHBP01222 138 aa17.8■□□□□ 0.44
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 LYPD6BQ8NI32 183 aa17.8■□□□□ 0.44
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 MRAP2Q96G30 205 aa17.8■□□□□ 0.44
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CCL25O15444 150 aa17.79■□□□□ 0.44
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ESDP10768 282 aa17.79■□□□□ 0.44
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SMIM7Q9BQ49 75 aa17.79■□□□□ 0.44
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa17.78■□□□□ 0.44
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 A0A1B0GUT8 65 aa17.78■□□□□ 0.44
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